Logotyp: till Uppsala universitets webbplats

uu.sePublikationer från Uppsala universitet
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Transcriptomics resources of human tissues and organs
KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Dept Prote, Stockholm, Sweden.;Tech Univ Denmark, Novo Nordisk Fdn, Ctr Biosustainabil, Horsholm, Denmark..
KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Dept Prote, Stockholm, Sweden..
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi.
KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.;Chalmers, Dept Biol & Biol Engn, S-41296 Gothenburg, Sweden..
Visa övriga samt affilieringar
2016 (Engelska)Ingår i: Molecular Systems Biology, ISSN 1744-4292, E-ISSN 1744-4292, Vol. 12, nr 4, artikel-id 862Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat) Published
Resurstyp
Text
Abstract [en]

Quantifying the differential expression of genes in various human organs, tissues, and cell types is vital to understand human physiology and disease. Recently, several large-scale transcriptomics studies have analyzed the expression of protein-coding genes across tissues. These datasets provide a framework for defining the molecular constituents of the human body as well as for generating comprehensive lists of proteins expressed across tissues or in a tissue-restricted manner. Here, we review publicly available human transcriptome resources and discuss body-wide data from independent genome-wide transcriptome analyses of different tissues. Gene expression measurements from these independent datasets, generated using samples from fresh frozen surgical specimens and postmortem tissues, are consistent. Overall, the different genome-wide analyses support a distribution in which many proteins are found in all tissues and relatively few in a tissue-restricted manner. Moreover, we discuss the applications of publicly available omics data for building genome-scale metabolic models, used for analyzing cell and tissue functions both in physiological and in disease contexts.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 12, nr 4, artikel-id 862
Nyckelord [en]
genome-scale metabolic models, proteomics, transcriptomics
Nationell ämneskategori
Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-299282DOI: 10.15252/msb.20155865ISI: 000374497500001PubMedID: 27044256OAI: oai:DiVA.org:uu-299282DiVA, id: diva2:949189
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs StiftelseTillgänglig från: 2016-07-18 Skapad: 2016-07-18 Senast uppdaterad: 2017-11-28Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1210 kB)310 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1210 kBChecksumma SHA-512
44240d365721d5d5d9d4ceb3c81553e06f21f8e5e0a06f46d39f27daf559d4b2a16fa8b390269b32616196904378342f48530facc16718242dee5ec46aabfa93
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Lindskog Bergström, CeciliaPontén, Fredrik

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Lindskog Bergström, CeciliaPontén, Fredrik
Av organisationen
Institutionen för immunologi, genetik och patologi
I samma tidskrift
Molecular Systems Biology
Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 310 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 405 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf