uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The mechanism of error induction by the antibiotic viomycin provides insight into the fidelity mechanism of translation
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-4361-9554
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-3028-3270
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-7124-792X
2019 (Engelska)Ingår i: eLIFE, E-ISSN 2050-084X, Vol. 8, artikel-id e46124Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Applying pre-steady state kinetics to an Escherichia-coli-based reconstituted translation system, we have studied how the antibiotic viomycin affects the accuracy of genetic code reading. We find that viomycin binds to translating ribosomes associated with a ternary complex (TC) consisting of elongation factor Tu (EF-Tu), aminoacyl tRNA and GTP, and locks the otherwise dynamically flipping monitoring bases A1492 and A1493 into their active conformation. This effectively prevents dissociation of near- and non-cognate TCs from the ribosome, thereby enhancing errors in initial selection. Moreover, viomycin shuts down proofreading-based error correction. Our results imply a mechanism in which the accuracy of initial selection is achieved by larger backward rate constants toward TC dissociation rather than by a smaller rate constant for GTP hydrolysis for near- and non-cognate TCs. Additionally, our results demonstrate that translocation inhibition, rather than error induction, is the major cause of cell growth inhibition by viomycin.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
ELIFE SCIENCES PUBLICATIONS LTD , 2019. Vol. 8, artikel-id e46124
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-390687DOI: 10.7554/eLife.46124ISI: 000473013700001PubMedID: 31172942OAI: oai:DiVA.org:uu-390687DiVA, id: diva2:1342894
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2018-05498Vetenskapsrådet, 2016-06264Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, KAW 2011.0081Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, KAW 2017.0055Carl Tryggers stiftelse för vetenskaplig forskning , CTS 18: 338Wenner-Gren Stiftelserna, UPD2017-0238Tillgänglig från: 2019-08-14 Skapad: 2019-08-14 Senast uppdaterad: 2019-08-14Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1024 kB)78 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1024 kBChecksumma SHA-512
8a9284747715bf28db69badb8ce91c911edfd4ee5533ca716ff711a6185a312287baa289c224c630aa92f8ae77f5e72712e47a407c5606b9336929de51f9e80a
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Holm, MikaelMandava, Chandra SekharEhrenberg, MånsSanyal, Suparna

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Holm, MikaelMandava, Chandra SekharEhrenberg, MånsSanyal, Suparna
Av organisationen
Institutionen för cell- och molekylärbiologiMolekylärbiologi
I samma tidskrift
eLIFE
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 78 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 109 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf