uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Automated identification and classification of single particle serial femtosecond X-ray diffraction data
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
Visa övriga samt affilieringar
2014 (Engelska)Ingår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 22, nr 3, s. 2497-2510Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The first hard X-ray laser, the Linac Coherent Light Source (LCLS), produces 120 shots per second. Particles injected into the X-ray beam are hit randomly and in unknown orientations by the extremely intense X-ray pulses, where the femtosecond-duration X-ray pulses diffract from the sample before the particle structure is significantly changed even though the sample is ultimately destroyed by the deposited X-ray energy. Single particle X-ray diffraction experiments generate data at the FEL repetition rate, resulting in more than 400,000 detector readouts in an hour, the data stream during an experiment contains blank frames mixed with hits on single particles, clusters and contaminants. The diffraction signal is generally weak and it is superimposed on a low but continually fluctuating background signal, originating from photon noise in the beam line and electronic noise from the detector. Meanwhile, explosion of the sample creates fragments with a characteristic signature. Here, we describe methods based on rapid image analysis combined with ion Time-of-Flight (ToF) spectroscopy of the fragments to achieve an efficient, automated and unsupervised sorting of diffraction data. The studies described here form a basis for the development of real-time frame rejection methods, e. g. for the European XFEL, which is expected to produce 100 million pulses per hour. (C)2014 Optical Society of America

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. Vol. 22, nr 3, s. 2497-2510
Nationell ämneskategori
Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-222943DOI: 10.1364/OE.22.002497ISI: 000332518100035OAI: oai:DiVA.org:uu-222943DiVA, id: diva2:712567
Tillgänglig från: 2014-04-15 Skapad: 2014-04-15 Senast uppdaterad: 2017-12-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(3052 kB)399 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 3052 kBChecksumma SHA-512
24128e9534b52df84ad4b1612c35f2ad768e5ea0d817b11b85ded34c86ebe584d5af59d513a6b7fd23b5ebef5992eca65580757fc646f7fe6b0b35d9c72c242d
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Andreasson, JakobTimneanu, NicusorSvenda, MartinEkeberg, TomasHantke, MaxBielecki, JohanHajdu, Janos

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Andreasson, JakobTimneanu, NicusorSvenda, MartinEkeberg, TomasHantke, MaxBielecki, JohanHajdu, Janos
Av organisationen
Molekylär biofysik
I samma tidskrift
Optics Express
Biologiska vetenskaper

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 399 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 913 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf