uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Novel genes in cell cycle control and lipid metabolism with dynamically regulated binding sites for sterol regulatory element-binding protein 1 and RNA polymerase II in HepG2 cells detected by chromatin immunoprecipitation with microarray detection
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för genetik och patologi. (Wadelius)
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Centrum för bioinformatik. (Komorowski)
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, centrumbildningar mm, Ludwiginstitutet för cancerforskning. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi. (Ericsson)
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Centrum för bioinformatik. (Komorowski)
Visa övriga samt affilieringar
2009 (Engelska)Ingår i: The FEBS Journal, ISSN 1742-464X, E-ISSN 1742-4658, Vol. 276, nr 7, s. 1878-1890Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Sterol regulatory element-binding proteins 1 and 2 (SREBP-1 and SREBP-2) are important regulators of genes involved in cholesterol and fatty acid metabolism, but have also been implicated in the regulation of the cell cycle and have been associated with the pathogenesis of type 2 diabetes, atherosclerosis and obesity, among others. In this study, we aimed to characterize the binding sites of SREBP-1 and RNA polymerase II through chromatin immunoprecipitation and microarray analysis in 1% of the human genome, as defined by the Encyclopaedia of DNA Elements consortium, in a hepatocellular carcinoma cell line (HepG2). Our data identified novel binding sites for SREBP-1 in genes directly or indirectly involved in cholesterol metabolism, e.g. apolipoprotein C-III (APOC3). The most interesting biological findings were the binding sites for SREBP-1 in genes for host cell factor C1 (HCFC1), involved in cell cycle regulation, and for filamin A (FLNA). For RNA polymerase II, we found binding sites at classical promoters, but also in intergenic and intragenic regions. Furthermore, we found evidence of sterol-regulated binding of SREBP-1 and RNA polymerase II to HCFC1 and FLNA. From the results of this work, we infer that SREBP-1 may be involved in processes other than lipid metabolism.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2009. Vol. 276, nr 7, s. 1878-1890
Nyckelord [en]
HCFC1, human, intragenic binding, sterolregulated, transcriptional regulation
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-99754DOI: 10.1111/j.1742-4658.2009.06914.xISI: 000264021900008PubMedID: 19292868OAI: oai:DiVA.org:uu-99754DiVA, id: diva2:208741
Tillgänglig från: 2009-03-19 Skapad: 2009-03-19 Senast uppdaterad: 2017-12-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Enroth, StefanPunga, TanelWadelius, Claes

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Enroth, StefanPunga, TanelWadelius, Claes
Av organisationen
Institutionen för genetik och patologiCentrum för bioinformatikLudwiginstitutet för cancerforskningInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
I samma tidskrift
The FEBS Journal
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 1068 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf