uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Cryptic genetic variation shapes the adaptive evolutionary potential of enzymes
Univ British Columbia, Michael Smith Lab, Vancouver, BC, Canada.
Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT, Australia.
Univ British Columbia, Michael Smith Lab, Vancouver, BC, Canada.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: eLIFE, E-ISSN 2050-084X, Vol. 8, artikel-id e40789Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Genetic variation among orthologous proteins can cause cryptic phenotypic properties that only manifest in changing environments. Such variation may impact the evolvability of proteins, but the underlying molecular basis remains unclear. Here, we performed comparative directed evolution of four orthologous metallo-beta-lactamases toward a new function and found that different starting genotypes evolved to distinct evolutionary outcomes. Despite a low initial fitness, one ortholog reached a significantly higher fitness plateau than its counterparts, via increasing catalytic activity. By contrast, the ortholog with the highest initial activity evolved to a less-optimal and phenotypically distinct outcome through changes in expression, oligomerization and activity. We show how cryptic molecular properties and conformational variation of active site residues in the initial genotypes cause epistasis, that could lead to distinct evolutionary outcomes. Our work highlights the importance of understanding the molecular details that connect genetic variation to protein function to improve the prediction of protein evolution.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
ELIFE SCIENCES PUBLICATIONS LTD , 2019. Vol. 8, artikel-id e40789
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-378387DOI: 10.7554/eLife.40789ISI: 000458485100001PubMedID: 30719972OAI: oai:DiVA.org:uu-378387DiVA, id: diva2:1293736
Tillgänglig från: 2019-03-05 Skapad: 2019-03-05 Senast uppdaterad: 2019-03-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1336 kB)62 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1336 kBChecksumma SHA-512
0cafc6e4902e0c0465690442a7bf87cfd85198f70f5a49d92b3f4b7caefc90811a7c04d43d380ded38635cbc6979b90a19afa3287ce2f0806ae7ab7f3bee2074
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Pabis, AnnaKamerlin, Shina C. Lynn

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Pabis, AnnaMiton, Charlotte M.Kamerlin, Shina C. Lynn
Av organisationen
Molekylär biofysikInstitutionen för cell- och molekylärbiologi
I samma tidskrift
eLIFE
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 62 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 137 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf