uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Dissecting features of epigenetic variants underlying cardiometabolic risk using full-resolution epigenome profiling in regulatory elements
McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 0C7, Canada;McGill Univ, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada;Genome Quebec Innovat Ctr, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada.
Karolinska Inst, Cardiovasc Med Unit, Dept Med Solna, S-17176 Stockholm, Sweden.
McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 0C7, Canada;McGill Univ, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada;Genome Quebec Innovat Ctr, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada.
McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 0C7, Canada;McGill Univ, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada;Genome Quebec Innovat Ctr, Montreal, PQ H3A 0G1, Canada;Childrens Mercy Hosp & Clin, Kansas City, MO 64108 USA.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 10, artikel-id 1209Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Sparse profiling of CpG methylation in blood by microarrays has identified epigenetic links to common diseases. Here we apply methylC-capture sequencing (MCC-Seq) in a clinical population of similar to 200 adipose tissue and matched blood samples (N-total similar to 400), providing high- resolution methylation profiling (>1.3 M CpGs) at regulatory elements. We link methylation to cardiometabolic risk through associations to circulating plasma lipid levels and identify lipid-associated CpGs with unique localization patterns in regulatory elements. We show distinct features of tissue-specific versus tissue-independent lipid-linked regulatory regions by contrasting with parallel assessments in similar to 800 independent adipose tissue and blood samples from the general population. We follow-up on adipose-specific regulatory regions under (1) genetic and (2) epigenetic (environmental) regulation via integrational studies. Overall, the comprehensive sequencing of regulatory element methylomes reveals a rich landscape of functional variants linked genetically as well as epigenetically to plasma lipid traits.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019. Vol. 10, artikel-id 1209
Nationell ämneskategori
Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-380447DOI: 10.1038/s41467-019-09184-zISI: 000461161500005PubMedID: 30872577OAI: oai:DiVA.org:uu-380447DiVA, id: diva2:1300162
Forskningsfinansiär
VetenskapsrådetEU, FP7, Sjunde ramprogrammetTillgänglig från: 2019-03-28 Skapad: 2019-03-28 Senast uppdaterad: 2019-03-28Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(978 kB)47 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 978 kBChecksumma SHA-512
df678780b48647dbb3c0a720465fc91711b0a8d3609d1d8feb75424b9acebf6aedad9ca9d8ce8c30b6940dfc0f5566d9b89102d1b218693d665b25d2f407f0be
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Rönnblom, Lars

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Rönnblom, Lars
Av organisationen
Reumatologi
I samma tidskrift
Nature Communications
Medicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 47 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 247 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf