uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Dried reagents for multiplex genotyping by tag-array minisequencing to be used in microfluidic devices
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
Visa övriga samt affilieringar
2010 (Engelska)Ingår i: The Analyst, ISSN 0003-2654, E-ISSN 1364-5528, Vol. 135, nr 9, s. 2377-2385Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We present an optimized procedure for freeze-drying and storing reagents for multiplex PCR followed by genotyping using a tag-array minisequencing assay with four color fluorescence detection which is suitable for microfluidic assay formats. A test panel was established for five cancer mutations in three codons (175, 248 and 273) of the tumor protein gene (TP53) and for 13 common single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the TP53 gene. The activity of DNA polymerase was preserved for six months of storage after freeze-drying, and the half-life of activities of exonuclease I and shrimp alkaline phosphatase were estimated to 55 and 200 days, respectively. We conducted a systematic genotyping comparison using freeze-dried and liquid reagents. The accuracy of successful genotyping was 99.1% using freeze-dried reagents compared to liquid reagents. As a proof of concept, the genotyping protocol was carried out with freeze-dried reagents stored in reaction chambers fabricated by micromilling in a cyclic olefin copolymer substrate. The results reported in this study are a key step towards the development of an integrated microfluidic device for point-of-care DNA-based diagnostics.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2010. Vol. 135, nr 9, s. 2377-2385
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-129216DOI: 10.1039/c0an00321bISI: 000281007300027PubMedID: 20668755OAI: oai:DiVA.org:uu-129216DiVA, id: diva2:337880
Tillgänglig från: 2010-08-09 Skapad: 2010-08-09 Senast uppdaterad: 2017-12-12Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Syvänen, Ann-Christine

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Syvänen, Ann-Christine
Av organisationen
Molekylär medicin
I samma tidskrift
The Analyst
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 526 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf