uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Meta-transcriptomic identification of hepatitis B virus in cerebrospinal fluid in patients with central nervous system disease
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi.ORCID-id: 0000-0001-6665-7492
UVE Aix Marseille Univ, Inserm 1207, IRD 190, IHU Mediterranee Infect,Unite Virus Emergents, Marseille, France.
Mahosot Hosp, Lao Oxford Mahosot Hosp, Microbiol Lab, Wellcome Trust Res Unit LOMWRU, Viangchan, Laos;Univ Hlth Sci, IRED, Viangchan, Laos;Univ Oxford, Ctr Trop Med & Global Hlth, Churchill Hosp, Nuffield Dept Med, Oxford, England.
Mahosot Hosp, Lao Oxford Mahosot Hosp, Microbiol Lab, Wellcome Trust Res Unit LOMWRU, Viangchan, Laos.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease, ISSN 0732-8893, E-ISSN 1879-0070, Vol. 95, nr 4, artikel-id UNSP 114878Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Determining the etiological basis of central nervous system (CNS) infections is inherently challenging, primarily due to the multi-etiological nature. Using RNA sequencing, we aimed to identify microbes present in cerebrospinal fluid (CSF) of two patients suffering CNS infection, previously diagnosed with Cryptococcus sp. and Streptococcus pneumoniae infection, respectively. After meta-transcriptomic analysis, and confirmation with real-time PCR, hepatitis B virus (HBV) was detected in the CSF of two patients diagnosed with CNS syndrome. Phylogenetic analysis of the partial HBV genomes from these patients showed that they belonged to genotypes B and C and clustered with other viruses of Asian origin. In countries with high levels of HBV endemicity, the virus is likely to be found in patients diagnosed with CNS infections, although whether it contributes to symptoms and pathology, or is simply a coincidental infection, is unknown and merits further investigation. (C) 2019 The Authors. Published by Elsevier Inc.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
ELSEVIER SCIENCE INC , 2019. Vol. 95, nr 4, artikel-id UNSP 114878
Nyckelord [en]
Hepatitis B virus, RNA sequencing, Meta-transcriptomics, Cerebrospinal fluid, Encephalitis
Nationell ämneskategori
Infektionsmedicin
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-400049DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2019.114878ISI: 000498755300010PubMedID: 31451314OAI: oai:DiVA.org:uu-400049DiVA, id: diva2:1380091
Forskningsfinansiär
Forskningsrådet Formas, 2015-710EU, Horisont 2020, 653316Tillgänglig från: 2019-12-18 Skapad: 2019-12-18 Senast uppdaterad: 2019-12-18Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(240 kB)16 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 240 kBChecksumma SHA-512
639d63e6f53a7886c68ba49faefeb87d026a198e519dfcb5c3687f70821f69c09dcdfe5ebd1873142dec96feb63dfcbf88db364f9d589be4a904ed8b94d3529c
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Pettersson, John

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Pettersson, John
Av organisationen
Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
I samma tidskrift
Diagnostic microbiology and infectious disease
Infektionsmedicin

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 16 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 18 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf