uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Sequence-specific validation of LAMP amplicons in real-time optomagnetic detection of Dengue serotype 2 synthetic DNA
Technical University of Denmark.
BluSense Diagnostics, Copenhagen, Denmark.
Technical University of Denmark.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Fasta tillståndets fysik.ORCID-id: 0000-0002-5249-4415
Visa övriga samt affilieringar
2017 (Engelska)Ingår i: The Analyst, ISSN 0003-2654, E-ISSN 1364-5528, Vol. 142, nr 18, s. 3441-3450Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We report on an optomagnetic technique optimised for real-time molecular detection of Dengue fever virus under ideal as well as non-ideal laboratory conditions using two different detection approaches. The first approach is based on the detection of the hydrodynamic volume of streptavidin coated magnetic nanoparticles attached to biotinylated LAMP amplicons. We demonstrate detection of sub-femtomolar Dengue DNA target concentrations in the ideal contamination-free lab environment within 20 min. The second detection approach is based on sequence-specific binding of functionalised magnetic nanoparticles to loops of LAMP amplicons. Melting studies reveal that true positive and spurious amplicons have different melting points and this allows us to discriminate between them. This is found to be in a good agreement with subsequent studies on real-time sequence-specific discrimination of LAMP amplicons. The specific binding causes clustering of magnetic nanoparticles via binding to multiple sites (loops) emerging in the elongation phase of LAMP. Formation of nanoclusters is monitored via the depletion of the optomagnetic signal due to free nanoparticles. After sequence-specific validation, we claim detection of down to 100 fM of Dengue target after 20 min of LAMP with a contamination background.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2017. Vol. 142, nr 18, s. 3441-3450
Nationell ämneskategori
Teknik och teknologier
Forskningsämne
Teknisk fysik med inriktning mot fasta tillståndets fysik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-330184DOI: 10.1039/c7an01023kISI: 000409919200018PubMedID: 28828442OAI: oai:DiVA.org:uu-330184DiVA, id: diva2:1144902
Forskningsfinansiär
Forskningsrådet Formas, 221-2012-444EU, FP7, Sjunde ramprogrammet, NanoMag (#604448)Tillgänglig från: 2017-09-27 Skapad: 2017-09-27 Senast uppdaterad: 2019-04-24

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Tian, BoStrömberg, Mattias

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Tian, BoStrömberg, Mattias
Av organisationen
Fasta tillståndets fysik
I samma tidskrift
The Analyst
Teknik och teknologier

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 136 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf