uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Pandemrix-induced narcolepsy is associated with genes related to immunity and neuronal survival
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk farmakogenomik och osteoporos. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.ORCID-id: 0000-0003-3465-3280
Division of Child and Adolescent Psychiatry, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, centrumbildningar mm, Uppsala kliniska forskningscentrum (UCR). Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk farmakogenomik och osteoporos. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.ORCID-id: 0000-0002-2152-4343
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk farmakogenomik och osteoporos. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: EBioMedicine, E-ISSN 2352-3964, Vol. 40, s. 595-604Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

BACKGROUND: The incidence of narcolepsy rose sharply after the swine influenza A (H1N1) vaccination campaign with Pandemrix. Narcolepsy is an immune-related disorder with excessive daytime sleepiness. The most frequent form is strongly associated with HLA-DQB1*06:02, but only a minority of carriers develop narcolepsy. We aimed to identify genetic markers that predispose to Pandemrix-induced narcolepsy.

METHODS: We tested for genome-wide and candidate gene associations in 42 narcolepsy cases and 4981 controls. Genotyping was performed on Illumina arrays, HLA alleles were imputed using SNP2HLA, and single nucleotide polymorphisms were imputed using the haplotype reference consortium panel. The genome-wide significance threshold was p < 5 × 10-8, and the nominal threshold was p < 0.05. Results were replicated in 32 cases and 7125 controls. Chromatin data was used for functional annotation.

FINDINGS: Carrying HLA-DQB1*06:02 was significantly associated with narcolepsy, odds ratio (OR) 39.4 [95% confidence interval (CI) 11.3, 137], p = 7.9 × 10-9. After adjustment for HLA, GDNF-AS1 (rs62360233) was significantly associated, OR = 8.7 [95% CI 4.2, 17.5], p = 2.6 × 10-9, and this was replicated, OR = 3.4 [95% CI 1.2-9.6], p = 0.022. Functional analysis revealed variants in high LD with rs62360233 that might explain the detected association. The candidate immune-gene locus TRAJ (rs1154155) was nominally associated in both the discovery and replication cohorts, meta-analysis OR = 2.0 [95% CI 1.4, 2.8], p = 0.0002.

INTERPRETATION: We found a novel association between Pandemrix-induced narcolepsy and the non-coding RNA gene GDNF-AS1, which has been shown to regulate expression of the essential neurotrophic factor GDNF. Changes in regulation of GDNF have been associated with neurodegenerative diseases. This finding may increase the understanding of disease mechanisms underlying narcolepsy. Associations between Pandemrix-induced narcolepsy and immune-related genes were replicated.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019. Vol. 40, s. 595-604
Nyckelord [en]
(MeSH), Autoimmune diseases, Drug-related side effects and adverse reactions, Genetic variation, Genome-wide association study, Glial cell line-derived neurotrophic factor, H1N1 subtype, Influenza A virus, Influenza vaccines, Narcolepsy, Pharmacogenetics, RNA, long noncoding
Nationell ämneskategori
Neurologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-377169DOI: 10.1016/j.ebiom.2019.01.041ISI: 000460696900067PubMedID: 30711515OAI: oai:DiVA.org:uu-377169DiVA, id: diva2:1288998
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 521-2011-2440Vetenskapsrådet, 521-2014-3370Vetenskapsrådet, 2018-03307Hjärt-Lungfonden, 20120557Hjärt-Lungfonden, 20140291Hjärt-Lungfonden, 20170711Erik, Karin och Gösta Selanders stiftelseThuréus stiftelse för främjande av geriatrisk forskningVetenskapsrådet, 2017-00641Tillgänglig från: 2019-02-15 Skapad: 2019-02-15 Senast uppdaterad: 2019-05-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1244 kB)86 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1244 kBChecksumma SHA-512
983fda2c8a7b65e50951bac1a0931bd6ef1275111586ebbd80439a730e23f4709774d29fb041448e719b374ae90749b80591ad639d0dde7712f1bc4a7d71c9e0
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Hallberg, PärEriksson, NiclasKohnke, HugoDaniilidou, MakrinaCavalli, MarcoWadelius, ClaesLandtblom, Anne-MarieWadelius, Mia

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Hallberg, PärEriksson, NiclasKohnke, HugoDaniilidou, MakrinaCavalli, MarcoWadelius, ClaesLandtblom, Anne-MarieWadelius, Mia
Av organisationen
Klinisk farmakogenomik och osteoporosScience for Life Laboratory, SciLifeLabUppsala kliniska forskningscentrum (UCR)NeurologiMedicinsk genetik och genomik
I samma tidskrift
EBioMedicine
Neurologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 86 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 166 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf