uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Comparison of species identification of endocarditis associated viridans streptococci using rnpB genotyping and 2 MALDI-TOF systems
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk mikrobiologi och infektionsmedicin, Klinisk bakteriologi.
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease, ISSN 0732-8893, E-ISSN 1879-0070, Vol. 81, nr 4, s. 240-245Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Streptococcus spp. are important causes of infective endocarditis but challenging in species identification. This study compared identification based on sequence determination of the rnpB gene with 2 systems of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI Biotyper (Bruker) and VITEK MS IVD (bioMérieux). Blood culture isolates of viridans streptococci from 63 patients with infective endocarditis were tested. The 3 methods showed full agreement for all 36 isolates identified in the Anginosus, Bovis, and Mutans groups or identified as Streptococcus cristatus, Streptococcus gordonii, or Streptococcus sanguinis. None of the methods could reliably identify the 23 isolates to the species level when designated as Streptococcus mitis, Streptococcus oralis, or Streptococcus tigurinus. In 7 isolates classified to the Mitis group, the rnpB sequences deviated strikingly from all reference sequences, and additional analysis of sodA and groEL genes indicated the occurrence of yet unidentified Streptococcus spp.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 81, nr 4, s. 240-245
Nationell ämneskategori
Klinisk medicin
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-246397DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2014.12.007ISI: 000352117200003PubMedID: 25616316OAI: oai:DiVA.org:uu-246397DiVA, id: diva2:793092
Tillgänglig från: 2015-03-06 Skapad: 2015-03-06 Senast uppdaterad: 2017-12-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Isaksson, JennyKurland, SiriHerrmann, Björn

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Isaksson, JennyKurland, SiriHerrmann, Björn
Av organisationen
Klinisk bakteriologiInfektionssjukdomar
I samma tidskrift
Diagnostic microbiology and infectious disease
Klinisk medicin

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 511 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf