uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
Vise andre og tillknytning
2018 (engelsk)Inngår i: F1000Research, ISSN 2046-1402, Vol. 7, artikkel-id ELIXIR-148Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

As a part of the ELIXIR-EXCELERATE efforts in capacity building, we present here 10 steps to facilitate researchers getting started in genome assembly and genome annotation. The guidelines given are broadly applicable, intended to be stable over time, and cover all aspects from start to finish of a general assembly and annotation project. Intrinsic properties of genomes are discussed, as is the importance of using high quality DNA. Different sequencing technologies and generally applicable workflows for genome assembly are also detailed. We cover structural and functional annotation and encourage readers to also annotate transposable elements, something that is often omitted from annotation workflows. The importance of data management is stressed, and we give advice on where to submit data and how to make your results Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable (FAIR).

sted, utgiver, år, opplag, sider
2018. Vol. 7, artikkel-id ELIXIR-148
Emneord [en]
Annotation, Assembly, DNA, FAIR, Genome, NGS, Workflows
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-366980DOI: 10.12688/f1000research.13598.1PubMedID: 29568489OAI: oai:DiVA.org:uu-366980DiVA, id: diva2:1266129
Tilgjengelig fra: 2018-11-27 Laget: 2018-11-27 Sist oppdatert: 2019-02-20bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

fulltext(2310 kB)70 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 2310 kBChecksum SHA-512
232d87bc9de00cfc5baab4cd5a2092c5427ec62c810f03be2374bbdc7eec9bc6316242d130e353e1d16f1a338017fcbf07a85a26e03f0e4e2805cb244e9222cc
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekstPubMed

Personposter BETA

Vinnere, OlgaSoler, LucileLantz, Henrik

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Vinnere, OlgaSoler, LucileLantz, Henrik
Av organisasjonen

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 70 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetric

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 81 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf