uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Microbial diversity of Alcyonium digitatum
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
2013 (Engelska)Ingår i: Phytochemistry Reviews, ISSN 1568-7767, E-ISSN 1572-980X, Vol. 12, nr 3, s. 531-542Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Marine multi-cellular organisms are described as sources of many newly discovered bioactive compounds. Meanwhile, it has been demonstrated repeatedly for several natural products of reputed multicellular origin that they are, in fact, produced by endophytic unicellular organisms-such as microbial fungi or bacteria. Consequently, while studying compounds isolated from a living organism, it is essential to ensure that the sample integrity is not compromised. To test the diversity of the endobiome from Alcyonium digitatum, a cold water coral found along the Atlantic coasts of the northern hemisphere, we performed a culture dependent surveyed using a phylogenetic approach. A 1 cm(3) cube from the interior tissue of A. digitatum was excised under aseptic conditions, homogenized, spread onto agar-based growth medium plates and incubated in 22 A degrees C to promote microbial growth. Colonies were transferred to secondary medium plates, incubated, and after harvesting lysed using sterile water to release DNA. 16S and 23S rDNA regions were amplified using PCR, and sequenced for systematic evaluation using phylogenetic analysis. From this survey we identified a broad selection of bacteria, predominantly of the alpha-proteobacterial, bacteriodete, actinobacterial and firmicute lineages, demonstrating a significant biodiversity of the coral bacterial endobiome.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2013. Vol. 12, nr 3, s. 531-542
Nyckelord [en]
Alcyonium digitatum, Microbial endobiome, Phylogeny, Biodiversity
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-211142DOI: 10.1007/s11101-012-9229-5ISI: 000324653400013OAI: oai:DiVA.org:uu-211142DiVA, id: diva2:665544
Tillgänglig från: 2013-11-20 Skapad: 2013-11-20 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Alsmark, CeciliaStrese, ÅkeWedén, ChristinaBacklund, Anders

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Alsmark, CeciliaStrese, ÅkeWedén, ChristinaBacklund, Anders
Av organisationen
Avdelningen för farmakognosi
I samma tidskrift
Phytochemistry Reviews
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 641 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf