uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
BioImg.org: A catalog of virtual machine images for the life sciences
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi.
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Bioinformatics and Biology Insights, ISSN 1177-9322, E-ISSN 1177-9322, Vol. 9, s. 125-128Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Virtualization is becoming increasingly important in bioscience, enabling assembly and provisioning of complete computer setups, including operating system, data, software, and services packaged as virtual machine images (VMIs). We present an open catalog of VMIs for the life sciences, where scientists can share information about images and optionally upload them to a server equipped with a large file system and fast Internet connection. Other scientists can then search for and download images that can be run on the local computer or in a cloud computing environment, providing easy access to bioinformatics environments. We also describe applications where VMIs aid life science research, including distributing tools and data, supporting reproducible analysis, and facilitating education.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 9, s. 125-128
Nyckelord [en]
catalogue; virtual machine image; virtual appliance; container; software repository; cloud computing
Nationell ämneskategori
Bioinformatik (beräkningsbiologi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-262376DOI: 10.4137/BBI.S28636ISI: 000365108200001PubMedID: 26401099OAI: oai:DiVA.org:uu-262376DiVA, id: diva2:853736
Forskningsfinansiär
Science for Life Laboratory - a national resource center for high-throughput molecular bioscienceeSSENCE - An eScience CollaborationEU, FP7, Sjunde ramprogrammet, Bm1006EU, FP7, Sjunde ramprogrammet, allBioSwedish National Infrastructure for Computing (SNIC)Tillgänglig från: 2015-09-10 Skapad: 2015-09-14 Senast uppdaterad: 2018-01-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Dahlö, MartinHaziza, FrédéricSpjuth, Ola

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Dahlö, MartinHaziza, FrédéricSpjuth, Ola
Av organisationen
Institutionen för informationsteknologiScience for Life Laboratory, SciLifeLabInstitutionen för farmaceutisk biovetenskap
I samma tidskrift
Bioinformatics and Biology Insights
Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 812 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf