uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A strategy for identification of protein tyrosine phosphorylation
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Genomik.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC, Analytisk kemi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Genomik.
2012 (Engelska)Ingår i: Methods, ISSN 1046-2023, E-ISSN 1095-9130, Vol. 56, nr 2, s. 275-283Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

To develop methods for studying phosphorylation of protein tyrosine residues is an important task since this protein modification regulates many cellular functions and often is involved in oncogenesis. An optimal protocol includes enrichment of tyrosine phosphorylated (pTyr) peptides or proteins, followed by a high resolving analytical method for identification of the enriched components. In this Methods paper, we describe a working strategy on how immunoaffinity enrichments, using anti-pTyr antibodies, combined with mass spectrometric (MS) analysis can be used to study the pTyr proteome. We describe in detail how our procedure was used to characterize the pTyr proteome of K562 leukemia cells. Important questions concerning the use of different anti-pTyr antibodies, enrichments performed at the peptide and/or the protein level, pooling of enrichments and requirements for the MS characterization are discussed.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2012. Vol. 56, nr 2, s. 275-283
Nyckelord [en]
microdialysis, ultrafiltration, free fraction, ropivacaine, capillary liquid chromatography, PROTEIN-BINDING, MASS-SPECTROMETRY, BLOOD-PLASMA, PHARMACOKINETICS, BUPIVACAINE
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap Analytisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-163406DOI: 10.1016/j.ymeth.2011.09.021ISI: 000302105400023PubMedID: 21986561OAI: oai:DiVA.org:uu-163406DiVA, id: diva2:463813
Tillgänglig från: 2011-12-12 Skapad: 2011-12-12 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Bergström Lind, SaraArtemenko, Konstantin A.Pettersson, Ulf

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bergström Lind, SaraArtemenko, Konstantin A.Pettersson, Ulf
Av organisationen
GenomikAnalytisk kemi
I samma tidskrift
Methods
Medicin och hälsovetenskapAnalytisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 1274 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf