uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Magnetic nanobeads present during enzymatic amplification and labeling for a simplified DNA detection protocol based on AC susceptometry
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Fasta tillståndets fysik.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Nanoteknologi och funktionella material.ORCID-id: 0000-0002-5496-9664
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Fasta tillståndets fysik.
Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden..
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: AIP Advances, ISSN 2158-3226, E-ISSN 2158-3226, Vol. 5, nr 12, artikel-id 127139Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Resurstyp
Text
Abstract [en]

Magnetic biosensors are promising candidates for low-cost point-of-care biodiagnostic devices. For optimal efficiency it is crucial to minimize the time and complexity of the assay protocol including target recognition, amplification, labeling and read-out. In this work, possibilities for protocol simplifications for a DNA biodetection principle relying on hybridization of magnetic nanobeads to rolling circle amplification (RCA) products are investigated. The target DNA is recognized through a padlock ligation assay resulting in DNA circles serving as templates for the RCA process. It is found that beads can be present during amplification without noticeably interfering with the enzyme used for RCA (phi29 polymerase). As a result, the bead-coil hybridization can be performed immediately after amplification in a one-step manner at elevated temperature within a few minutes prior to read-out in an AC susceptometer setup, i.e. a combined protocol approach. Moreover, by recording the phase angle xi = arctan(chi ''/chi'), where chi and chi '' are the in-phase and out-of-phase components of the AC susceptibility, respectively, at one single frequency the total assay time for the optimized combined protocol would be no more than 1.5 hours, often a relevant time frame for diagnosis of cancer and infectious disease. Also, applying the phase angle method normalization of AC susceptibility data is not needed. These findings are useful for the development of point-of-care biodiagnostic devices relying on bead-coil binding and magnetic AC susceptometry.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 5, nr 12, artikel-id 127139
Nationell ämneskategori
Nanoteknik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-275867DOI: 10.1063/1.4939570ISI: 000367596300039OAI: oai:DiVA.org:uu-275867DiVA, id: diva2:902623
Forskningsfinansiär
Forskningsrådet Formas, 221-2012-444, 2011-1692Stiftelsen för strategisk forskning (SSF), SBE13-0125Tillgänglig från: 2016-02-11 Skapad: 2016-02-08 Senast uppdaterad: 2019-04-24Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(747 kB)302 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 747 kBChecksumma SHA-512
6494fe647c4a43e862560d14bf278e796fae7e0eb65b6d1318272b2c8b5762e54f676fee7fda1f494097c47258fb1ccd9bd19bff090706ba02f09bee98bd161c
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Bejhed Stjernberg, RebeccaStrömme, MariaSvedlindh, PeterStrömberg, Mattias

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bejhed Stjernberg, RebeccaStrömme, MariaSvedlindh, PeterStrömberg, Mattias
Av organisationen
Fasta tillståndets fysikNanoteknologi och funktionella material
I samma tidskrift
AIP Advances
Nanoteknik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 302 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 772 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf