uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
RNAs actively cycle on the Sm-like protein Hfq
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
Visa övriga samt affilieringar
2010 (Engelska)Ingår i: Genes & Development, ISSN 0890-9369, E-ISSN 1549-5477, Vol. 24, nr 23, s. 2621-2626Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Hfq, a protein required for small RNA (sRNA)-mediated regulation in bacteria, binds RNA with low-nanomolar K-d values and long half-lives of complexes (>100 min). This cannot be reconciled with the 1-2-min response time of regulation in vivo. We show that RNAs displace each other on Hfq on a short time scale by RNA concentration-driven (active) cycling. Already at submicromolar concentrations of competitor RNA, half-lives of RNA-Hfq complexes are approximate to 1 min. We propose that competitor RNA associates transiently with RNA-Hfq complexes, RNAs exchange binding sites, and one of the RNAs eventually dissociates. This solves the "strong binding-high turn-over" paradox and permits efficient use of the Hfq pool.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2010. Vol. 24, nr 23, s. 2621-2626
Nyckelord [en]
Hfq, sRNA, antisense RNA, post-transcriptional regulation, RNA chaperone, Lsm protein
Nationell ämneskategori
Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-139405DOI: 10.1101/gad.591310ISI: 000284835800006PubMedID: 21123649OAI: oai:DiVA.org:uu-139405DiVA, id: diva2:381289
Tillgänglig från: 2010-12-27 Skapad: 2010-12-23 Senast uppdaterad: 2017-12-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Elf, JohanWagner, Gerhart E. H.

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Elf, JohanWagner, Gerhart E. H.
Av organisationen
Institutionen för cell- och molekylärbiologiScience for Life Laboratory, SciLifeLab
I samma tidskrift
Genes & Development
Biologiska vetenskaper

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 424 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf