uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Fluorescent CRISPR Adaptation Reporter for rapid quantification of spacer acquisition
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Mikrobiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Mikrobiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Mikrobiologi.
Vise andre og tillknytning
2017 (engelsk)Inngår i: Scientific Reports, ISSN 2045-2322, E-ISSN 2045-2322, Vol. 7, artikkel-id 10392Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

CRISPR-Cas systems are adaptive prokaryotic immune systems protecting against horizontally transferred DNA or RNA such as viruses and other mobile genetic elements. Memory of past invaders is stored as spacers in CRISPR loci in a process called adaptation. Here we developed a novel assay where spacer integration results in fluorescence, enabling detection of memory formation in single cells and quantification of as few as 0.05% cells with expanded CRISPR arrays in a bacterial population. Using this fluorescent CRISPR Adaptation Reporter (f-CAR), we quantified adaptation of the two CRISPR arrays of the type I-E CRISPR-Cas system in Escherichia coli, and confirmed that more integration events are targeted to CRISPR-II than to CRISPR-I. The f-CAR conveniently analyzes and compares many samples, allowing new insights into adaptation. For instance, we show that in an E. coli culture the majority of acquisition events occur in late exponential phase.

sted, utgiver, år, opplag, sider
2017. Vol. 7, artikkel-id 10392
Emneord [en]
quorum sensing controls, escherichia-coli, cas adaptation, immune-system, host factor, dna, resistance, elements, repeats, bacteriophage
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-334399DOI: 10.1038/s41598-017-10876-zISI: 000408997700091OAI: oai:DiVA.org:uu-334399DiVA, id: diva2:1163840
Tilgjengelig fra: 2017-12-08 Laget: 2017-12-08 Sist oppdatert: 2017-12-08bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

fulltext(3335 kB)117 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 3335 kBChecksum SHA-512
52ba9bbc59bd8310d1cf721364c7b92b0b086070ae1cf3ab11f354df9f17945033fdd890badc5f6c618ac8fd6976340bbc2ce9ef13bf621b3958cc3e53130909
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekst

Personposter BETA

Amlinger, LinaHoekzema, MirtheWagner, Gerhart E. H.Koskiniemi, SannaLundgren, Magnus

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Amlinger, LinaHoekzema, MirtheWagner, Gerhart E. H.Koskiniemi, SannaLundgren, Magnus
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
Scientific Reports

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 117 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
urn-nbn

Altmetric

doi
urn-nbn
Totalt: 314 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf