uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Kinetics of dCas9 target search in Escherichia coli
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär systembiologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär systembiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Mikrobiologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär systembiologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Vise andre og tillknytning
2017 (engelsk)Inngår i: Science, ISSN 0036-8075, E-ISSN 1095-9203, Vol. 357, nr 6358, s. 1420-1423Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

How fast can a cell locate a specific chromosomal DNA sequence specified by a single-stranded oligonucleotide? To address this question, we investigate the intracellular search processes of the Cas9 protein, which can be programmed by a guide RNA to bind essentially any DNA sequence. This targeting flexibility requires Cas9 to unwind the DNA double helix to test for correct base pairing to the guide RNA. Here we study the search mechanisms of the catalytically inactive Cas9 (dCas9) in living Escherichia coli by combining single-molecule fluorescence microscopy and bulk restriction-protection assays. We find that it takes a single fluorescently labeled dCas9 6 hours to find the correct target sequence, which implies that each potential target is bound for less than 30 milliseconds. Once bound, dCas9 remains associated until replication. To achieve fast targeting, both Cas9 and its guide RNA have to be present at high concentrations.

sted, utgiver, år, opplag, sider
AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE , 2017. Vol. 357, nr 6358, s. 1420-1423
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-337092DOI: 10.1126/science.aah7084ISI: 000411880800052PubMedID: 28963258OAI: oai:DiVA.org:uu-337092DiVA, id: diva2:1177689
Forskningsfinansiär
EU, European Research CouncilSwedish Research CouncilKnut and Alice Wallenberg FoundationTilgjengelig fra: 2018-01-25 Laget: 2018-01-25 Sist oppdatert: 2018-01-25bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

Fulltekst mangler i DiVA

Andre lenker

Forlagets fulltekstPubMed

Personposter BETA

Jones, DanielLeroy, PruneUnoson, CeciliaFange, DavidCuric, VladimirLawson, Michael J.Elf, Johan

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Jones, DanielLeroy, PruneUnoson, CeciliaFange, DavidCuric, VladimirLawson, Michael J.Elf, Johan
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
Science

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetric

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 90 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf