uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The mechanism of error induction by the antibiotic viomycin provides insight into the fidelity mechanism of translation
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-4361-9554
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-3028-3270
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylärbiologi.ORCID-id: 0000-0002-7124-792X
2019 (engelsk)Inngår i: eLIFE, E-ISSN 2050-084X, Vol. 8, artikkel-id e46124Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

Applying pre-steady state kinetics to an Escherichia-coli-based reconstituted translation system, we have studied how the antibiotic viomycin affects the accuracy of genetic code reading. We find that viomycin binds to translating ribosomes associated with a ternary complex (TC) consisting of elongation factor Tu (EF-Tu), aminoacyl tRNA and GTP, and locks the otherwise dynamically flipping monitoring bases A1492 and A1493 into their active conformation. This effectively prevents dissociation of near- and non-cognate TCs from the ribosome, thereby enhancing errors in initial selection. Moreover, viomycin shuts down proofreading-based error correction. Our results imply a mechanism in which the accuracy of initial selection is achieved by larger backward rate constants toward TC dissociation rather than by a smaller rate constant for GTP hydrolysis for near- and non-cognate TCs. Additionally, our results demonstrate that translocation inhibition, rather than error induction, is the major cause of cell growth inhibition by viomycin.

sted, utgiver, år, opplag, sider
ELIFE SCIENCES PUBLICATIONS LTD , 2019. Vol. 8, artikkel-id e46124
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-390687DOI: 10.7554/eLife.46124ISI: 000473013700001PubMedID: 31172942OAI: oai:DiVA.org:uu-390687DiVA, id: diva2:1342894
Forskningsfinansiär
Swedish Research Council, 2018-05498Swedish Research Council, 2016-06264Knut and Alice Wallenberg Foundation, KAW 2011.0081Knut and Alice Wallenberg Foundation, KAW 2017.0055Carl Tryggers foundation , CTS 18: 338Wenner-Gren Foundations, UPD2017-0238Tilgjengelig fra: 2019-08-14 Laget: 2019-08-14 Sist oppdatert: 2019-08-14bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

fulltekst(1024 kB)116 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 1024 kBChecksum SHA-512
8a9284747715bf28db69badb8ce91c911edfd4ee5533ca716ff711a6185a312287baa289c224c630aa92f8ae77f5e72712e47a407c5606b9336929de51f9e80a
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekstPubMed

Personposter BETA

Holm, MikaelMandava, Chandra SekharEhrenberg, MånsSanyal, Suparna

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Holm, MikaelMandava, Chandra SekharEhrenberg, MånsSanyal, Suparna
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
eLIFE

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 116 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetric

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 165 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf