uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Automating model building in ligand-based predictive drug discovery using the Spark framework
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
2015 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (yrkesexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [en]

Automation of model building enables new predictive models to be generated in a faster, easier and more straightforward way once new data is available to predict on. Automation can also reduce the demand for tedious bookkeeping that is generally needed in manual workflows (e.g. intermediate files needed to be passed between steps in a workflow). The applicability of the Spark framework related to the creation of pipelines for predictive drug discovery was here evaluated and resulted in the implementation of two pipelines that serves as a proof of concept. Spark is considered to provide good means of creating pipelines for pharmaceutical purposes and its high level approach to distributed computing reduces the effort put on the developer compared to a regular HPC implementation. 

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. , s. 46
Serie
UPTEC X ; 15 011
Nationell ämneskategori
Data- och informationsvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-255610OAI: oai:DiVA.org:uu-255610DiVA, id: diva2:822888
Utbildningsprogram
Civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik
Handledare
Tillgänglig från: 2015-06-17 Skapad: 2015-06-17 Senast uppdaterad: 2018-01-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Rapport(1209 kB)1363 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 1209 kBChecksumma SHA-512
cfe0892dc0ecefefbe35c902ebc1524bc50a48532068cb9bb2dbb0772883d0a4a923e11542fe8cee00ca6cb28d64487f93867b84fa136293e02696c066268aec
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
Institutionen för biologisk grundutbildning
Data- och informationsvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 1368 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 1311 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf