uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
Begrens søket
1 - 31 of 31
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Treff pr side
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
  • Disputationsdatum (tidligste først)
  • Disputationsdatum (siste først)
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
  • Disputationsdatum (tidligste først)
  • Disputationsdatum (siste først)
Merk
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1.
    Andreasson, Jakob
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Martin, Andrew V.
    Liang, Meng
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Wang, Fenglin
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Foucar, Lutz
    Hartmann, Robert
    Erk, Benjamin
    Rudek, Benedikt
    Chapman, Henry N.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Automated identification and classification of single particle serial femtosecond X-ray diffraction data2014Inngår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 22, nr 3, s. 2497-2510Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    The first hard X-ray laser, the Linac Coherent Light Source (LCLS), produces 120 shots per second. Particles injected into the X-ray beam are hit randomly and in unknown orientations by the extremely intense X-ray pulses, where the femtosecond-duration X-ray pulses diffract from the sample before the particle structure is significantly changed even though the sample is ultimately destroyed by the deposited X-ray energy. Single particle X-ray diffraction experiments generate data at the FEL repetition rate, resulting in more than 400,000 detector readouts in an hour, the data stream during an experiment contains blank frames mixed with hits on single particles, clusters and contaminants. The diffraction signal is generally weak and it is superimposed on a low but continually fluctuating background signal, originating from photon noise in the beam line and electronic noise from the detector. Meanwhile, explosion of the sample creates fragments with a characteristic signature. Here, we describe methods based on rapid image analysis combined with ion Time-of-Flight (ToF) spectroscopy of the fragments to achieve an efficient, automated and unsupervised sorting of diffraction data. The studies described here form a basis for the development of real-time frame rejection methods, e. g. for the European XFEL, which is expected to produce 100 million pulses per hour. (C)2014 Optical Society of America

  • 2. Aquila, Andrew
    et al.
    Hunter, Mark S.
    Doak, R. Bruce
    Kirian, Richard A.
    Fromme, Petra
    White, Thomas A.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Arnlund, David
    Bajt, Saša
    Barends, Thomas R. M.
    Barthelmess, Miriam
    Bogan, Michael J.
    Bostedt, Christoph
    Bottin, Hervé
    Bozek, John D.
    Caleman, Carl
    Coppola, Nicola
    Davidsson, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - Ångström, Fysikalisk kemi.
    DePonte, Daniel P.
    Elser, Veit
    Epp, Sascha W.
    Erk, Benjamin
    Fleckenstein, Holger
    Foucar, Lutz
    Frank, Matthias
    Fromme, Raimund
    Graafsma, Heinz
    Grotjohann, Ingo
    Gumprecht, Lars
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hampton, Christina Y.
    Hartmann, Andreas
    Hartmann, Robert
    Hau-Riege, Stefan
    Hauser, Günter
    Hirsemann, Helmut
    Holl, Peter
    Holton, James M.
    Hömke, André
    Johansson, Linda
    Kimmel, Nils
    Kassemeyer, Stephan
    Krasniqi, Faton
    Kühnel, Kai-Uwe
    Liang, Mengning
    Lomb, Lukas
    Malmerberg, Erik
    Marchesini, Stefano
    Martin, Andrew V.
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Messerschmidt, Marc
    Nass, Karol
    Reich, Christian
    Neutze, Richard
    Rolles, Daniel
    Rudek, Benedikt
    Rudenko, Artem
    Schlichting, Ilme
    Schmidt, Carlo
    Schmidt, Kevin E.
    Schulz, Joachim
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Soltau, Heike
    Shoeman, Robert L.
    Sierra, Raymond
    Starodub, Dmitri
    Stellato, Francesco
    Stern, Stephan
    Strüder, Lothar
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ullrich, Joachim
    Wang, Xiaoyu
    Williams, Garth J.
    Weidenspointner, Georg
    Weierstall, Uwe
    Wunderer, Cornelia
    Barty, Anton
    Spence, John C. H.
    Chapman, Henry N.
    Time-resolved protein nanocrystallography using an X-ray free-electron laser2012Inngår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 20, nr 3, s. 2706-2716Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    We demonstrate the use of an X-ray free electron laser synchronized with an optical pump laser to obtain X-ray diffraction snapshots from the photoactivated states of large membrane protein complexes in the form of nanocrystals flowing in a liquid jet. Light-induced changes of Photosystem I-Ferredoxin co-crystals were observed at time delays of 5 to 10 µs after excitation. The result correlates with the microsecond kinetics of electron transfer from Photosystem I to ferredoxin. The undocking process that follows the electron transfer leads to large rearrangements in the crystals that will terminally lead to the disintegration of the crystals. We describe the experimental setup and obtain the first time-resolved femtosecond serial X-ray crystallography results from an irreversible photo-chemical reaction at the Linac Coherent Light Source. This technique opens the door to time-resolved structural studies of reaction dynamics in biological systems.

  • 3. Barty, Anton
    et al.
    Caleman, Carl
    Aquila, Andrew
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Lomb, Lukas
    White, Thomas A.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Arnlund, David
    Bajt, Sasa
    Barends, Thomas R. M.
    Barthelmess, Miriam
    Bogan, Michael J.
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D.
    Coffee, Ryan
    Coppola, Nicola
    Davidsson, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - Ångström, Fysikalisk kemi.
    DePonte, Daniel P.
    Doak, R. Bruce
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Elser, Veit
    Epp, Sascha W.
    Erk, Benjamin
    Fleckenstein, Holger
    Foucar, Lutz
    Fromme, Petra
    Graafsma, Heinz
    Gumprecht, Lars
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hampton, Christina Y.
    Hartmann, Robert
    Hartmann, Andreas
    Hauser, Guenter
    Hirsemann, Helmut
    Holl, Peter
    Hunter, Mark S.
    Johansson, Linda
    Kassemeyer, Stephan
    Kimmel, Nils
    Kirian, Richard A.
    Liang, Mengning
    Maia, Filipe R. N. C.
    Malmerberg, Erik
    Marchesini, Stefano
    Martin, Andrew V.
    Nass, Karol
    Neutze, Richard
    Reich, Christian
    Rolles, Daniel
    Rudek, Benedikt
    Rudenko, Artem
    Scott, Howard
    Schlichting, Ilme
    Schulz, Joachim
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Shoeman, Robert L.
    Sierra, Raymond G.
    Soltau, Heike
    Spence, John C. H.
    Stellato, Francesco
    Stern, Stephan
    Strueder, Lothar
    Ullrich, Joachim
    Wang, X.
    Weidenspointner, Georg
    Weierstall, Uwe
    Wunderer, Cornelia B.
    Chapman, Henry N.
    Self-terminating diffraction gates femtosecond X-ray nanocrystallography measurements2012Inngår i: Nature Photonics, ISSN 1749-4885, E-ISSN 1749-4893, Vol. 6, nr 1, s. 35-40Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    X-ray free-electron lasers have enabled new approaches to the structural determination of protein crystals that are too small or radiation-sensitive for conventional analysis(1). For sufficiently short pulses, diffraction is collected before significant changes occur to the sample, and it has been predicted that pulses as short as 10 fs may be required to acquire atomic-resolution structural information(1-4). Here, we describe a mechanism unique to ultrafast, ultra-intense X-ray experiments that allows structural information to be collected from crystalline samples using high radiation doses without the requirement for the pulse to terminate before the onset of sample damage. Instead, the diffracted X-rays are gated by a rapid loss of crystalline periodicity, producing apparent pulse lengths significantly shorter than the duration of the incident pulse. The shortest apparent pulse lengths occur at the highest resolution, and our measurements indicate that current X-ray free-electron laser technology(5) should enable structural determination from submicrometre protein crystals with atomic resolution.

  • 4. Chapman, Henry N.
    et al.
    Fromme, Petra
    Barty, Anton
    White, Thomas A.
    Kirian, Richard A.
    Aquila, Andrew
    Hunter, Mark S.
    Schulz, Joachim
    DePonte, Daniel P.
    Weierstall, Uwe
    Doak, R. Bruce
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Martin, Andrew V.
    Schlichting, Ilme
    Lomb, Lukas
    Coppola, Nicola
    Shoeman, Robert L.
    Epp, Sascha W.
    Hartmann, Robert
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Foucar, Lutz
    Kimmel, Nils
    Weidenspointner, Georg
    Holl, Peter
    Liang, Mengning
    Barthelmess, Miriam
    Caleman, Carl
    Boutet, Sebastien
    Bogan, Michael J.
    Krzywinski, Jacek
    Bostedt, Christoph
    Bajt, Sasa
    Gumprecht, Lars
    Rudek, Benedikt
    Erk, Benjamin
    Schmidt, Carlo
    Hoemke, Andre
    Reich, Christian
    Pietschner, Daniel
    Strueder, Lothar
    Hauser, Guenter
    Gorke, Hubert
    Ullrich, Joachim
    Herrmann, Sven
    Schaller, Gerhard
    Schopper, Florian
    Soltau, Heike
    Kuehnel, Kai-Uwe
    Messerschmidt, Marc
    Bozek, John D.
    Hau-Riege, Stefan P.
    Frank, Matthias
    Hampton, Christina Y.
    Sierra, Raymond G.
    Starodub, Dmitri
    Williams, Garth J.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rocker, Andrea
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Jönsson, Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Stern, Stephan
    Nass, Karol
    Andritschke, Robert
    Schroeter, Claus-Dieter
    Krasniqi, Faton
    Bott, Mario
    Schmidt, Kevin E.
    Wang, Xiaoyu
    Grotjohann, Ingo
    Holton, James M.
    Barends, Thomas R. M.
    Neutze, Richard
    Marchesini, Stefano
    Fromme, Raimund
    Schorb, Sebastian
    Rupp, Daniela
    Adolph, Marcus
    Gorkhover, Tais
    Andersson, Inger
    SLU.
    Hirsemann, Helmut
    Potdevin, Guillaume
    Graafsma, Heinz
    Nilsson, Björn
    Spence, John C. H.
    Femtosecond X-ray protein nanocrystallography2011Inngår i: Nature, ISSN 0028-0836, E-ISSN 1476-4687, Vol. 470, nr 7332, s. 73-77Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    X-ray crystallography provides the vast majority of macromolecular structures, but the success of the method relies on growing crystals of sufficient size. In conventional measurements, the necessary increase in X-ray dose to record data from crystals that are too small leads to extensive damage before a diffraction signal can be recorded(1-3). It is particularly challenging to obtain large, well-diffracting crystals of membrane proteins, for which fewer than 300 unique structures have been determined despite their importance in all living cells. Here we present a method for structure determination where single-crystal X-ray diffraction 'snapshots' are collected from a fully hydrated stream of nanocrystals using femtosecond pulses from a hard-X-ray free-electron laser, the Linac Coherent Light Source(4). We prove this concept with nanocrystals of photosystem I, one of the largest membrane protein complexes(5). More than 3,000,000 diffraction patterns were collected in this study, and a three-dimensional data set was assembled from individual photosystem I nanocrystals (similar to 200 nm to 2 mm in size). We mitigate the problem of radiation damage in crystallography by using pulses briefer than the timescale of most damage processes(6). This offers a new approach to structure determination of macromolecules that do not yield crystals of sufficient size for studies using conventional radiation sources or are particularly sensitive to radiation damage.

  • 5. Cryan, J P
    et al.
    Glownia, J M
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Belkacem, A
    Berrah, N
    Blaga, C I
    Bostedt, C
    Bozek, J
    Cherepkov, N A
    DiMauro, L F
    Fang, L
    Gessner, O
    Guhr, M
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hertlein, M P
    Hoener, M
    Kornilov, O
    Marangos, J P
    March, A M
    McFarland, B K
    Merdji, H
    Messerschmidt, M
    Petrović, V S
    Raman, C
    Ray, D
    Reis, D A
    Semenov, S K
    Trigo, M
    White, J L
    White, W
    Young, L
    Bucksbaum, P H
    Coffee, R N
    Molecular frame Auger electron energy spectrum from N22012Inngår i: Journal of Physics B: Atomic, Molecular and Optical Physics, ISSN 0953-4075, E-ISSN 1361-6455, Vol. 45, nr 5, s. 055601-Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Here we present the first angle-resolved, non-resonant (normal) Auger spectra for impulsively aligned nitrogen molecules. We have measured the angular pattern of Auger electron emission following K -shell photoionization by 1.1 keV photons from the Linac Coherent Light Source (LCLS). Using strong-field-induced molecular alignment to make molecular frame measurements is equally effective for both repulsive and quasi-bound final states. The capability to resolve Auger emission angular distributions in the molecular frame of reference provides a new tool for spectral assignments in congested Auger electron spectra that takes advantage of the symmetries of the final diction states. Based on our experimental results and theoretical predictions, we propose the assignment of the spectral features in the Auger electron spectrum.

  • 6.
    Daurer, Benedikt J.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Benner, W. Henry
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Tîmneanu, Nicuşor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Ekeberg, Tomas
    Loh, N. Duane
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rath, Asawari D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Kirian, Richard A.
    Awel, Salah
    Wiedorn, Max O.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sebastian
    Williams, Garth
    Koglin, Jason
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Experimental strategies for imaging bioparticles with femtosecond hard X-ray pulses2017Inngår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 4, s. 251-262Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 7.
    Dicke, B.
    et al.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Hoffmann, A.
    Rhein Westfal TH Aachen, Inst Inorgan Chem, D-52074 Aachen, Germany..
    Stanek, J.
    Rhein Westfal TH Aachen, Inst Inorgan Chem, D-52074 Aachen, Germany..
    Rampp, M. S.
    Ludwig Maximilians Univ Munchen, Inst Biomol Opt, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany.;Ludwig Maximilians Univ Munchen, Ctr Integrated Prot Sci CIPSM, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany..
    Grimm-Lebsanft, B.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Biebl, F.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Rukser, D.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Maerz, B.
    Ludwig Maximilians Univ Munchen, Inst Biomol Opt, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany.;Ludwig Maximilians Univ Munchen, Ctr Integrated Prot Sci CIPSM, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany..
    Goeries, D.
    Deutsch Elektronensynchrotron DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Naumova, M.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Univ Paderborn, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany..
    Biednov, M.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Neuber, G.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Wetzel, A.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Hofmann, S. M.
    Ludwig Maximilians Univ Munchen, Inst Biomol Opt, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany.;Ludwig Maximilians Univ Munchen, Ctr Integrated Prot Sci CIPSM, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany..
    Roedig, P.
    Deutsch Elektronensynchrotron DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Meents, A.
    Deutsch Elektronensynchrotron DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. European XFEL, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany..
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Czech Acad Sci, ELI Beamlines, Inst Phys, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic.;Chalmers Univ Technol, Dept Phys, Condensed Matter Phys, Gothenburg, Sweden..
    Beyerlein, K. R.
    Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Chapman, H. N.
    Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.;Deutsch Elektronensynchrotron DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Bressler, C.
    European XFEL, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.;Tech Univ Denmark, Dept Phys, Fysikvej 307, DK-2800 Lyngby, Denmark.;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Zinth, W.
    Ludwig Maximilians Univ Munchen, Inst Biomol Opt, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany.;Ludwig Maximilians Univ Munchen, Ctr Integrated Prot Sci CIPSM, Oettingenstr 67, D-80538 Munich, Germany..
    Rübhausen, M.
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, D-22761 Hamburg, Germany.;Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Herres-Pawlis, S.
    Rhein Westfal TH Aachen, Inst Inorgan Chem, D-52074 Aachen, Germany..
    Transferring the entatic-state principle to copper photochemistry2018Inngår i: Nature Chemistry, ISSN 1755-4330, E-ISSN 1755-4349, Vol. 10, nr 3, s. 355-362Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    The entatic state denotes a distorted coordination geometry of a complex from its typical arrangement that generates an improvement to its function. The entatic-state principle has been observed to apply to copper electron-transfer proteins and it results in a lowering of the reorganization energy of the electron-transfer process. It is thus crucial for a multitude of biochemical processes, but its importance to photoactive complexes is unexplored. Here we study a copper complex-with a specifically designed constraining ligand geometry-that exhibits metal-to-ligand charge-transfer state lifetimes that are very short. The guanidine-quinoline ligand used here acts on the bis(chelated) copper(I) centre, allowing only small structural changes after photoexcitation that result in very fast structural dynamics. The data were collected using a multimethod approach that featured time-resolved ultraviolet-visible, infrared and X-ray absorption and optical emission spectroscopy. Through supporting density functional calculations, we deliver a detailed picture of the structural dynamics in the picosecond-to-nanosecond time range.

  • 8.
    Ekeberg, Tomas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Abergel, Chantal
    CNRS, Informat Genom & Struct UMR7256, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France.;Aix Marseille Univ, Inst Microbiol Mediterranee FR3479, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France..
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seltzer, Virginie
    CNRS, Informat Genom & Struct UMR7256, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France.;Aix Marseille Univ, Inst Microbiol Mediterranee FR3479, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France..
    DePonte, Daniel P.
    SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Aquila, Andrew
    SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA.;European XFEL, Albert Einstein Ring 19, D-22761 Hamburg, Germany..
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Ctr Etud Saclay, Commissariat Energie Atom & Energies Alternat, F-91191 Gif Sur Yvette, France..
    Jönsson, H. Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Odic, Dusko
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Liang, Meng
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Martin, Andrew V.
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Univ Melbourne, 161 Barry St, Melbourne, Vic 3010, Australia..
    Gumprecht, Lars
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Fleckenstein, Holger
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Bajt, Sasa
    DESY, Photon Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Barthelmess, Miriam
    DESY, Photon Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Coppola, Nicola
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Claverie, Jean-Michel
    CNRS, Informat Genom & Struct UMR7256, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France.;Aix Marseille Univ, Inst Microbiol Mediterranee FR3479, Parc Sci Luminy,Case 934, F-13288 Marseille 9, France..
    Loh, N. Duane
    SLAC Natl Accelerator Lab, Stanford PULSE Inst, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA.;Natl Univ Singapore, Ctr BioImaging Sci, 14 Sci Dr 4 Blk S1 A, Singapore 117546, Singapore..
    Bostedt, Christoph
    SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Bozek, John D.
    Synchrotron SOLEIL, Lorme Merisiers Roundabout St Aubin, F-91190 St Aubin, France..
    Krzywinski, Jacek
    SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Messerschmidt, Marc
    SLAC Natl Accelerator Lab, LCLS, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Bogan, Michael J.
    SLAC Natl Accelerator Lab, Stanford PULSE Inst, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Hampton, Christina Y.
    SLAC Natl Accelerator Lab, Stanford PULSE Inst, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Sierra, Raymond G.
    SLAC Natl Accelerator Lab, Stanford PULSE Inst, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA..
    Frank, Matthias
    Lawrence Livermore Natl Lab, 7000 East Ave,Mail Stop L-211, Livermore, CA 94551 USA..
    Shoeman, Robert L.
    Lomb, Lukas
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany..
    Foucar, Lutz
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.;Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Epp, Sascha W.
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany..
    Rolles, Daniel
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.;Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Kansas State Univ, Dept Phys, JR Macdonald Lab, 116 Cardwell Hall, Manhattan, KS 66506 USA..
    Rudenko, Artem
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany.;Kansas State Univ, Dept Phys, JR Macdonald Lab, 116 Cardwell Hall, Manhattan, KS 66506 USA..
    Hartmann, Robert
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany..
    Hartmann, Andreas
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany..
    Kimmel, Nils
    Max Planck Inst Halbleiterlabor, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany.;Max Planck Inst Extraterr Phys, Giessenbachstr, D-85741 Garching, Germany..
    Holl, Peter
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany..
    Weidenspointner, Georg
    Max Planck Inst Halbleiterlabor, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany.;Max Planck Inst Extraterr Phys, Giessenbachstr, D-85741 Garching, Germany..
    Rudek, Benedikt
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany..
    Erk, Benjamin
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany..
    Kassemeyer, Stephan
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany..
    Schlichting, Ilme
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.;Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Strueder, Lothar
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany.;Univ Siegen, Emmy Noether Campus,Walter Flex Str 3, D-57068 Siegen, Germany..
    Ullrich, Joachim
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany.;Phys Tech Bundesanstalt, Bundesallee 100, D-38116 Braunschweig, Germany..
    Schmidt, Carlo
    Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Max Planck Inst Kernphys, Saupfercheckweg 1, D-69117 Heidelberg, Germany..
    Krasniqi, Faton
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.;Max Planck Adv Study Grp, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Hauser, Guenter
    Max Planck Inst Halbleiterlabor, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany.;Max Planck Inst Extraterr Phys, Giessenbachstr, D-85741 Garching, Germany..
    Reich, Christian
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany..
    Soltau, Heike
    PNSensor GmbH, Otto Hahn Ring 6, D-81739 Munich, Germany..
    Schorb, Sebastian
    Tech Univ Berlin, Inst Opt & Atomare Phys, Hardenbergstr 36, D-10623 Berlin, Germany..
    Hirsemann, Helmut
    DESY, Photon Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Wunderer, Cornelia
    DESY, Photon Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Graafsma, Heinz
    DESY, Photon Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Chapman, Henry
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.;Univ Hamburg, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany..
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. European XFEL, Albert Einstein Ring 19, D-22761 Hamburg, Germany..
    Single-shot diffraction data from the Mimivirus particle using an X-ray free-electron laser2016Inngår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 3, artikkel-id UNSP 160060Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Free-electron lasers (FEL) hold the potential to revolutionize structural biology by producing X-ray pules short enough to outrun radiation damage, thus allowing imaging of biological samples without the limitation from radiation damage. Thus, a major part of the scientific case for the first FELs was three-dimensional (3D) reconstruction of non-crystalline biological objects. In a recent publication we demonstrated the first 3D reconstruction of a biological object from an X-ray FEL using this technique. The sample was the giant Mimivirus, which is one of the largest known viruses with a diameter of 450 nm. Here we present the dataset used for this successful reconstruction. Data-analysis methods for single-particle imaging at FELs are undergoing heavy development but data collection relies on very limited time available through a highly competitive proposal process. This dataset provides experimental data to the entire community and could boost algorithm development and provide a benchmark dataset for new algorithms.

  • 9.
    Espinoza, Shirly
    et al.
    Czech Acad Sci, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic..
    Neuber, Gerd
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, Ctr Free Electron Laser Sci, Adv Study Grp APOG, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Brooks, Christopher D.
    Czech Acad Sci, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic..
    Besner, Bastian
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, Ctr Free Electron Laser Sci, Adv Study Grp APOG, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Hashemi, Maryam
    4 DOS GmbH, Wehmerweg 26, D-22529 Hamburg, Germany..
    Ruebhausen, Michael
    Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, Ctr Free Electron Laser Sci, Adv Study Grp APOG, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany..
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Czech Acad Sci, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic.; Chalmers, Dept Phys, Condensed Matter Phys, Kemigarden 1, SE-41296 Gothenburg, Sweden..
    User oriented end-station on VUV pump-probe magneto-optical ellipsometry at ELI beamlines2017Inngår i: Applied Surface Science, ISSN 0169-4332, E-ISSN 1873-5584, Vol. 421, nr Part B, s. 378-382Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    A state of the art ellipsometer for user operations is being implemented at ELI Beamlines in Prague, Czech Republic. It combines three of the most promising and exotic forms of ellipsometry: VUV, pump-probe and magneto-optical ellipsometry. This new ellipsometer covers a spectral operational range from the NIR up to the VUV, with high through-put between 1 and 40 eV. The ellipsometer also allows measurements of magneto-optical spectra with a 1 kHz switchable magnetic field of up to 1.5 T across the sample combining ellipsometry and Kerr spectroscopy measurements in an unprecedented spectral range. This form of generalized ellipsometry enables users to address diagonal and off-diagonal components of the dielectric tensor within one measurement. Pump-probe measurements enable users to study the dynamic behaviour of the dielectric tensor in order to resolve the time-domain phenomena in the femto to 100 ns range.

  • 10. Gorkhover, Tais
    et al.
    Ulmer, Anatoli
    Ferguson, Ken
    Bucher, Max
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Bruza, Petr
    Carron, Sebastian
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Krzywinski, Jacek
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Morgan, Andrew
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Müller, Maria
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rupp, Daniela
    Sauppe, Mario
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Swiggers, Michelle
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Williams, Garth
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Chapman, Henry N.
    Faigel, Gyula
    Möller, Thomas
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bostedt, Christoph
    Femtosecond X-ray Fourier holography imaging of free-flying nanoparticles2018Inngår i: Nature Photonics, ISSN 1749-4885, E-ISSN 1749-4893, Vol. 12, s. 150-153Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 11.
    Hantke, Max F.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    John, Katja
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, Duane
    Martin, Andrew V.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Larsson, Daniel S.D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ingelman, Margareta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Uetrecht, Charlotte
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liang, Mengning
    Stellato, Francesco
    DePonte, Daniel P.
    Bari, Sadia
    Hartmann, Robert
    Kimmel, Nils
    Kirian, Richard A.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Schorb, Sebastian
    Ferguson, Ken
    Bostedt, Christoph
    Carron, Sebastian
    Bozek, John D.
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Foucar, Lutz
    Epp, Sascha W.
    Chapman, Henry N.
    Barty, Anton
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    A data set from flash X-ray imaging of carboxysomes2016Inngår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 3, artikkel-id 160061Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Ultra-intense femtosecond X-ray pulses from X-ray lasers permit structural studies on single particles and biomolecules without crystals. We present a large data set on inherently heterogeneous, polyhedral carboxysome particles. Carboxysomes are cell organelles that vary in size and facilitate up to 40% of Earth’s carbon fixation by cyanobacteria and certain proteobacteria. Variation in size hinders crystallization. Carboxysomes appear icosahedral in the electron microscope. A protein shell encapsulates a large number of Rubisco molecules in paracrystalline arrays inside the organelle. We used carboxysomes with a mean diameter of 115±26 nm from Halothiobacillus neapolitanus. A new aerosol sample-injector allowed us to record 70,000 low-noise diffraction patterns in 12 min. Every diffraction pattern is a unique structure measurement and high-throughput imaging allows sampling the space of structural variability. The different structures can be separated and phased directly from the diffraction data and open a way for accurate, high-throughput studies on structures and structural heterogeneity in biology and elsewhere.

  • 12.
    Hantke, Max F.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    John, Katja
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, N. Duane
    Martin, Andrew V.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S.D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Gijs, van der Schot
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ingelman, Margareta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liang, Mengning
    Stellato, Francesco
    DePonte, Daniel P.
    Hartmann, Robert
    Kimmel, Nils
    Kirian, Richard A.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Schorb, Sebastian
    Ferguson, Ken
    Bostedt, Christoph
    Carron, Sebastian
    Bozek, John D.
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Epp, Sascha
    Chapman, Henry N.
    Barty, Anton
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser2014Inngår i: Nature Photonics, ISSN 1749-4885, E-ISSN 1749-4893, Vol. 8, nr 12, s. 943-949Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    We overcome two of the most daunting challenges in single-particle diffractive imaging: collecting many high-quality diffraction patterns on a small amount of sample and separating components from mixed samples. We demonstrate this on carboxysomes, which are polyhedral cell organelles that vary in size and facilitate up to 40% of Earth's carbon fixation. A new aerosol sample-injector allowed us to record 70,000 low-noise diffraction patterns in 12 min with the Linac Coherent Light Source running at 120 Hz. We separate different structures directly from the diffraction data and show that the size distribution is preserved during sample delivery. We automate phase retrieval and avoid reconstruction artefacts caused by missing modes. We attain the highest-resolution reconstructions on the smallest single biological objects imaged with an X-ray laser to date. These advances lay the foundations for accurate, high-throughput structure determination by flash-diffractive imaging and offer a means to study structure and structural heterogeneity in biology and elsewhere.

  • 13.
    Hantke, Max Felix
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Univ Oxford, Dept Chem, Chem Res Lab, 12 Mansfield Rd, Oxford OX1 3TA, England.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Kulyk, Olena
    Acad Sci Czech Republ, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, CZ-18221 Prague, Czech Republic.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Reddy, Hemanth K.N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Kirian, Richard A.
    Arizona State Univ, Dept Phys, 550 E Tyler Dr, Tempe, AZ 85287 USA.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republ, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, CZ-18221 Prague, Czech Republic;Chalmers Univ Technol, Dept Phys, Condensed Matter Phys, Gothenburg, Sweden.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republ, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, CZ-18221 Prague, Czech Republic.
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Lawrence Berkeley Natl Lab, NERSC, Berkeley, CA USA.
    Rayleigh-scattering microscopy for tracking and sizing nanoparticles in focused aerosol beams2018Inngår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 5, s. 673-680Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Ultra-bright femtosecond X-ray pulses generated by X-ray free-electron lasers (XFELs) can be used to image high-resolution structures without the need for crystallization. For this approach, aerosol injection has been a successful method to deliver 70-2000 nm particles into the XFEL beam efficiently and at low noise. Improving the technique of aerosol sample delivery and extending it to single proteins necessitates quantitative aerosol diagnostics. Here a lab-based technique is introduced for Rayleigh-scattering microscopy allowing us to track and size aerosolized particles down to 40 nm in diameter as they exit the injector. This technique was used to characterize the 'Uppsala injector', which is a pioneering and frequently used aerosol sample injector for XFEL single-particle imaging. The particle-beam focus, particle velocities, particle density and injection yield were measured at different operating conditions. It is also shown how high particle densities and good injection yields can be reached for large particles (100-500 nm). It is found that with decreasing particle size, particle densities and injection yields deteriorate, indicating the need for different injection strategies to extend XFEL imaging to smaller targets, such as single proteins. This work demonstrates the power of Rayleigh-scattering microscopy for studying focused aerosol beams quantitatively. It lays the foundation for lab-based injector development and online injection diagnostics for XFEL research. In the future, the technique may also find application in other fields that employ focused aerosol beams, such as mass spectrometry, particle deposition, fuel injection and three-dimensional printing techniques.

  • 14.
    Iwan, Bianca
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bergh, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Schorb, Sebastian
    Thomas, Heiko
    Rupp, Daniela
    Gorkhover, Tais
    Adolph, Markus
    Bostedt, Christoph
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Explosion, ion acceleration and molecular fragmentation of methane clusters in the pulsed beam of a free-electron laser2012Inngår i: Physical Review A. Atomic, Molecular, and Optical Physics, ISSN 1050-2947, E-ISSN 1094-1622, Vol. 86, nr 3, s. 033201-Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    X-ray lasers offer new possibilities for creating and probing extreme states of matter. We used intense and short x-ray pulses from the FLASH soft x-ray laser to trigger the explosions of CH4 and CD4 molecules and their clusters. The results show that the explosion dynamics depends on cluster size and indicate a transition from Coulomb explosion to hydrodynamic expansion in larger clusters. The explosion of CH4 and CD4 clusters shows a strong isotope effect: The heavier deuterons acquire higher kinetic energies than the lighter protons. This may be due to an extended inertial confinement of deuterons vs. protons near a rapidly charging cluster core during exposure.

  • 15.
    Iwan, Bianca S
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andrejczuk, A.
    Abreu, E.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bergh, M.
    Caleman, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nelson, A. J.
    Bajt, S.
    Chalupsky, J.
    Chapman, H. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Faeustlin, R. R.
    Hajkova, V.
    Heimann, P. A.
    Hjörvarsson, Björgvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Materialfysik.
    Juha, L.
    Klinger, D.
    Krzywinski, J.
    Nagler, B.
    Pålsson, Gunnar Karl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Materialfysik.
    Singer, W.
    Seibert, Marvin M.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sobierajski, R.
    Toleikis, S.
    Tschentscher, T.
    Vinko, S. M.
    Lee, R. W.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    TOF-OFF: A method for determining focal positions in tightly focused free-electron laser experiments by measurement of ejected ions2011Inngår i: High Energy Density Physics, ISSN 1574-1818, Vol. 7, nr 4, s. 336-342Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Pulse intensities greater than 1017 Watt/cm2 were reached at the FLASH soft X-ray laser in Hamburg, Germany, using an off-axis parabolic mirror to focus 15 fs pulses of 5–70 μJ energy at 13.5 nm wavelength to a micron-sized spot. We describe the interaction of such pulses with niobium and vanadium targets and their deuterides. The beam produced craters in the solid targets, and we measured the kinetic energy of ions ejected from these craters. Ions with several keV kinetic energy were observed from craters approaching 5 μm in depth when the sample was at best focus. We also observed the onset of saturation in both ion acceleration and ablation with pulse intensities exceeding 1016 W/cm2, when the highest detected ion energies and the crater depths tend to saturate with increasing intensity.

    A general difficulty in working with micron and sub-micron focusing optics is finding the exact focus of the beam inside a vacuum chamber. Here we propose a direct method to measure the focal position to a resolution better than the Rayleigh length. The method is based on the correlation between the energies of ejected ions and the physical dimensions of the craters. We find that the focus position can be quickly determined from the ion time-of-flight (TOF) data as the target is scanned through the expected focal region. The method does not require external access to the sample or venting the vacuum chamber. Profile fitting employed to analyze the TOF data can extend resolution beyond the actual scanning step size.

  • 16. Johansson, Linda C
    et al.
    Arnlund, David
    White, Thomas A
    Katona, Gergely
    DePonte, Daniel P
    Weierstall, Uwe
    Doak, R Bruce
    Shoeman, Robert L
    Lomb, Lukas
    Malmerberg, Erik
    Davidsson, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - Ångström, Fysikalisk kemi.
    Nass, Karol
    Liang, Mengning
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Bajt, Sasa
    Barthelmess, Miriam
    Barty, Anton
    Bogan, Michael J
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D
    Caleman, Carl
    Coffee, Ryan
    Coppola, Nicola
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Epp, Sascha W
    Erk, Benjamin
    Fleckenstein, Holger
    Foucar, Lutz
    Graafsma, Heinz
    Gumprecht, Lars
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hampton, Christina Y
    Hartmann, Robert
    Hartmann, Andreas
    Hauser, Gunter
    Hirsemann, Helmut
    Holl, Peter
    Hunter, Mark S
    Kassemeyer, Stephan
    Kimmel, Nils
    Kirian, Richard A
    Maia, Filipe R N C
    Marchesini, Stefano
    Martin, Andrew V
    Reich, Christian
    Rolles, Daniel
    Rudek, Benedikt
    Rudenko, Artem
    Schlichting, Ilme
    Schulz, Joachim
    Seibert, M Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sierra, Raymond G
    Soltau, Heike
    Starodub, Dmitri
    Stellato, Francesco
    Stern, Stephan
    Struder, Lothar
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ullrich, Joachim
    Wahlgren, Weixiao Y
    Wang, Xiaoyu
    Weidenspointner, Georg
    Wunderer, Cornelia
    Fromme, Petra
    Chapman, Henry N
    Spence, John C H
    Neutze, Richard
    Lipidic phase membrane protein serial femtosecond crystallography2012Inngår i: Nature Methods, ISSN 1548-7091, E-ISSN 1548-7105, Vol. 9, nr 3, s. 263-265Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    X-ray free electron laser (X-FEL)-based serial femtosecond crystallography is an emerging method with potential to rapidly advance the challenging field of membrane protein structural biology. Here we recorded interpretable diffraction data from micrometer-sized lipidic sponge phase crystals of the Blastochloris viridis photosynthetic reaction center delivered into an X-FEL beam using a sponge phase micro-jet.

  • 17.
    Jönsson, H. Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Caleman, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik. Center for Free- Electron Laser Science, Deutsches Elektronen-Synchrotron.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Czech Academy of Science, Chalmers University of Technology.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hit detection in serial femtosecond crystallography using X-ray spectroscopy of plasma emission2017Inngår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 4, nr 6, s. 778-784Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Serial femtosecond crystallography is an emerging and promising method for determining protein structures, making use of the ultrafast and bright X-ray pulses from X-ray free-electron lasers. The upcoming X-ray laser sources will produce well above 1000pulses per second and will pose a new challenge: how to quickly determine successful crystal hits and avoid a high-rate data deluge. Proposed here is a hit-finding scheme based on detecting photons from plasma emission after the sample has been intercepted by the X-ray laser. Plasma emission spectra are simulated for systems exposed to high-intensity femtosecond pulses, for both protein crystals and the liquid carrier systems that are used for sample delivery. The thermal radiation from the glowing plasma gives a strong background in the XUV region that depends on the intensity of the pulse, around the emission lines from light elements (carbon, nitrogen, oxygen). Sample hits can be reliably distinguished from the carrier liquid based on the characteristic emission lines from heavier elements present only in the sample, such as sulfur. For buffer systems with sulfur present, selenomethionine substitution is suggested, where the selenium emission lines could be used both as an indication of a hit and as an aid in phasing and structural reconstruction of the protein.

  • 18. Koopmann, Rudolf
    et al.
    Cupelli, Karolina
    Redecke, Lars
    Nass, Karol
    DePonte, Daniel P
    White, Thomas A
    Stellato, Francesco
    Rehders, Dirk
    Liang, Mengning
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Bajt, Sasa
    Barthelmess, Miriam
    Barty, Anton
    Bogan, Michael J
    Bostedt, Christoph
    Boutet, Sebastien
    Bozek, John D
    Caleman, Carl
    Coppola, Nicola
    Davidsson, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - Ångström, Fysikalisk kemi.
    Doak, R Bruce
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Epp, Sascha W
    Erk, Benjamin
    Fleckenstein, Holger
    Foucar, Lutz
    Graafsma, Heinz
    Gumprecht, Lars
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hampton, Christina Y
    Hartmann, Andreas
    Hartmann, Robert
    Hauser, Gunter
    Hirsemann, Helmut
    Holl, Peter
    Hunter, Mark S
    Kassemeyer, Stephan
    Kirian, Richard A
    Lomb, Lukas
    Maia, Filipe R N C
    Kimmel, Nils
    Martin, Andrew V
    Messerschmidt, Marc
    Reich, Christian
    Rolles, Daniel
    Rudek, Benedikt
    Rudenko, Artem
    Schlichting, Ilme
    Schulz, Joachim
    Seibert, M Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Shoeman, Robert L
    Sierra, Raymond G
    Soltau, Heike
    Stern, Stephan
    Struder, Lothar
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ullrich, Joachim
    Wang, Xiaoyu
    Weidenspointner, Georg
    Weierstall, Uwe
    Williams, Garth J
    Wunderer, Cornelia B
    Fromme, Petra
    Spence, John C H
    Stehle, Thilo
    Chapman, Henry N
    Betzel, Christian
    Duszenko, Michael
    In vivo protein crystallization opens new routes in structural biology2012Inngår i: Nature Methods, ISSN 1548-7091, E-ISSN 1548-7105, Vol. 9, nr 3, s. 259-262Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Protein crystallization in cells has been observed several times in nature. However, owing to their small size these crystals have not yet been used for X-ray crystallographic analysis. We prepared nano-sized in vivo–grown crystals of Trypanosoma brucei enzymes and applied the emerging method of free-electron laser-based serial femtosecond crystallography to record interpretable diffraction data. This combined approach will open new opportunities in structural systems biology.

  • 19.
    Krikunova, Maria
    et al.
    Tech Univ Berlin, Inst Opt & Atomare Phys, Str 17 Juni 135,ER 1-1, D-10623 Berlin, Germany..
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republic, Inst Phys, ELI Beamlines, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic.
    Atomic and molecular systems under intense X-ray radiation2016Inngår i: Ultrafast Dynamics Driven by Intense Light Pulses: From Atoms to Solids, from Lasers to Intense X-rays, Switzerland: Springer, 2016, 86, Vol. 86, s. 319-339Kapittel i bok, del av antologi (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    The review covers recent progress in the development of X-ray pulse metrology essential for experiments at Free Electron Lasers. The scientific section is focused on time-resolved studies of ionization dynamics of atoms, molecules and (bio-)nanoparticles. We discuss the role of ionization dynamics for high resolution imaging of bio-and bio-like nanoparticles and illustrate the potential for multidirectional imaging of unique non-reproducible samples.

  • 20. Lomb, Lukas
    et al.
    Barends, Thomas R. M.
    Kassemeyer, Stephan
    Aquila, Andrew
    Epp, Sascha W.
    Erk, Benjamin
    Foucar, Lutz
    Hartmann, Robert
    Rudek, Benedikt
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Shoeman, Robert L.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bajt, Sasa
    Barthelmess, Miriam
    Barty, Anton
    Bogan, Michael J.
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D.
    Caleman, Carl
    Coffee, Ryan
    Coppola, Nicola
    DePonte, Daniel P.
    Doak, R. Bruce
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Fleckenstein, Holger
    Fromme, Petra
    Gebhardt, Maike
    Graafsma, Heinz
    Gumprecht, Lars
    Hampton, Christina Y.
    Hartmann, Andreas
    Hauser, Guenter
    Hirsemann, Helmut
    Holl, Peter
    Holton, James M.
    Hunter, Mark S.
    Kabsch, Wolfgang
    Kimmel, Nils
    Kirian, Richard A.
    Liang, Mengning
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Meinhart, Anton
    Marchesini, Stefano
    Martin, Andrew V.
    Nass, Karol
    Reich, Christian
    Schulz, Joachim
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sierra, Raymond
    Soltau, Heike
    Spence, John C. H.
    Steinbrener, Jan
    Stellato, Francesco
    Stern, Stephan
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Wang, Xiaoyu
    Weidenspointner, Georg
    Weierstall, Uwe
    White, Thomas A.
    Wunderer, Cornelia
    Chapman, Henry N.
    Ullrich, Joachim
    Strüder, Lothar
    Schlichting, Ilme
    Radiation damage in protein serial femtosecond crystallography using an x-ray free-electron laser2011Inngår i: Physical Review B. Condensed Matter and Materials Physics, ISSN 1098-0121, E-ISSN 1550-235X, Vol. 84, nr 21, s. 214111-1-214111-6Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    X-ray free-electron lasers deliver intense femtosecond pulses that promise to yield high resolution diffraction data of nanocrystals before the destruction of the sample by radiation damage. Diffraction intensities of lysozyme nanocrystals collected at the Linac Coherent Light Source using 2 keV photons were used for structure determination by molecular replacement and analyzed for radiation damage as a function of pulse length and fluence. Signatures of radiation damage are observed for pulses as short as 70 fs. Parametric scaling used in conventional crystallography does not account for the observed effects.

  • 21.
    Lundholm, Ida V.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bruza, Petr
    Bucher, Max
    Carron, Sebastian
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ferguson, Ken
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Krzywinski, Jacek
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Morgan, Andrew
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Müller, Maria
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rupp, Daniela
    Sauppe, Mario
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Swiggers, Michelle
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Ulmer, Anatoli
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Williams, Garth
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Faigel, Gyula
    Chapman, Henry N.
    Möller, Thomas
    Bostedt, Christoph
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Gorkhover, Tais
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Considerations for three-dimensional image reconstruction from experimental data in coherent diffractive imaging2018Inngår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 5, s. 531-541Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 22.
    Munke, Anna
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Awel, Salah
    Ayyer, Kartik
    Barty, Anton
    Bean, Richard J.
    Berntsen, Peter
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sébastien
    Bucher, Maximilian
    Chapman, Henry N.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DeMirci, Hasan
    Elser, Veit
    Fromme, Petra
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Higashiura, Akifumi
    Hogue, Brenda G.
    Hosseinizadeh, Ahmad
    Kim, Yoonhee
    Kirian, Richard A.
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Lan, Ti-Yen
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liu, Haiguang
    Loh, N. Duane
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mancuso, Adrian P.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nakagawa, Atsushi
    Nam, Daewoong
    Nelson, Garrett
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ourmazd, Abbas
    Rose, Max
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Schwander, Peter
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Sierra, Raymond G.
    Song, Changyong
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Vartanyants, Ivan A.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Wiedorn, Max O.
    Williams, Garth J.
    Xavier Paulraj, Lourdu
    Yoon, Chun Hong
    Zook, James
    Coherent diffraction of single Rice Dwarf virus particles using hard X-rays at the Linac Coherent Light Source2016Inngår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 3, s. 160064:1-12, artikkel-id 160064Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 23.
    Mühlig, Kerstin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ganan-Calvo, Alfonso M.
    Univ Seville, ETSI, Dept Ingn Aerospacial & Mecan Fluidos, ES-41092 Seville, Spain.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republ, Inst Phys, ELI Beamlines, CZ-18221 Prague, Czech Republic;Chalmers Univ Technol, Dept Phys, Condensed Matter Phys, SE-41258 Gothenburg, Sweden.
    Larsson, Daniel S D
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republ, Inst Phys, ELI Beamlines, CZ-18221 Prague, Czech Republic.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. KTH AlbaNova, KTH Royal Inst Technol, Dept Appl Phys, Biomed & Xray Phys, SE-10691 Stockholm, Sweden.
    Nanometre-sized droplets from a gas dynamic virtual nozzle2019Inngår i: Journal of applied crystallography, ISSN 0021-8898, E-ISSN 1600-5767, Vol. 52, s. 800-808Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    This paper reports on improved techniques to create and characterize nanometre-sized droplets from dilute aqueous solutions by using a gas dynamic virtual nozzle (GDVN). It describes a method to measure the size distribution of uncharged droplets, using an environmental scanning electron microscope, and provides theoretical models for the droplet sizes created. The results show that droplet sizes can be tuned by adjusting the gas and liquid flow rates in the GDVN, and at the lowest liquid flow rates, the size of the water droplets peaks at about 120nm. This droplet size is similar to droplet sizes produced by electrospray ionization but requires neither electrolytes nor charging of the solution. The results presented here identify a new operational regime for GDVNs and show that predictable droplet sizes, comparable to those obtained by electrospray ionization, can be produced by purely mechanical means in GDVNs.

  • 24.
    Naumova, Maria
    et al.
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany;Hamburg Univ, Inst Nanaostruktur & Festkorperphys, D-20355 Hamburg, Germany.
    Khakhulin, Dmitry
    Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, D-22761 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Rebarz, Mateusz
    Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, Prague 18221, Czech Republic.
    Rohrmueller, Martin
    Paderborn Univ, Dept Phys, D-33098 Paderborn, Germany.
    Dicke, Benjamin
    Hamburg Univ, Inst Nanaostruktur & Festkorperphys, D-20355 Hamburg, Germany.
    Biednov, Mykola
    Hamburg Univ, Inst Nanaostruktur & Festkorperphys, D-20355 Hamburg, Germany.
    Britz, Alexander
    Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, D-22761 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Espinoza, Shirly
    Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, Prague 18221, Czech Republic.
    Grimm-Lebsanft, Benjamin
    Hamburg Univ, Inst Nanaostruktur & Festkorperphys, D-20355 Hamburg, Germany.
    Kloz, Miroslav
    Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, Prague 18221, Czech Republic.
    Kretzschmar, Norman
    European Synchrotron Radiat Facil, F-38000 Grenoble, France.
    Neuba, Adam
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany.
    Ortmeyer, Jochen
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany.
    Schoch, Roland
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, Prague 18221, Czech Republic;Chalmers Univ Technol, Condensed Matter Phys, Dept Phys, Gothenburg, Sweden;DESY, Ctr Free Elect Laser Sci, D-22607 Hamburg, Germany.
    Bauer, Matthias
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany.
    Bressler, Christian
    Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, D-22761 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Schmidt, Wolf Gero
    Paderborn Univ, Dept Phys, D-33098 Paderborn, Germany.
    Henkel, Gerald
    Paderborn Univ, Dept Chem, D-33098 Paderborn, Germany.
    Ruebhausen, Michael
    Hamburg Univ, Inst Nanaostruktur & Festkorperphys, D-20355 Hamburg, Germany.
    Structural dynamics upon photoexcitation-induced charge transfer in a dicopper(I)-disulfide complex2018Inngår i: Physical Chemistry, Chemical Physics - PCCP, ISSN 1463-9076, E-ISSN 1463-9084, Vol. 20, nr 9, s. 6274-6286Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    The structural dynamics of charge-transfer states of nitrogen-ligated copper complexes has been extensively investigated in recent years following the development of pump-probe X-ray techniques. In this study we extend this approach towards copper complexes with sulfur coordination and investigate the influence of charge transfer states on the structure of a dicopper(I) complex with coordination by bridging disulfide ligands and additionally tetramethylguanidine units [CuI2(NSSN)(2)](2+). In order to directly observe and refine the photoinduced structural changes in the solvated complex we applied picosecond pump-probe X-ray absorption spectroscopy (XAS) and wide-angle X-ray scattering (WAXS). Additionally, the ultrafast evolution of the electronic excited states was monitored by femtosecond transient absorption spectroscopy in the UV-Vis probe range. DFT calculations were used to predict molecular geometries and electronic structures of the ground and metal-to-ligand charge transfer states with singlet and triplet spin multiplicities, i.e. S-0, (MLCT)-M-1 and (MLCT)-M-3, respectively. Combining these techniques we elucidate the electronic and structural dynamics of the solvated complex upon photoexcitation to the MLCT states. In particular, femtosecond optical transient spectroscopy reveals three distinct timescales of 650 fs, 10 ps and 4100 ps, which were assigned as internal conversion to the ground state (Sn -> S-0), intersystem crossing (MLCT)-M-1 -> (MLCT)-M-3, and subsequent relaxation of the triplet to the ground state, respectively. Experimental data collected using both X-ray techniques are in agreement with the DFT-predicted structure for the triplet state, where coordination bond lengths change and one of the S-S bridges is cleaved, causing the movement of two halves of the molecule relative to each other. Extended X-ray absorption fine structure spectroscopy resolves changes in Cu-ligand bond lengths with precision on the order of 0.01 angstrom, whereas WAXS is sensitive to changes in the global shape related to relative movement of parts of the molecule. The results presented herein widen the knowledge on the electronic and structural dynamics of photoexcited copper-sulfur complexes and demonstrate the potential of combining the pump-probe X-ray absorption and scattering for studies on photoinduced structural dynamics in copper-based coordination complexes.

  • 25. Nelson, A. J.
    et al.
    Toleikis, S.
    Chapman, H.
    Bajt, S.
    Krzywinski, J.
    Chalupsky, J.
    Juha, L.
    Cihelka, J.
    Hajkova, V.
    Vysin, L.
    Burian, T.
    Kozlova, M.
    Fäustlin, R. R.
    Nagler, B.
    Vinko, S. M.
    Whitcher, T.
    Dzelzainis, T.
    Renner, O.
    Saksl, K.
    Khorsand, A. R.
    Heimann, P. A.
    Sobierajski, R.
    Klinger, D.
    Jurek, M.
    Pelka, J.
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Fajardo, M.
    Wark, J. S.
    Riley, D.
    Tschentscher, T.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Lee, R. W.
    Soft x-ray free electron laser microfocus for exploring matter under extreme conditions2009Inngår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 17, nr 20, s. 18271-18278Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    We have focused a beam (BL3) of FLASH (Free-electron LASer in Hamburg: lambda = 13.5 nm, pulse length 15 fs, pulse energy 10-40 mu J, 5Hz) using a fine polished off-axis parabola having a focal length of 270 mm and coated with a Mo/Si multilayer with an initial reflectivity of 67% at 13.5 nm. The OAP was mounted and aligned with a picomotor controlled six-axis gimbal. Beam imprints on poly(methyl methacrylate) -PMMA were used to measure focus and the focused beam was used to create isochoric heating of various slab targets. Results show the focal spot has a diameter of <= 1 mu m. Observations were correlated with simulations of best focus to provide further relevant information.

  • 26.
    Pietrini, Alberto
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, N. Duane
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sébastien
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A statistical approach to detect protein complexes at X-ray free electron laser facilities2018Inngår i: Communications Physics, E-ISSN 2399-3650, Vol. 1, s. 92:1-11, artikkel-id 92Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 27.
    Rath, Asawari D.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Fleckenstein, Holger
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liang, Mengning
    Stellato, Francesco
    Kirian, Richard
    Bean, Richard
    Barty, Anton
    Galli, Lorenzo
    Nass, Karol
    Barthelmess, Miriam
    Aquila, Andrew
    Toleikis, Sven
    Treusch, Rolf
    Roling, Sebastian
    Wöstmann, Michael
    Zacharias, Helmut
    Chapman, Henry N.
    Bajt, Saša
    DePonte, Daniel
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Explosion dynamics of sucrose nanospheres monitored by time of flight spectrometry and coherent diffractive imaging at the split-and-delay beam line of the FLASH soft X-ray laser2014Inngår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 22, nr 23, s. 28914-28925Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    We use a Mach-Zehnder type autocorrelator to split and delay XUV pulses from the FLASH soft X-ray laser for triggering and subsequently probing the explosion of aerosolised sugar balls. FLASH was running at 182 eV photon energy with pulses of 70 fs duration. The delay between the pump-probe pulses was varied between zero and 5 ps, and the pulses were focused to reach peak intensities above 1016 W/cm2 with an off-axis parabola. The direct pulse triggered the explosion of single aerosolised sucrose nano-particles, while the delayed pulse probed the exploding structure. The ejected ions were measured by ion time of flight spectrometry, and the particle sizes were measured by coherent diffractive imaging. The results show that sucrose particles of 560-1000 nm diameter retain their size for about 500 fs following the first exposure. Significant sample expansion happens between 500 fs and 1 ps. We present simulations to support these observations.

  • 28. Thomas, H.
    et al.
    Helal, A.
    Hoffmann, K.
    Kandadai, N.
    Keto, J.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Iwan, Bianca Stella
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Adolph, M.
    Gorkhover, T.
    Rupp, D.
    Schorb, S.
    Möller, T.
    Doumy, G.
    DiMauro, L. F.
    Hoener, M.
    Murphy, B.
    Berrah, N.
    Messerschmidt, M.
    Bozek, J.
    Bostedt, C.
    Ditmire, T.
    Explosions of Xenon Clusters in Ultraintense Femtosecond X-Ray Pulses from the LCLS Free Electron Laser2012Inngår i: Physical Review Letters, ISSN 0031-9007, E-ISSN 1079-7114, Vol. 108, nr 13, artikkel-id 133401Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Explosions of large Xe clusters (< N > similar to 11 000) irradiated by femtosecond pulses of 850 eV x-ray photons focused to an intensity of up to 1017 W/cm(2) from the Linac Coherent Light Source were investigated experimentally. Measurements of ion charge-state distributions and energy spectra exhibit strong evidence for the formation of a Xe nanoplasma in the intense x-ray pulse. This x-ray produced Xe nanoplasma is accompanied by a three-body recombination and hydrodynamic expansion. These experimental results appear to be consistent with a model in which a spherically exploding nanoplasma is formed inside the Xe cluster and where the plasma temperature is determined by photoionization heating.

  • 29.
    van der Schot, Gijs
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DePonte, Daniel P.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Schulz, Joachim
    Kirian, Richard
    Liang, Mengning
    Stellato, Francesco
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Almeida, F. Nunes
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Odic, Dusko
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Martin, Andrew V.
    Schorb, Sebastian
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D.
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Epp, Sascha
    Foucar, Lutz
    Rudek, Benedikt
    Hartmann, Robert
    Kimmel, Nils
    Holl, Peter
    Englert, Lars
    Duane Loh, Ne-Te
    Chapman, Henry N.
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Imaging single cells in a beam of live cyanobacteria with an X-ray laser2015Inngår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 6, artikkel-id 5704Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    There exists a conspicuous gap of knowledge about the organization of life at mesoscopic levels. Ultra-fast coherent diffractive imaging with X-ray free-electron lasers can probe structures at the relevant length scales and may reach sub-nanometer resolution on micron-sized living cells. Here we show that we can introduce a beam of aerosolised cyanobacteria into the focus of the Linac Coherent Light Source and record diffraction patterns from individual living cells at very low noise levels and at high hit ratios. We obtain two-dimensional projection images directly from the diffraction patterns, and present the results as synthetic X-ray Nomarski images calculated from the complex-valued reconstructions. We further demonstrate that it is possible to record diffraction data to nanometer resolution on live cells with X-ray lasers. Extension to sub-nanometer resolution is within reach, although improvements in pulse parameters and X-ray area detectors will be necessary to unlock this potential.

  • 30.
    van der Schot, Gijs
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DePonte, Daniel P.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Schulz, Joachim
    Kirian, Richard A.
    Liang, Mengning
    Stellato, Francesco
    Bari, Sadia
    Iwan, Bianca
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nunes de Almeida, Francisca
    Odić, Duško
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S.D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Martin, Andrew V.
    Schorb, Sebastian
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D.
    Carron, Sebastian
    Ferguson, Ken
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Epp, Sascha W.
    Foucar, Lutz
    Rudek, Benedikt
    Erk, Benjamin
    Hartmann, Robert
    Kimmel, Nils
    Holl, Peter
    Englert, Lars
    Loh, N. Duane
    Chapman, Henry N.
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Open data set of live cyanobacterial cells imaged using an X-ray laser2016Inngår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 3, artikkel-id 160058Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Structural studies on living cells by conventional methods are limited to low resolution because radiation damage kills cells long before the necessary dose for high resolution can be delivered. X-ray free-electron lasers circumvent this problem by outrunning key damage processes with an ultra-short and extremely bright coherent X-ray pulse. Diffraction-before-destruction experiments provide high-resolution data from cells that are alive when the femtosecond X-ray pulse traverses the sample. This paper presents two data sets from micron-sized cyanobacteria obtained at the Linac Coherent Light Source, containing a total of 199,000 diffraction patterns. Utilizing this type of diffraction data will require the development of new analysis methods and algorithms for studying structure and structural variability in large populations of cells and to create abstract models. Such studies will allow us to understand living cells and populations of cells in new ways. New X-ray lasers, like the European XFEL, will produce billions of pulses per day, and could open new areas in structural sciences.

  • 31.
    Wiedorn, Max O.
    et al.
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Dept Phys, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Oberthuer, Dominik
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Bean, Richard
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Schubert, Robin
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Integrated Biol Infrastruct Life Sci Facil Europe, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Werner, Nadine
    Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Abbey, Brian
    La Trobe Univ, Ctr Excellence Adv Mol Imaging, La Trobe Inst Mol Sci, Dept Chem & Phys,ARC, Bundoora, Vic 3086, Australia.
    Aepfelbacher, Martin
    Univ Med Ctr Hamburg Eppendorf UKE, Inst Med Microbiol Virol & Hyg, D-20246 Hamburg, Germany.
    Adriano, Luigi
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Allahgholi, Aschkan
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Al-Qudami, Nasser
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Czech Acad Sci, ELI Beamlines, Inst Phys, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic;Chalmers Univ Technol, Dept Phys, Condensed Matter Phys, S-41296 Gothenburg, Sweden.
    Aplin, Steve
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Awel, Salah
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Ayyer, Kartik
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Bajt, Sasa
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Barak, Imrich
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Bari, Sadia
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Bielecki, Johan
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Botha, Sabine
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Boukhelef, Djelloul
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Brehm, Wolfgang
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Brockhauser, Sandor
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany;Hungarian Acad Sci, BRC, Temesvari Krt 62, H-6726 Szeged, Hungary.
    Cheviakov, Igor
    Univ Med Ctr Hamburg Eppendorf UKE, Inst Med Microbiol Virol & Hyg, D-20246 Hamburg, Germany.
    Coleman, Matthew A.
    Lawrence Livermore Natl Lab, 7000 East Ave, Livermore, CA 94550 USA.
    Cruz-Mazo, Francisco
    Univ Seville, Dept Ingn Aeroesp & Mecan Fluidos ETSI, Seville 41092, Spain.
    Danilevski, Cyril
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Darmanin, Connie
    La Trobe Univ, Ctr Excellence Adv Mol Imaging, La Trobe Inst Mol Sci, Dept Chem & Phys,ARC, Bundoora, Vic 3086, Australia.
    Doak, R. Bruce
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.
    Domaracky, Martin
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Doerner, Katerina
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Du, Yang
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Fangohr, Hans
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany;Univ Southampton, Engn & Environm, Southampton SO17 1BJ, Hants, England.
    Fleckenstein, Holger
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Frank, Matthias
    Lawrence Livermore Natl Lab, 7000 East Ave, Livermore, CA 94550 USA.
    Fromme, Petra
    Arizona State Univ, Sch Mol Sci & Biodesign, Ctr Appl Struct Discovery, Tempe, AZ 85287 USA.
    Ganan-Calvo, Alfonso M.
    Univ Seville, Dept Ingn Aeroesp & Mecan Fluidos ETSI, Seville 41092, Spain.
    Gevorkov, Yaroslav
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Hamburg Univ Technol, Vis Syst E2, Harburger Schlostr 20, D-21079 Hamburg, Germany.
    Giewekemeyer, Klaus
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Ginn, Helen Mary
    Div Struct Biol, Oxford OX3 7BN, England;Diamond Light Source, Res Complex Harwell, Diamond House,Harwell Sci & Innovat Campus, Didcot OX11 0DE, Oxon, England;Univ Oxford, Diamond House,Harwell Sci & Innovat Campus, Didcot OX11 0DE, Oxon, England.
    Graafsma, Heinz
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Mid Sweden Univ, Holmgatan 10, S-85170 Sundsvall, Sweden.
    Graceffa, Rita
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Greiffenberg, Dominic
    Paul Scherrer Inst, Forsch Str 111, CH-5232 Villigen, Switzerland.
    Gumprecht, Lars
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Goettlicher, Peter
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Czech Acad Sci, ELI Beamlines, Inst Phys, Na Slovance 2, Prague 18221, Czech Republic.
    Hauf, Steffen
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Heymann, Michael
    Max Planck Inst Biochem, Dept Cellular & Mol Biophys, D-82152 Martinsried, Germany.
    Holmes, Susannah
    La Trobe Univ, Ctr Excellence Adv Mol Imaging, La Trobe Inst Mol Sci, Dept Chem & Phys,ARC, Bundoora, Vic 3086, Australia.
    Horke, Daniel A.
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Hunter, Mark S.
    SLAC Natl Accelerator Lab, Linac Coherent Light Source, Menlo Pk, CA 94025 USA.
    Imlau, Siegfried
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Kaukher, Alexander
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Kim, Yoonhee
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Klyuev, Alexander
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Knoska, Juraj
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Dept Phys, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Kobe, Bostjan
    Univ Queensland, Inst Mol Biosci, Sch Chem & Mol Biosci, Brisbane, Qld 4072, Australia;Univ Queensland, Australian Infect Dis Res Ctr, Brisbane, Qld 4072, Australia.
    Kuhn, Manuela
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Kupitz, Christopher
    Univ Wisconsin, Phys Dept, 3135 N Maryland Ave, Milwaukee, WI 53211 USA.
    Kueper, Jochen
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Dept Phys, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Dept Chem, Martin Luther King Pl 6, D-20146 Hamburg, Germany.
    Lahey-Rudolph, Janine Mia
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Lubeck, Inst Biochem, Ctr Struct & Cell Biol Med, Ratzeburger Allee 160, D-23562 Lubeck, Germany.
    Laurus, Torsten
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Le Cong, Karoline
    Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Letrun, Romain
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Xavier, P. Lourdu
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Max Planck Inst Struct & Dynam Matter, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Maia, Luis
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Maia, Filipe R.N.C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Lawrence Berkeley Natl Lab, NERSC, Berkeley, CA 94720 USA.
    Mariani, Valerio
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Messerschmidt, Marc
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Metz, Markus
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Mezza, Davide
    Paul Scherrer Inst, Forsch Str 111, CH-5232 Villigen, Switzerland.
    Michelat, Thomas
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Mills, Grant
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Monteiro, Diana C. F.
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Morgan, Andrew
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Munke, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Muennich, Astrid
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Nette, Julia
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Nugent, Keith A.
    La Trobe Univ, Ctr Excellence Adv Mol Imaging, La Trobe Inst Mol Sci, Dept Chem & Phys,ARC, Bundoora, Vic 3086, Australia.
    Nuguid, Theresa
    Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Orville, Allen M.
    Diamond Light Source, Res Complex Harwell, Diamond House,Harwell Sci & Innovat Campus, Didcot OX11 0DE, Oxon, England;Univ Oxford, Diamond House,Harwell Sci & Innovat Campus, Didcot OX11 0DE, Oxon, England.
    Pandey, Suraj
    Univ Wisconsin, Phys Dept, 3135 N Maryland Ave, Milwaukee, WI 53211 USA.
    Pena, Gisel
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Villanueva-Perez, Pablo
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Poehlsen, Jennifer
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Previtali, Gianpietro
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Redecke, Lars
    Univ Med Ctr Hamburg Eppendorf UKE, Inst Med Microbiol Virol & Hyg, D-20246 Hamburg, Germany;Univ Lubeck, Inst Biochem, Ctr Struct & Cell Biol Med, Ratzeburger Allee 160, D-23562 Lubeck, Germany.
    Riekehr, Winnie Maria
    Univ Lubeck, Inst Biochem, Ctr Struct & Cell Biol Med, Ratzeburger Allee 160, D-23562 Lubeck, Germany.
    Rohde, Holger
    Univ Med Ctr Hamburg Eppendorf UKE, Inst Med Microbiol Virol & Hyg, D-20246 Hamburg, Germany.
    Round, Adam
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Safenreiter, Tatiana
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Sarrou, Iosifina
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Sato, Tokushi
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Schmidt, Marius
    Univ Wisconsin, Phys Dept, 3135 N Maryland Ave, Milwaukee, WI 53211 USA.
    Schmitt, Bernd
    Paul Scherrer Inst, Forsch Str 111, CH-5232 Villigen, Switzerland.
    Schoenherr, Robert
    Univ Lubeck, Inst Biochem, Ctr Struct & Cell Biol Med, Ratzeburger Allee 160, D-23562 Lubeck, Germany.
    Schulz, Joachim
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Sellberg, Jonas A.
    KTH Royal Inst Technol, AlbaNova Univ Ctr, Dept Appl Phys, Biomed & Xray Phys, S-10691 Stockholm, Sweden.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seuring, Carolin
    SAS, Inst Mol Biol, Dubravska Cesta 21, Bratislava 84551, Slovakia.
    Shelby, Megan L.
    Lawrence Livermore Natl Lab, 7000 East Ave, Livermore, CA 94550 USA.
    Shoeman, Robert L.
    Max Planck Inst Med Res, Jahnstr 29, D-69120 Heidelberg, Germany.
    Sikorski, Marcin
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Silenzi, Alessandro
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Stan, Claudiu A.
    Rutgers Univ Newark, Phys Dept, Newark, NJ 07102 USA.
    Shi, Xintian
    Paul Scherrer Inst, Forsch Str 111, CH-5232 Villigen, Switzerland.
    Stern, Stephan
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Sztuk-Dambietz, Jola
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Szuba, Janusz
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Tolstikova, Aleksandra
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Trebbin, Martin
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Buffalo, Dept Chem, 359 Nat Sci Complex, Buffalo, NY 14260 USA;Univ Hamburg, Inst Nanostruct & Solid State Phys, Dept Phys, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Trunk, Ulrich
    DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Vagovic, Patrik
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Ve, Thomas
    Griffith Univ, Inst Glyc, Southport, Qld 4222, Australia.
    Weinhausen, Britta
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    White, Thomas A.
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Wrona, Krzysztof
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Xu, Chen
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Yefanov, Oleksandr
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Zatsepin, Nadia
    Arizona State Univ, Dept Phys, Tempe, AZ 85287 USA.
    Zhang, Jiaguo
    Paul Scherrer Inst, Forsch Str 111, CH-5232 Villigen, Switzerland.
    Perbandt, Markus
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Med Ctr Hamburg Eppendorf UKE, Inst Med Microbiol Virol & Hyg, D-20246 Hamburg, Germany.
    Mancuso, Adrian P.
    European XFEL GmbH, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Betzel, Christian
    Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Inst Biochem & Mol Biol, Lab Struct Biol Infect & Inflammat, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Integrated Biol Infrastruct Life Sci Facil Europe, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany.
    Chapman, Henry
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Dept Phys, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany;Univ Hamburg, Hamburg Ctr Ultrafast Imaging, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany.
    Barty, Anton
    DESY, Ctr Free Electron Laser Sci, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany.
    Megahertz serial crystallography2018Inngår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 9, artikkel-id 4025Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    The new European X-ray Free-Electron Laser is the first X-ray free-electron laser capable of delivering X-ray pulses with a megahertz inter-pulse spacing, more than four orders of magnitude higher than previously possible. However, to date, it has been unclear whether it would indeed be possible to measure high-quality diffraction data at megahertz pulse repetition rates. Here, we show that high-quality structures can indeed be obtained using currently available operating conditions at the European XFEL. We present two complete data sets, one from the well-known model system lysozyme and the other from a so far unknown complex of a beta-lactamase from K. pneumoniae involved in antibiotic resistance. This result opens up megahertz serial femtosecond crystallography (SFX) as a tool for reliable structure determination, substrate screening and the efficient measurement of the evolution and dynamics of molecular structures using megahertz repetition rate pulses available at this new class of X-ray laser source.

1 - 31 of 31
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf