uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Increased Conformational Flexibility of a Macrocycle-Receptor Complex Contributes to Reduced Dissociation Rates
Max Planck Gesell, Chem Genom Ctr, Otto Hahn Str 15, D-44227 Dortmund, Germany..
Max Planck Inst Colloids & Interfaces, Dept Biomol Syst, Muhlenberg 1, D-14424 Potsdam, Germany.;Free Univ Berlin, Dept Biol Chem & Pharm, Takustr 3, D-14195 Berlin, Germany..ORCID-id: 0000-0002-8665-5512
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi. Max Planck Gesell, Chem Genom Ctr, Otto Hahn Str 15, D-44227 Dortmund, Germany..
Max Planck Inst Colloids & Interfaces, Dept Biomol Syst, Muhlenberg 1, D-14424 Potsdam, Germany.;Free Univ Berlin, Dept Biol Chem & Pharm, Takustr 3, D-14195 Berlin, Germany..
Visa övriga samt affilieringar
2017 (Engelska)Ingår i: Chemistry - A European Journal, ISSN 0947-6539, E-ISSN 1521-3765, Vol. 23, nr 64, s. 16157-16161Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Constraining a peptide in its bioactive conformation by macrocyclization represents a powerful strategy to design modulators of challenging biomolecular targets. This holds particularly true for the development of inhibitors of protein-protein interactions which often involve interfaces lacking defined binding pockets. Such flat surfaces are demanding targets for traditional small molecules rendering macrocyclic peptides promising scaffolds for novel therapeutics. However, the contribution of peptide dynamics to binding kinetics is barely understood which impedes the design process. Herein, we report unexpected trends in the binding kinetics of two closely related macrocyclic peptides that bind their receptor protein with high affinity. Isothermal titration calorimetry, F-19 NMR experiments and molecular dynamics simulations reveal that increased conformational flexibility of the macrocycle-receptor complex reduces dissociation rates and contributes to complex stability. This observation has impact on macrocycle design strategies that have so far mainly focused on the stabilization of bioactive ligand conformations.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
John Wiley & Sons, 2017. Vol. 23, nr 64, s. 16157-16161
Nyckelord [en]
F-19 NMR spectroscopy, binding kinetics, cyclic peptides, molecular dynamics simulation, peptidomimetics
Nationell ämneskategori
Kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-339695DOI: 10.1002/chem.201702776ISI: 000417968100004PubMedID: 28777495OAI: oai:DiVA.org:uu-339695DiVA, id: diva2:1177846
Tillgänglig från: 2018-01-26 Skapad: 2018-01-26 Senast uppdaterad: 2018-01-26Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1081 kB)45 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1081 kBChecksumma SHA-512
8afb33340cf4094087b501040c0ad71bcef0858ac3a811c5b9cb0e85825783fa626db134888f065416dd6ce4cc41652c904f0518c70cae293136942ec98d796d
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Krüger, Dennis M.

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Wamhoff, Eike-ChristianKrüger, Dennis M.Grossmann, Tom N.
Av organisationen
Struktur- och molekylärbiologi
I samma tidskrift
Chemistry - A European Journal
Kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 45 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 73 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf