uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Clustering of DNA sequence reads from repeat regions using defined nucleotide positions (DNPs)
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
2010 (Engelska)Studentarbete övrigt, 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [en]

Sequencing genomes with a high frequency of repeat regions is a difficult task.The aim of the project was to develop an algorithm to speed up the sequencing process of highly repetitive genome. By using specific differences between the repeats called defined nucleotide positions (DNPs), cluster DNA sequence reads into contigs. The strategy used in the development of the algorithm resulted in a quite complex algorithm. Test runs of the algorithm showed that there is still work to be done to get a desirable result.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2010. , s. 45
Nyckelord [en]
DNP, repeat regions, SolidClusters, algorithm
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-137220OAI: oai:DiVA.org:uu-137220DiVA, id: diva2:377934
Uppsök
teknik
Tillgänglig från: 2011-03-04 Skapad: 2010-12-15 Senast uppdaterad: 2011-03-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Av organisationen
Institutionen för biologisk grundutbildning

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 378 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf