uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
How Beyond Rule of 5 Drugs and Clinical Candidates Bind to Their Targets.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC.ORCID-id: 0000-0002-4205-6040
2016 (Engelska)Ingår i: Journal of Medicinal Chemistry, ISSN 0022-2623, E-ISSN 1520-4804, Vol. 59, nr 6, s. 2312-2327Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

To improve discovery of drugs for difficult targets, the opportunities of chemical space beyond the rule of 5 (bRo5) were examined by retrospective analysis of a comprehensive set of structures for complexes between drugs and clinical candidates and their targets. The analysis illustrates the potential of compounds far beyond rule of 5 space to modulate novel and difficult target classes that have large, flat, and groove-shaped binding sites. However, ligand efficiencies are significantly reduced for flat- and groove-shape binding sites, suggesting that adjustments of how to use such metrics are required. Ligands bRo5 appear to benefit from an appropriate balance between rigidity and flexibility to bind with sufficient affinity to their targets, with macrocycles and nonmacrocycles being found to have similar flexibility. However, macrocycles were more disk- and spherelike, which may contribute to their superior binding to flat sites, while rigidification of nonmacrocycles lead to rodlike ligands that bind well to groove-shaped binding sites. These insights should contribute to altering perceptions of what targets are considered "druggable" and provide support for drug design in beyond rule of 5 space.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 59, nr 6, s. 2312-2327
Nationell ämneskategori
Läkemedelskemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-287442DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5b01286ISI: 000372946500003PubMedID: 26457449OAI: oai:DiVA.org:uu-287442DiVA, id: diva2:922736
Tillgänglig från: 2016-04-25 Skapad: 2016-04-25 Senast uppdaterad: 2018-07-30

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Dobritzsch, DoreenKihlberg, Jan

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Dobritzsch, DoreenKihlberg, Jan
Av organisationen
Institutionen för kemi - BMC
I samma tidskrift
Journal of Medicinal Chemistry
Läkemedelskemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 694 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf