uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Statistical power considerations in genotype-based recall randomized controlled trials
Lund Univ, Dept Clin Sci, Genet & Mol Epidemiol Unit, SE-20502 Malmo, Sweden..
Lund Univ, Dept Astron & Theoret Phys, Computat Biol & Biol Phys Unit, Lund, Sweden..
Lund Univ, Dept Clin Sci, Genet & Mol Epidemiol Unit, SE-20502 Malmo, Sweden..
Lund Univ, Dept Clin Sci, Genet & Mol Epidemiol Unit, SE-20502 Malmo, Sweden..
Visa övriga samt affilieringar
2016 (Engelska)Ingår i: Scientific Reports, ISSN 2045-2322, E-ISSN 2045-2322, Vol. 6, artikel-id 37307Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Randomized controlled trials (RCT) are often underpowered for validating gene-treatment interactions. Using published data from the Diabetes Prevention Program (DPP), we examined power in conventional and genotype-based recall (GBR) trials. We calculated sample size and statistical power for genemetformin interactions (vs. placebo) using incidence rates, gene-drug interaction effect estimates and allele frequencies reported in the DPP for the rs8065082 SLC47A1 variant, a metformin transported encoding locus. We then calculated statistical power for interactions between genetic risk scores (GRS), metformin treatment and intensive lifestyle intervention (ILI) given a range of sampling frames, clinical trial sample sizes, interaction effect estimates, and allele frequencies; outcomes were type 2 diabetes incidence (time-to-event) and change in small LDL particles (continuous outcome). Thereafter, we compared two recruitment frameworks: GBR (participants recruited from the extremes of a GRS distribution) and conventional sampling (participants recruited without explicit emphasis on genetic characteristics). We further examined the influence of outcome measurement error on statistical power. Under most simulated scenarios, GBR trials have substantially higher power to observe gene-drug and gene-lifestyle interactions than same-sized conventional RCTs. GBR trials are becoming popular for validation of gene-treatment interactions; our analyses illustrate the strengths and weaknesses of this design.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 6, artikel-id 37307
Nationell ämneskategori
Endokrinologi och diabetes
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-311186DOI: 10.1038/srep37307ISI: 000388480300001PubMedID: 27886175OAI: oai:DiVA.org:uu-311186DiVA, id: diva2:1059260
Forskningsfinansiär
EU, Europeiska forskningsrådet, CoG-2015_681742_NASCENT IMI_JU_2010_DIRECTVetenskapsrådetHjärt-LungfondenDiabetesförbundetNovo NordiskTillgänglig från: 2016-12-22 Skapad: 2016-12-22 Senast uppdaterad: 2017-11-29Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1399 kB)92 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1399 kBChecksumma SHA-512
48ef27a4bdd37221b7d32fb70f4afea9ee6e864983f5e96bae1a99161467dddf3ac517cec12977a66e16d84734bdb84bbb33c150a5da5386ece616adce2c678f
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Ingelsson, Erik

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Ingelsson, Erik
Av organisationen
Molekylär epidemiologi
I samma tidskrift
Scientific Reports
Endokrinologi och diabetes

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 92 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 518 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf