uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
RNA-Sequencing Analysis of Adrenocortical Carcinoma, Pheochromocytoma and Paraganglioma from a Pan-Cancer Perspective
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Endokrin tumörbiologi. Eunice Kennedy Shriver Natl Inst Child Hlth & Hum, Sect Med Neuroendocrinol, NIH, 10 Ctr Dr,Bldg 10,Room 1E-3140, Bethesda, MD 20892 USA.ORCID-id: 0000-0003-0677-4894
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Experimentell kirurgi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Onkologisk endokrinologi.
Aix Marseille Univ, Dept Nucl Med, La Timone Univ Hosp, European Ctr Res Med Imaging, F-13385 Marseille, France.
Visa övriga samt affilieringar
2018 (Engelska)Ingår i: Cancers, ISSN 2072-6694, Vol. 10, nr 12, artikel-id 518Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Adrenocortical carcinoma (ACC) and pheochromocytoma and paraganglioma (PPGL) are defined by clinicopathological criteria and can be further sub-divided based on different molecular features. Whether differences between these molecular subgroups are significant enough to re-challenge their current clinicopathological classification is currently unknown. It is also not fully understood to which other cancers ACC and PPGL show similarity to. To address these questions, we included recent RNA-Seq data from the Cancer Genome Atlas (TCGA) and Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) datasets. Two bioinformatics pipelines were used for unsupervised clustering and principal components analysis. Results were validated using consensus clustering model and interpreted according to previous pan-cancer experiments. Two datasets consisting of 3319 tumors from 35 disease categories were studied. Consistent with the current classification, ACCs clustered as a homogenous group in a pan-cancer context. It also clustered close to neural crest derived tumors, including gliomas, neuroblastomas, pancreatic neuroendocrine tumors, and PPGLs. Contrary, some PPGLs mixed with pancreatic neuroendocrine tumors or neuroblastomas. Thus, our unbiased gene-expression analysis of PPGL did not overlap with their current clinicopathological classification. These results emphasize some importances of the shared embryological origin of these tumors, all either related or close to neural crest tumors, and opens for investigation of a complementary categorization based on gene-expression features.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
MDPI , 2018. Vol. 10, nr 12, artikel-id 518
Nyckelord [en]
pheochromocytoma, paraganglioma, adrenocortical carcinoma, adrenal tumor, pan-cancer analysis, neural crest, neuroendocrine
Nationell ämneskategori
Cancer och onkologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-375237DOI: 10.3390/cancers10120518ISI: 000455199200056PubMedID: 30558313OAI: oai:DiVA.org:uu-375237DiVA, id: diva2:1283321
Tillgänglig från: 2019-01-29 Skapad: 2019-01-29 Senast uppdaterad: 2019-01-29Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2379 kB)53 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2379 kBChecksumma SHA-512
82c5592fda0a1b3c1df5ad0447269c46a74d0a87b6a5763b3f3027cf979e242fb629634c5022212e382018c066adf8d1e1ec53451721fccaf5066677529b38d5
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Crona, JoakimBackman, SamuelWelin, StaffanHellman, PerStålberg, PeterSkogseid, Britt

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Crona, JoakimBackman, SamuelWelin, StaffanHellman, PerStålberg, PeterSkogseid, Britt
Av organisationen
Endokrin tumörbiologiExperimentell kirurgiOnkologisk endokrinologiEndokrinkirurgi
I samma tidskrift
Cancers
Cancer och onkologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 53 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 199 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf