Logotyp: till Uppsala universitets webbplats

uu.sePublikationer från Uppsala universitet
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The Dynamics of Incomplete Lineage Sorting across the Ancient Adaptive Radiation of Neoavian Birds
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Evolutionsbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Evolutionsbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Evolutionsbiologi.ORCID-id: 0000-0002-5035-1736
2015 (Engelska)Ingår i: PLoS biology, ISSN 1544-9173, E-ISSN 1545-7885, Vol. 13, nr 8, artikel-id e1002224Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The diversification of neoavian birds is one of the most rapid adaptive radiations of extant organisms. Recent whole-genome sequence analyses have much improved the resolution of the neoavian radiation and suggest concurrence with the Cretaceous-Paleogene (K-Pg) boundary, yet the causes of the remaining genome-level irresolvabilities appear unclear. Here we show that genome-level analyses of 2,118 retrotransposon presence/absence markers converge at a largely consistent Neoaves phylogeny and detect a highly differential temporal prevalence of incomplete lineage sorting (ILS), i.e., the persistence of ancestral genetic variation as polymorphisms during speciation events. We found that ILS-derived incongruences are spread over the genome and involve 35% and 34% of the analyzed loci on the autosomes and the Z chromosome, respectively. Surprisingly, Neoaves diversification comprises three adaptive radiations, an initial near-K-Pg super-radiation with highly discordant phylogenetic signals from near-simultaneous speciation events, followed by two post-K-Pg radiations of core landbirds and core waterbirds with much less pronounced ILS. We provide evidence that, given the extreme level of up to 100% ILS per branch in super-radiations, particularly rapid speciation events may neither resemble a fully bifurcating tree nor are they resolvable as such. As a consequence, their complex demographic history is more accurately represented as local networks within a species tree.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 13, nr 8, artikel-id e1002224
Nationell ämneskategori
Evolutionsbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-263534DOI: 10.1371/journal.pbio.1002224ISI: 000360618400012OAI: oai:DiVA.org:uu-263534DiVA, id: diva2:858861
Forskningsfinansiär
EU, Europeiska forskningsrådetVetenskapsrådet, 2007-8731 2010-5650Knut och Alice Wallenbergs StiftelseTillgänglig från: 2015-10-05 Skapad: 2015-10-02 Senast uppdaterad: 2018-02-22Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(3046 kB)487 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 3046 kBChecksumma SHA-512
ff5c336bf62ab45f6a15e19d7252fc5b3e6503f1a973f6929602124da5945b18194030ae7e15c0f968c66737ab1d3e55cb81d955e16eb5b5006d75c9e6125f6b
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Person

Suh, AlexanderSmeds, LinneaEllegren, Hans

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Suh, AlexanderSmeds, LinneaEllegren, Hans
Av organisationen
Evolutionsbiologi
I samma tidskrift
PLoS biology
Evolutionsbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 487 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 755 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf