uu.seUppsala University Publications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
A comparison of the performance of survival models applied on simulated overall survival of breast cancer patients
Uppsala University, Disciplinary Domain of Medicine and Pharmacy, Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Biosciences.
2014 (English)Independent thesis Advanced level (degree of Master (Two Years)), 20 credits / 30 HE creditsStudent thesis
Abstract [en]

A comparison of the performance of survival models applied on simulated overall survival of breast cancer patients

Rickard Eriksson

Supervisors: Kristin Karlsson, PhD, Joakim Nyberg, PhD

Department of Pharmaceutical Biosciences, Uppsala University, 30 credits 

Examinator: Margareta Hammarlund-Udenaes

Introduction: Survival analysis is an important part in the assessments of the risk factors and treatments of cancer diseases. The model-based approach of analysis of overall survival data can provide prognostic tools for clinical use and can be applied to describe the probability of survival of differernt individuals with respect to risk factors and drug treatments. The Cox proportional hazard (CPH) model is the most frequently utilized model in these matters, but due to its semi-parametric nature there is a need to assess the applicability of the model compared with other  types of survival models.

Aim: The aim of the project is to compare the performance of parametric, semi-parametric and non-parametric hazard models when applied to simulated breast cancer patients, and make inferences of the applicability of these models in phase-III clinical trials in drug development.

Materials and Methods: The project was performed in NONMEM® with simulated survival data based on two clinical studies and survival models developed prior to and during this project. The model performance was assessed in terms of statistical power to detect a drug effect, bias and precision in parameter estimation, and statistical properties such as type I error.

Results: The CPH model did show high accuracy and did, together with the Weibull hazard model (WB), provide high statistical power (~99% and 85%) to detect a drug effect in the phase-III clinical trial settings evaluated in this project.

Conclusions: CPH and WB should both be regarded as options when analysing survival data in the present settings.  

 

Abstract [sv]

A comparison of the performance of survival models applied on simulated overall survival of breast cancer patients

Rickard Eriksson

Handledare: Kristin Karlsson, Joakim Nyberg

Institutionen för farmaceutisk biovetenskap, Uppsala universitet, 30 hp  Examinator: Margareta Hammarlund-Udenaes

Introduktion: Analys av sjukdomsprogression och överlevnad är en viktig del vid utvärdering av riskfaktorer och behandlingar vid onkologiska sjukdomar. Med matematiska och statistiska analysmetoder (modeller) kan man bidra till utveckling av kliniskt användbara prognostiska redskap, ge support vid design av kliniska prövningar och beskriva sannolikheten för patienter att överleva, med hänsyn till både olika riskfaktorer och behandlingar. Av de olika överlevnadsmodeller som kan användas i dessa syften är ‘Cox proportional hazard’ (CPH) den mest frekvent förekommande, men på grund av att dess egenskaper skiljer sig från övriga överlevnadsmodeller finns det orsak att jämföra och utvärdera dessa när de appliceras på överlevnadsdata.

Syfte: Projektets syfte är att jämföra olika överlevnadsmodeller när de appliceras på simulerad överlevnadsdata och på så sätt kunna dra slutsatser om huruvida dessa lämpar sig för användning i senare kliniska studier inom läkemedelsutveckling.

Material och metod: Detta projekt utfördes i NONMEM® (mjukvara för modellering) med simulerad data som baserats på två kliniska studier och med överlevnadsmodeller som utvecklats innan och under detta projekt. Modellernas förmåga att detektera läkemedelseffekt och applicerbarhet i senare kliniska studier jämfördes och utvärderades statistiskt.

Resultat: CPH-modellen var en av de två överlevnadsmodeller som uppvisade bäst förmåga att korrekt beskriva effekten av riskfaktorer samt att detektera läkemedelseffekt vid scenarion ämnade att utvärdera användbarheten av dessa modeller i senare kliniska studier.

Slutsats: CPH-modellen var en av de två modeller som bör anses som goda alternativ vid analys av överlevnadsdata i scenarion som dessa.

 

Place, publisher, year, edition, pages
2014. , 38 p.
Keyword [en]
farmacometric, oncology, models, survival, breast cancer, Weibull, Cox
Keyword [sv]
Farmakometri, bröstcancer, oncology, modeller, överlevnad, Weibull, Cox
National Category
Pharmaceutical Sciences
Identifiers
URN: urn:nbn:se:uu:diva-230706OAI: oai:DiVA.org:uu-230706DiVA: diva2:741438
Subject / course
Pharmacokinetics
Educational program
Master of Science Programme in Pharmacy
Supervisors
Examiners
Available from: 2014-08-28 Created: 2014-08-28 Last updated: 2014-08-28Bibliographically approved

Open Access in DiVA

No full text

By organisation
Department of Pharmaceutical Biosciences
Pharmaceutical Sciences

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 484 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf