Logotyp: till Uppsala universitets webbplats

uu.sePublikationer från Uppsala universitet
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Mechanistic studies of electrophilic protease inhibitors of full length hepatic C virus (HCV) NS3
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för biokemi och organisk kemi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi. (ORGFARM)
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi. (ORGFARM)
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för biokemi och organisk kemi.
2007 (Engelska)Ingår i: Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry (Print), ISSN 1475-6366, E-ISSN 1475-6374, Vol. 22, nr 2, s. 191-199Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The inhibition mechanism of electrophilic peptide-based protease inhibitors of full-length hepatitis C virus (HCV) NS3 has been investigated by determining the Ki-values for a series of compounds differing in the electrophilicity and acidity of the C-terminal residue at pH-values above and below the pKa of the catalytic histidine (6.85) and at two different ionic strengths. Electrophilic compounds with a pentafluoroethyl ketone group showed stronger inhibition at pH 8 than pH 6, as expected for a mechanism requiring an unprotonated catalytic histidine. However, the difference was only significant at high ionic strength. In contrast, electrophilic compounds with an acidic C-terminal group or a cyclic P1 residue showed a lower inhibitory effect at pH 8 than at pH 6, inconsistent with a mechanism-based inhibition. Moreover, all electrophilic compounds had an unexpectedly strong inhibition at pH 6, when mechanism-based inhibition is unlikely. The results suggest that for some of the electrophilic compounds the reactive group may not be properly positioned in the active site and that binding of these inhibitors is a result of non-covalent interactions. The nature of these interactions is discussed.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2007. Vol. 22, nr 2, s. 191-199
Nyckelord [en]
Hepatitis C virus, NS3 protease, serine protease, inhibition, electrophilic inhibitors
Nationell ämneskategori
Farmaceutiska vetenskaper
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-17090DOI: 10.1080/14756360601072916ISI: 000246325900009PubMedID: 17518346OAI: oai:DiVA.org:uu-17090DiVA, id: diva2:44861
Tillgänglig från: 2008-06-16 Skapad: 2008-06-16 Senast uppdaterad: 2018-01-12Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Sandström, AnjaÅkerblom, EvaDanielson, U. Helena

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Sandström, AnjaÅkerblom, EvaDanielson, U. Helena
Av organisationen
Institutionen för biokemi och organisk kemiAvdelningen för organisk farmaceutisk kemi
I samma tidskrift
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry (Print)
Farmaceutiska vetenskaper

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 894 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf