uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Multiplex detection of antibiotic resistance genes using padlock probes
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi. (Rudbeck Laboratory)
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Molekylära verktyg. (Rudbeck Laboratory)
Visa övriga samt affilieringar
2013 (Engelska)Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease, ISSN 0732-8893, E-ISSN 1879-0070, Vol. 77, nr 2, s. 118-125Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The elucidation of resistance mechanisms is of central importance to providing and maintaining efficient medical treatment. However, molecular detection methods covering the complete set of resistance genes with a single test are still missing. Here, we present a novel 100-plex assay based on padlock probes in combination with a microarray that allows the simultaneous large-scale identification of highly diverse beta-lactamases. The specificity of the assay was performed using 70 clinical bacterial isolates, recovering 98% of the beta-lactamase nucleotide sequences present. Additionally, the sensitivity was evaluated with PCR products and genomic bacterial DNA, revealing a detection limit of 10(4) DNA copies per reaction when using PCR products as the template. Pre-amplification of genomic DNA in a 25-multiplex PCR further facilitated the detection of beta-lactamase genes in dilutions of 10(7) cells/mL. In summary, we present an efficient, highly specific, and highly sensitive multiplex detection method for any gene.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2013. Vol. 77, nr 2, s. 118-125
Nyckelord [en]
Multiplex detection, beta-lactamases, Microarray, Padlock probes
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-210582DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2013.06.013ISI: 000325449100007OAI: oai:DiVA.org:uu-210582DiVA, id: diva2:663517
Tillgänglig från: 2013-11-12 Skapad: 2013-11-11 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Nilsson, Mats

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Nilsson, Mats
Av organisationen
Institutionen för immunologi, genetik och patologiMolekylära verktyg
I samma tidskrift
Diagnostic microbiology and infectious disease
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 788 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf