uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Detailed Functional Characterization of a Waist-Hip Ratio Locus in 7p15.2 Defines an Enhancer Controlling Adipocyte Differentiation
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Stanford Univ, Dept Med, Div Cardiovasc Med, Sch Med, Stanford, CA 94305 USA.
Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper. German Canc Res Ctr, Heidelberg, Germany.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk diabetologi och metabolism. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: ISCIENCE, ISSN 2589-0042, Vol. 20, s. 42-59Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We combined CAGE sequencing in human adipocytes during differentiation with data from genome-wide association studies to identify an enhancer in the SNX10 locus on chromosome 7, presumably involved in body fat distribution. Using reporter assays and CRISPR-Cas9 gene editing in human cell lines, we characterized the role of the enhancer in adipogenesis. The enhancer was active during adipogenesis and responded strongly to insulin and isoprenaline. The allele associated with increased waist-hip ratio in human genetic studies was associated with higher enhancer activity. Mutations of the enhancer resulted in less adipocyte differentiation. RNA sequencing of cells with disrupted enhancer showed reduced expression of established adipocyte markers, such as ADIPOQ and LPL, and identified CHI3L1 on chromosome 1 as a potential gene involved in adipocyte differentiation. In conclusion, we identified and characterized an enhancer in the SNX10 locus and outlined its plausible mechanisms of action and downstream targets.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019. Vol. 20, s. 42-59
Nationell ämneskategori
Cell- och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-397133DOI: 10.1016/j.isci.2019.09.006ISI: 000493388000004PubMedID: 31557715OAI: oai:DiVA.org:uu-397133DiVA, id: diva2:1374013
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 2015-02907Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, 2013.0126NIH (National Institute of Health), R01DK106236EXODIAB - Excellence of Diabetes Research in SwedenTillgänglig från: 2019-11-28 Skapad: 2019-11-28 Senast uppdaterad: 2019-11-28Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(11425 kB)31 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 11425 kBChecksumma SHA-512
3934e256438280d95dc478f72fd9c854174bc77b262e4accd1e8ad62067a30283a846521faf6ecf60444fad55e6bfed870d482a1f24d099027ed202d483506ed
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Castillejo-Lopez, CasimiroHetty, SusanneWadelius, ClaesIngelsson, Erik

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Castillejo-Lopez, CasimiroHetty, SusanneWadelius, ClaesIngelsson, Erik
Av organisationen
Medicinsk genetik och genomikScience for Life Laboratory, SciLifeLabInstitutionen för medicinska vetenskaperKlinisk diabetologi och metabolismMolekylär epidemiologi
Cell- och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 31 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 132 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf