uu.seUppsala University Publications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A Study of Digital In-Line Holographic Microscopy for Malaria Detection
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Technology, Department of Engineering Sciences.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Technology, Department of Engineering Sciences.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Technology, Department of Engineering Sciences.
2014 (English)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [en]

The main purpose of the project was to create an initial lab set-up for a dig-ital in-line holographic microscope and a reconstruction algorithm. Different parameters including: light source, pin-hole size and distances pinhole-object and object-camera had to be optimized. The lab set-up is to be developed further by a master student at the University of Nairobi and then be used for malaria detection in blood samples. To acquire good enough resolution for malaria detection it has been found necessary to purchase a gray scale camera with smaller pixel size. Two dierent approaches, in this report called the on-sensor approach and the object-magnication approach, were investigated. A reconstruction algorithm anda phase recovery algorithm was implemented as well as a super resolution algorithm to improve resolution of the holograms. The on-sensor approach proved easier and cheaper to use with approximately the same results as the object-magnication method. Necessary further research and development of experimental set-up was thoroughly discussed.

Abstract [sv]

Projketet har gått ut på att bygga en billigare och enklare metod för att identifiera malaria i blodprover. Malaria är ett stort problem i en mängd områden i världen. Flera av dessa är fattiga och kan i nuläget inte tillhandahålla den här tjänsten till sin befolkning. Förutom att dyr apparatur krävs måste även utbildad personal lägga ner mycket tid för att kolla en stor mängd blodprover för att statistiskt säkerställa om en person har malaria eller inte. Vårt mål var att bygga en labbuppställning för "Digital in line holographic microscopy" och en rekonstruktionsalgoritm som en masterstudent vid Nairobi universitet ska fortsätta utveckla. Vi kom också fram till vilken upplösning som krävdes för att kunna urskilja malaria i blodproverna.

Digital in line holographic microscopy går till så att man har en ljuskälla som riktas genom ett pinnhål, ljuset som går genom pinnhålet ljuser upp det prov, blodproverna i vårt fall, man vill undersöka och det resulterande ljuset fångas på en kamera. Med kunskap om fourieroptik går det att rekonstruera den digitala bilden man fångat på kameran, innan rekonstruktion är den ett hologram vilken är svårtydd. Labbuppställningen byggdes delvis med en 3D printer.

För att förbättra resultaten implementerades flera algoritmer vilka lade ihop en mängd förskjutna bilder till en bättre bild, så kallad super resolution. Vi lyckades inte komma till den upplösning som krävdes för att urskilja malaria men gjorde en grundlig förstudie och en utförlig beskrivning av det arbete som väntar den student som fortsätter med projektet. Framför allt beskrevs värden på parametrar och vilken typ av kamera som ska användas för att optimera uppställningen.

Place, publisher, year, edition, pages
2014. , 63 p.
Series
TVE, 14 054
Keyword [en]
DIHM, digital in-line holography, malaria, reconstruction, super resolution, phase, hologram
National Category
Medical Equipment Engineering
Identifiers
URN: urn:nbn:se:uu:diva-229840OAI: oai:DiVA.org:uu-229840DiVA: diva2:738015
External cooperation
Department of Physics, University of Nairobi
Educational program
Master Programme in Engineering Physics
Supervisors
Examiners
Available from: 2014-09-10 Created: 2014-08-15 Last updated: 2014-09-10Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(16904 kB)944 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 16904 kBChecksum SHA-512
6ebaa39e6998022ed8128651aa98d2e10eb532a49f19867a79f9478917d49bafdef6ddde95209b2b545c8572c2a31f015c9c5e5985d7b3412e36240f77f751c2
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
Department of Engineering Sciences
Medical Equipment Engineering

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 944 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 1740 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf