Logotyp: till Uppsala universitets webbplats

uu.sePublikationer från Uppsala universitet
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Adaptive filtering for enhancement of the osteocyte cell network in 3D microtomography images
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för visuell information och interaktion. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Bildanalys och människa-datorinteraktion. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Visa övriga samt affilieringar
2013 (Engelska)Ingår i: IRBM, ISSN 1959-0318, Vol. 34, nr 1-SI, s. 48-52Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The osteocyte cell network in bone tissue is thought to orchestrate tissue adaptation and remodeling, thus holding responsibility for tissue quality. Previously, this structure has been studied mainly in 2D and its architecture and functions are not fully elucidated. The assessment of the osteocyte system is prerequisite for deeper understanding of bone remodeling and for advances in management of bone diseases. Our goal is to enable 3D isotropic imaging of bone at cellular level and to develop algorithms for quantitative image analysis of the cell network. We recently demonstrated accurate 3D imaging of this cell structure with synchrotron radiation tomography at submicrometric scale. Due to the limited spatial resolution of the imaging system and the constraints in terms of radiation dose, the images suffer from low signal to noise ratio and the detection of the cell dendrites is challenging. Here we detail a method for enhancement of the osteocyte network in human bone from 3D microtomography images. The approach combines Hessian-based 3D line enhancement and bilateral filtering. Our method enables extraction of the interconnected cells from noisy images, preserving the integrity of the cells and of their slender dendrites. Qualitative and quantitative results are presented. 

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2013. Vol. 34, nr 1-SI, s. 48-52
Nationell ämneskategori
Naturvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-200125DOI: 10.1016/j.irbm.2012.12.013ISI: 000317530700015OAI: oai:DiVA.org:uu-200125DiVA, id: diva2:622399
Tillgänglig från: 2013-05-21 Skapad: 2013-05-20 Senast uppdaterad: 2013-05-21Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Person

Pacureanu, Alexandra

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Pacureanu, Alexandra
Av organisationen
Avdelningen för visuell information och interaktionBildanalys och människa-datorinteraktionScience for Life Laboratory, SciLifeLab
Naturvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 468 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf