uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Spatiotemporal Heterogeneity Characterizes the Genetic Landscape of Pheochromocytoma and Defines Early Events in Tumorigenesis.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Experimentell kirurgi.ORCID-id: 0000-0003-0677-4894
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Experimentell kirurgi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Experimentell kirurgi.
Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin.
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: Clinical Cancer Research, ISSN 1078-0432, E-ISSN 1557-3265, Vol. 21, nr 19, s. 4451-4460Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

PURPOSE: Pheochromocytoma and paraganglioma (PPGL) patients display heterogeneity in the clinical presentation and underlying genetic cause. The degree of inter- and intratumor genetic heterogeneity has not yet been defined.

EXPERIMENTAL DESIGN: In PPGLs from 94 patients, we analyzed LOH, copy-number variations, and mutation status of SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SDHAF2, VHL, EPAS1, NF1, RET, TMEM127, MAX, and HRAS using high-density SNP array and targeted deep sequencing, respectively. Genetic heterogeneity was determined through (i) bioinformatics analysis of individual samples that estimated absolute purity and ploidy from SNP array data and (ii) comparison of paired tumor samples that allowed reconstruction of phylogenetic trees.

RESULTS: Mutations were found in 61% of the tumors and correlated with specific patterns of somatic copy-number aberrations (SCNA) and degree of nontumoral cell admixture. Intratumor genetic heterogeneity was observed in 74 of 136 samples using absolute bioinformatics estimations and in 22 of 24 patients by comparison of paired samples. In addition, a low genetic concordance was observed between paired primary tumors and distant metastases. This allowed for reconstructing the life history of individual tumors, identifying somatic mutations as well as copy-number loss of 3p and 11p (VHL subgroup), 1p (Cluster 2), and 17q (NF1 subgroup) as early events in PPGL tumorigenesis.

CONCLUSIONS: Genomic landscapes of PPGL are specific to mutation subtype and characterized by genetic heterogeneity both within and between tumor lesions of the same patient.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 21, nr 19, s. 4451-4460
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-266641DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-14-2854ISI: 000363330500027PubMedID: 25991818OAI: oai:DiVA.org:uu-266641DiVA, id: diva2:868353
Forskningsfinansiär
CancerfondenTillgänglig från: 2015-11-10 Skapad: 2015-11-10 Senast uppdaterad: 2019-10-30Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Crona, JoakimBackman, SamuelMaharjan, RajaniMayrhofer, MarkusStålberg, PeterIsaksson, AndersHellman, PerBjörklund, Peyman

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Crona, JoakimBackman, SamuelMaharjan, RajaniMayrhofer, MarkusStålberg, PeterIsaksson, AndersHellman, PerBjörklund, Peyman
Av organisationen
Experimentell kirurgiCancerfarmakologi och beräkningsmedicinEndokrinkirurgi
I samma tidskrift
Clinical Cancer Research
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 686 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf