uu.seUppsala University Publications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Mot en effektiv data- och informationshantering på SiCell
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Show others and affiliations
2013 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

Denna projektrapport är avsedd att vara ett hjälpmedel för SiCell, en del av SciLifeLab Uppsala som ska bli Europas första plattform för enkelcellgenomik till hösten 2013. SiCell har bett projektgruppen om undersökningar gällande ett Laboratory Information Management System, LIMS. På svenska ett datahanteringsystem för laboratorier. Ett sådant system skulle kunna effektivisera SiCells verksamhet. Undersökningarna har resulterat i en kravspecifikation som ett LIMS för SiCell ska uppfylla och en sammanställning av tillgängliga mjukvaror som bäst uppfyller dessa krav. Screensaver, MISO och Gnomex är de tre gratisprogram med öppen källkod som hamnade högst upp i listan. Inget av dem uppfyller alla krav men med modifieringar av programmerare tros detta vara möjligt.

SiCell bad också om lägre prioriterade undersökningar av några av de metoder som används inom plattformen. Cellysering, Alternativa amplifieringsmetoder och transkriptomik har undersökts av projektgruppen. Detta resulterade i en sammanställning av vilka alternativ som finns och vad som är under utveckling inom respektive område.

Place, publisher, year, edition, pages
2013. , 74 p.
Keyword [en]
LIMS, SCG, single cell genomics, SiCell
Keyword [sv]
LIMS, enkelcellsgenomik, enkelcellgenomik, SiCell
National Category
Engineering and Technology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:uu:diva-201165OAI: oai:DiVA.org:uu-201165DiVA: diva2:626277
Educational program
Molecular Biotechnology Engineering Programme
Supervisors
Examiners
Available from: 2013-06-07 Created: 2013-06-07 Last updated: 2013-06-07Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(2538 kB)384 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 2538 kBChecksum SHA-512
a867fb1a98a570b5e5d009a3f37c9ffc0a713cce141e7ac817bd02767ae447ad65c4393bf5d84593e593457c8d02fba59acf3ce58df225020386c1e73428242e
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
Biology Education Centre
Engineering and Technology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 384 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 1107 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf