uu.seUppsala University Publications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Framtagning av unika gemensamma sekvenser hos koagulasnegativa stafylokocker
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Uppsala University, Disciplinary Domain of Science and Technology, Biology, Biology Education Centre.
Show others and affiliations
2016 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

I följande rapport kommer vi ta upp hur vi löste problemet med att hitta gemensamma sekvenser hos en mängd koagulasnegativa stafylokocker (KNS) för att bl.a. kunna skilja dem ifrån dess släkting Staphylococcus aureus (S. aureus). Problemet har sin grund i att projektbeställaren, Q-linea, vill kunna identifiera infekterande bakterier i fall av blodsjukdomen sepsis. Vi kunde dessvärre inte hitta sekvenser som fungerade för alla våra utvalda stafylokocker. Däremot lyckades vi hitta flera sekvenser som parvis fungerade tillsammans för att urskilja stafylokockgruppen mot S. aureus. För att utföra alla jämförelser konstruerade och implementerade vi en bioinformatisk pipeline med en tredelad optimeringsmetod för att göra de tunga beräkningarna snabbare.

Place, publisher, year, edition, pages
2016. , 27 p.
National Category
Bioinformatics (Computational Biology)
Identifiers
URN: urn:nbn:se:uu:diva-295974OAI: oai:DiVA.org:uu-295974DiVA: diva2:935654
Educational program
Molecular Biotechnology Engineering Programme
Supervisors
Examiners
Available from: 2016-06-12 Created: 2016-06-11 Last updated: 2016-06-12Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(1998 kB)73 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 1998 kBChecksum SHA-512
f2fbcd120a2e2865c6a998249d3b2a04e5bde367f46280293c5735a182e1aa2bb8a212c9364a0fc818c5bc1329c590332524762870191a1aee480178526cb1e7
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
Biology Education Centre
Bioinformatics (Computational Biology)

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 73 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 1056 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf