uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution
Vise andre og tillknytning
2013 (engelsk)Inngår i: Nature, ISSN 0028-0836, E-ISSN 1476-4687, Vol. 497, nr 7451, s. 579-584Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

Conifers have dominated forests for more than 200 million years and are of huge ecological and economic importance. Here we present the draft assembly of the 20-gigabase genome of Norway spruce (Picea abies), the first available for any gymnosperm. The number of well-supported genes (28,354) is similar to the >100 times smaller genome of Arabidopsis thaliana, and there is no evidence of a recent whole-genome duplication in the gymnosperm lineage. Instead, the large genome size seems to result from the slow and steady accumulation of a diverse set of long-terminal repeat transposable elements, possibly owing to the lack of an efficient elimination mechanism. Comparative sequencing of Pinus sylvestris, Abies sibirica, Juniperus communis, Taxus baccata and Gnetum gnemon reveals that the transposable element diversity is shared among extant conifers. Expression of 24-nucleotide small RNAs, previously implicated in transposable element silencing, is tissue-specific and much lower than in other plants. We further identify numerous long (>10,000 base pairs) introns, gene-like fragments, uncharacterized long non-coding RNAs and short RNAs. This opens up new genomic avenues for conifer forestry and breeding.

sted, utgiver, år, opplag, sider
2013. Vol. 497, nr 7451, s. 579-584
HSV kategori
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-203287DOI: 10.1038/nature12211ISI: 000319556100035OAI: oai:DiVA.org:uu-203287DiVA, id: diva2:636198
Tilgjengelig fra: 2013-07-09 Laget: 2013-07-08 Sist oppdatert: 2017-12-06bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

fulltext(1732 kB)956 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 1732 kBChecksum SHA-512
bb5c5fc52d98561d60acec3f0a103d6b508b9ad256c0290c123a065ed3f72394ec14b9c05e35d7d2bfecbd4fe14ad1dbfd796acc6a65977a7731fe8f1d26eb66
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekst

Personposter BETA

Klasson, Lisa

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Klasson, Lisa
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
Nature

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 956 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
urn-nbn

Altmetric

doi
urn-nbn
Totalt: 1268 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf