uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1 - 36 av 36
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1. Antolín, Roberto
    et al.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Gorjanc, Gregor
    Money, Daniel
    Hickey, John M.
    A hybrid method for the imputation of genomic data in livestock populations2017Ingår i: Genetics Selection Evolution, ISSN 0999-193X, E-ISSN 1297-9686, Vol. 49, artikel-id 30Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 2.
    Ausmees, Kristiina
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    John, Aji
    Toor, Salman Z.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    BAMSI: a multi-cloud service for scalable distributed filtering of massive genome data2018Ingår i: BMC Bioinformatics, ISSN 1471-2105, E-ISSN 1471-2105, Vol. 19, s. 240:1-11, artikel-id 240Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 3.
    Ayyalasomayajula, Kalyan Ram
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för visuell information och interaktion. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Bildanalys och människa-datorinteraktion.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap.
    Brun, Anders
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för visuell information och interaktion. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Bildanalys och människa-datorinteraktion.
    Feature evaluation for handwritten character recognition with regressive and generative Hidden Markov Models2016Ingår i: Advances in Visual Computing: Part I, Springer, 2016, s. 278-287Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 4.
    Bielecki, Johan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Gunn, Laura H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Munke, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Flueckiger, Leonie
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Lundholm, Ida
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Kulyk, Olena
    Higashiura, Akifumi
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, Ne-Te Duane
    Wysong, Taylor E.
    Bostedt, Christoph
    Gorkhover, Tais
    Iwan, Bianca
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Osipov, Timur
    Walter, Peter
    Hart, Philip
    Bucher, Maximilian
    Ulmer, Anatoli
    Ray, Dipanwita
    Carini, Gabriella
    Ferguson, Ken R.
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Electrospray sample injection for single-particle imaging with x-ray lasers2019Ingår i: Science Advances, E-ISSN 2375-2548, Vol. 5, nr 5, artikel-id eaav8801Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 5.
    Crooks, Lucy
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlborg, Örjan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi.
    An improved method for estimating chromosomal line origin in QTL analysis of crosses between outbred lines2011Ingår i: G3: Genes, Genomes, Genetics, ISSN 2160-1836, E-ISSN 2160-1836, Vol. 1, s. 57-64Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 6.
    Daurer, Benedikt J.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hummingbird: monitoring and analyzing flash X-ray imaging experiments in real time2016Ingår i: Journal of applied crystallography, ISSN 0021-8898, E-ISSN 1600-5767, Vol. 49, s. 1042-1047Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 7.
    Daurer, Benedikt J.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Benner, W. Henry
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Tîmneanu, Nicuşor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Ekeberg, Tomas
    Loh, N. Duane
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rath, Asawari D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Kirian, Richard A.
    Awel, Salah
    Wiedorn, Max O.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Carlsson, Gunilla H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sebastian
    Williams, Garth
    Koglin, Jason
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Experimental strategies for imaging bioparticles with femtosecond hard X-ray pulses2017Ingår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 4, s. 251-262Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 8.
    Ekeberg, Tomas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Abergel, Chantal
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seltzer, Virginie
    Claverie, Jean-Michel
    Hantke, Max
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Jönsson, Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liang, Mengning
    DePonte, Daniel P.
    Barty, Anton
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Iwan, Bianca
    Andersson, Inger
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, N. Duane
    Martin, Andrew V.
    Chapman, Henry
    Bostedt, Christoph
    Bozek, John D.
    Ferguson, Ken R.
    Krzywinski, Jacek
    Epp, Sascha W.
    Rolles, Daniel
    Rudenko, Artem
    Hartmann, Robert
    Kimmel, Nils
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an X-ray free-electron laser2015Ingår i: Physical Review Letters, ISSN 0031-9007, E-ISSN 1079-7114, Vol. 114, nr 9, s. 098102:1-6, artikel-id 098102Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 9. Gorkhover, Tais
    et al.
    Ulmer, Anatoli
    Ferguson, Ken
    Bucher, Max
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ekeberg, Tomas
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Bruza, Petr
    Carron, Sebastian
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Krzywinski, Jacek
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Morgan, Andrew
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Müller, Maria
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rupp, Daniela
    Sauppe, Mario
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Swiggers, Michelle
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Williams, Garth
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Chapman, Henry N.
    Faigel, Gyula
    Möller, Thomas
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bostedt, Christoph
    Femtosecond X-ray Fourier holography imaging of free-flying nanoparticles2018Ingår i: Nature Photonics, ISSN 1749-4885, E-ISSN 1749-4893, Vol. 12, s. 150-153Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 10.
    Günther, Torsten
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för organismbiologi, Människans evolution.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    The presence and impact of reference bias on population genomic studies of prehistoric human populations2019Ingår i: PLoS Genetics, ISSN 1553-7390, E-ISSN 1553-7404, Vol. 15, nr 7, artikel-id e1008302Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 11. Hickey, John M.
    et al.
    Gorjanc, Gregor
    Varshney, Rajeev K.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Imputation of single nucleotide polymorphism genotypes in biparental, backcross, and topcross populations with a hidden Markov model2015Ingår i: Crop science, ISSN 0011-183X, E-ISSN 1435-0653, Vol. 55, s. 1934-1946Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 12.
    Jayawardena, Mahen
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Östberg, Per-Olov
    Elmroth, Erik
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A Grid-Enabled Problem Solving Environment for QTL Analysis in R2010Ingår i: Proc. 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Cary, NC: ISCA , 2010, s. 202-209Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 13. Kurta, Ruslan P.
    et al.
    Donatelli, Jeffrey J.
    Yoon, Chun Hong
    Berntsen, Peter
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DeMirci, Hasan
    Fromme, Petra
    Hantke, Max Felix
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Munke, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Pande, Kanupriya
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sierra, Raymond G.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Vartanyants, Ivan A.
    Williams, Garth J.
    Xavier Paulraj, Lourdu
    Aquila, Andrew
    Zwart, Peter H.
    Mancuso, Adrian P.
    Correlations in scattered X-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses2017Ingår i: Physical Review Letters, ISSN 0031-9007, E-ISSN 1079-7114, Vol. 119, nr 15, s. 158102:1-7, artikel-id 158102Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 14.
    Liu, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Assessing uncertainties in x-ray single-particle three-dimensional reconstruction2018Ingår i: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, ISSN 1539-3755, E-ISSN 1550-2376, Vol. 98, s. 013303:1-12, artikel-id 013303Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 15.
    Lundholm, Ida V.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Barty, Anton
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bruza, Petr
    Bucher, Max
    Carron, Sebastian
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ferguson, Ken
    Hasse, Dirk
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Krzywinski, Jacek
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Morgan, Andrew
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Müller, Maria
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Pietrini, Alberto
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Rupp, Daniela
    Sauppe, Mario
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Swiggers, Michelle
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Ulmer, Anatoli
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Williams, Garth
    Zani, Alessandro
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Faigel, Gyula
    Chapman, Henry N.
    Möller, Thomas
    Bostedt, Christoph
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Gorkhover, Tais
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Considerations for three-dimensional image reconstruction from experimental data in coherent diffractive imaging2018Ingår i: IUCrJ, ISSN 0972-6918, E-ISSN 2052-2525, Vol. 5, s. 531-541Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 16.
    Mahjani, Behrang
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A flexible computational framework using R and Map-Reduce for permutation tests of massive genetic analysis of complex traits2017Ingår i: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology & Bioinformatics, ISSN 1545-5963, E-ISSN 1557-9964, Vol. 14, s. 381-392Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 17.
    Mahjani, Behrang
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    QTL as a service: PruneDIRECT for multi-dimensional QTL scans in cloud settings2016Ingår i: Bioinformatics, ISSN 1367-4803, E-ISSN 1367-4811Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 18.
    Munke, Anna
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Aquila, Andrew
    Awel, Salah
    Ayyer, Kartik
    Barty, Anton
    Bean, Richard J.
    Berntsen, Peter
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sébastien
    Bucher, Maximilian
    Chapman, Henry N.
    Daurer, Benedikt J.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DeMirci, Hasan
    Elser, Veit
    Fromme, Petra
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Higashiura, Akifumi
    Hogue, Brenda G.
    Hosseinizadeh, Ahmad
    Kim, Yoonhee
    Kirian, Richard A.
    Reddy, Hemanth K. N.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Lan, Ti-Yen
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Liu, Haiguang
    Loh, N. Duane
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mancuso, Adrian P.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nakagawa, Atsushi
    Nam, Daewoong
    Nelson, Garrett
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Okamoto, Kenta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Ourmazd, Abbas
    Rose, Max
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Schwander, Peter
    Seibert, M. Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Sierra, Raymond G.
    Song, Changyong
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Vartanyants, Ivan A.
    Westphal, Daniel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Wiedorn, Max O.
    Williams, Garth J.
    Xavier Paulraj, Lourdu
    Yoon, Chun Hong
    Zook, James
    Coherent diffraction of single Rice Dwarf virus particles using hard X-rays at the Linac Coherent Light Source2016Ingår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 3, s. 160064:1-12, artikel-id 160064Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 19. Nelson, Ronald M.
    et al.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Pettersson, Mats E.
    Shen, Xia
    Crooks, Lucy
    Besnier, François
    Álvarez-Castro, José
    Rönnegård, Lars
    Ek, Weronica
    Sheng, Zheya
    Kierczak, Marcin
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlborg, Örjan
    Swedish University of Agricultural Sciences, Division of Computational Genetics.
    MAPfastR: Quantitative trait loci mapping in outbred line crosses2013Ingår i: G3: Genes, Genomes, Genetics, ISSN 2160-1836, E-ISSN 2160-1836, Vol. 3, s. 2147-2149Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 20.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Breakdown of methods for phasing and imputation in the presence of double genotype sharing2012Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 21.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Breakdown of methods for phasing and imputation in the presence of double genotype sharing2013Ingår i: PLoS ONE, ISSN 1932-6203, E-ISSN 1932-6203, Vol. 8, s. e60354:1-5Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 22.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Haplotype inference based on hidden Markov models in the QTL–MAS 2010 multigenerational dataset2011Ingår i: Proc. 14th European Workshop on QTL Mapping and Marker Assisted Selection, London: BioMed Central , 2011, s. S10:1-7Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 23.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Inferring haplotypes and parental genotypes in larger full sib-ships and other pedigrees with missing or erroneous genotype data2012Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 24.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Inferring haplotypes and parental genotypes in larger full sib-ships and other pedigrees with missing or erroneous genotype data2012Ingår i: BMC Genetics, ISSN 1471-2156, E-ISSN 1471-2156, Vol. 13, s. 85:1-13Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 25.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Two Optimization Problems in Genetics: Multi-dimensional QTL Analysis and Haplotype Inference2012Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    The existence of new technologies, implemented in efficient platforms and workflows has made massive genotyping available to all fields of biology and medicine. Genetic analyses are no longer dominated by experimental work in laboratories, but rather the interpretation of the resulting data. When billions of data points representing thousands of individuals are available, efficient computational tools are required. The focus of this thesis is on developing models, methods and implementations for such tools.

    The first theme of the thesis is multi-dimensional scans for quantitative trait loci (QTL) in experimental crosses. By mating individuals from different lines, it is possible to gather data that can be used to pinpoint the genetic variation that influences specific traits to specific genome loci. However, it is natural to expect multiple genes influencing a single trait to interact. The thesis discusses model structure and model selection, giving new insight regarding under what conditions orthogonal models can be devised. The thesis also presents a new optimization method for efficiently and accurately locating QTL, and performing the permuted data searches needed for significance testing. This method has been implemented in a software package that can seamlessly perform the searches on grid computing infrastructures.

    The other theme in the thesis is the development of adapted optimization schemes for using hidden Markov models in tracing allele inheritance pathways, and specifically inferring haplotypes. The advances presented form the basis for more accurate and non-biased line origin probabilities in experimental crosses, especially multi-generational ones. We show that the new tools are able to reconstruct haplotypes and even genotypes in founder individuals and offspring alike, based on only unordered offspring genotypes. The tools can also handle larger populations than competing methods, resolving inheritance pathways and phase in much larger and more complex populations. Finally, the methods presented are also applicable to datasets where individual relationships are not known, which is frequently the case in human genetics studies. One immediate application for this would be improved accuracy for imputation of SNP markers within genome-wide association studies (GWAS).

    Delarbeten
    1. Coherent estimates of genetic effects with missing information
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Coherent estimates of genetic effects with missing information
    2012 (Engelska)Ingår i: Open Journal of Genetics, ISSN 2162-4453, E-ISSN 2162-4461, Vol. 2, s. 31-38Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nyckelord
    genetic effects, missing genotypes, orthogonal estimation, QTL analysis
    Nationell ämneskategori
    Bioinformatik och systembiologi Genetik Sannolikhetsteori och statistik Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-180915 (URN)10.4236/ojgen.2012.21003 (DOI)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2012-03-02 Skapad: 2012-09-12 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    2. Fast and accurate detection of multiple quantitative trait loci
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Fast and accurate detection of multiple quantitative trait loci
    2013 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Biology, ISSN 1066-5277, E-ISSN 1557-8666, Vol. 20, s. 687-702Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Bioinformatik och systembiologi Genetik Beräkningsmatematik Sannolikhetsteori och statistik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-180916 (URN)10.1089/cmb.2012.0242 (DOI)000323822000006 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2013-08-06 Skapad: 2012-09-13 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    3. A Grid-Enabled Problem Solving Environment for QTL Analysis in R
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>A Grid-Enabled Problem Solving Environment for QTL Analysis in R
    Visa övriga...
    2010 (Engelska)Ingår i: Proc. 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Cary, NC: ISCA , 2010, s. 202-209Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    Cary, NC: ISCA, 2010
    Nationell ämneskategori
    Programvaruteknik Genetik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-111594 (URN)978-1-880843-76-5 (ISBN)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2010-01-12 Skapad: 2009-12-17 Senast uppdaterad: 2018-01-12Bibliografiskt granskad
    4. cnF2freq: Efficient determination of genotype and haplotype probabilities in outbred populations using Markov models
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>cnF2freq: Efficient determination of genotype and haplotype probabilities in outbred populations using Markov models
    2009 (Engelska)Ingår i: Bioinformatics and Computational Biology, Berlin: Springer-Verlag , 2009, s. 307-319Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    Berlin: Springer-Verlag, 2009
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 5462
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Genetik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-103916 (URN)10.1007/978-3-642-00727-9_29 (DOI)000265785800029 ()978-3-642-00726-2 (ISBN)
    Tillgänglig från: 2009-05-25 Skapad: 2009-05-25 Senast uppdaterad: 2017-01-25Bibliografiskt granskad
    5. An improved method for estimating chromosomal line origin in QTL analysis of crosses between outbred lines
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>An improved method for estimating chromosomal line origin in QTL analysis of crosses between outbred lines
    2011 (Engelska)Ingår i: G3: Genes, Genomes, Genetics, ISSN 2160-1836, E-ISSN 2160-1836, Vol. 1, s. 57-64Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Genetik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-156197 (URN)10.1534/g3.111.000109 (DOI)000312405400007 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2011-06-01 Skapad: 2011-07-15 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad
    6. MAPfastR: Quantitative trait loci mapping in outbred line crosses
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>MAPfastR: Quantitative trait loci mapping in outbred line crosses
    Visa övriga...
    2013 (Engelska)Ingår i: G3: Genes, Genomes, Genetics, ISSN 2160-1836, E-ISSN 2160-1836, Vol. 3, s. 2147-2149Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Genetik Bioinformatik och systembiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-180917 (URN)10.1534/g3.113.008623 (DOI)000328334500005 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2013-10-11 Skapad: 2012-09-13 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    7. Haplotype inference based on hidden Markov models in the QTL–MAS 2010 multigenerational dataset
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Haplotype inference based on hidden Markov models in the QTL–MAS 2010 multigenerational dataset
    2011 (Engelska)Ingår i: Proc. 14th European Workshop on QTL Mapping and Marker Assisted Selection, London: BioMed Central , 2011, s. S10:1-7Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    London: BioMed Central, 2011
    Serie
    BMC Proceedings, ISSN 1753-6561 ; 5:3
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Genetik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-153449 (URN)10.1186/1753-6561-5-S3-S10 (DOI)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2010-05-17 Skapad: 2011-05-12 Senast uppdaterad: 2017-01-25Bibliografiskt granskad
    8. Inferring haplotypes and parental genotypes in larger full sib-ships and other pedigrees with missing or erroneous genotype data
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Inferring haplotypes and parental genotypes in larger full sib-ships and other pedigrees with missing or erroneous genotype data
    2012 (Engelska)Ingår i: BMC Genetics, ISSN 1471-2156, E-ISSN 1471-2156, Vol. 13, s. 85:1-13Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nyckelord
    haplotyping, phasing, genotype inference, nuclear family data, hidden Markov models
    Nationell ämneskategori
    Sannolikhetsteori och statistik Beräkningsmatematik Genetik Bioinformatik och systembiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-182488 (URN)10.1186/1471-2156-13-85 (DOI)000314354600001 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2012-10-10 Skapad: 2012-10-10 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    9. Breakdown of methods for phasing and imputation in the presence of double genotype sharing
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Breakdown of methods for phasing and imputation in the presence of double genotype sharing
    2012 (Engelska)Rapport (Övrigt vetenskapligt)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2012-027
    Nationell ämneskategori
    Sannolikhetsteori och statistik Beräkningsmatematik Genetik Bioinformatik och systembiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-181598 (URN)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2012-09-25 Skapad: 2012-09-26 Senast uppdaterad: 2017-01-25Bibliografiskt granskad
  • 26.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Using Markov models and a stochastic Lipschitz condition for genetic analyses2010Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    A proper understanding of biological processes requires an understanding of genetics and evolutionary mechanisms. The vast amounts of genetical information that can routinely be extracted with modern technology have so far not been accompanied by an equally extended understanding of the corresponding processes.

    The relationship between a single gene and the resulting properties, phenotype of an individual is rarely clear. This thesis addresses several computational challenges regarding identifying and assessing the effects of quantitative trait loci (QTL), genomic positions where variation is affecting a trait. The genetic information available for each individual is rarely complete, meaning that the unknown variable of the genotype in the loci modelled also needs to be addressed. This thesis contains the presentation of new tools for employing the information that is available in a way that maximizes the information used, by using hidden Markov models (HMMs), resulting in a change in algorithm runtime complexity from exponential to log-linear, in terms of the number of markers. It also proposes the introduction of inferred haplotypes to further increase the power to assess these unknown variables for pedigrees of related genetically diverse individuals. Modelling consequences of partial genetic information are also treated.

    Furthermore, genes are not directly affecting traits, but are rather expressed in the environment of and in concordance with other genes. Therefore, significant interactions can be expected within genes, where some combination of genetic variation gives a pronounced, or even opposite, effect, compared to when occurring separately. This thesis addresses how to perform efficient scans for multiple interacting loci, as well as how to derive highly accurate empirical significance tests in these settings. This is done by analyzing the mathematical properties of the objective function describing the quality of model fits, and reformulating it through a simple transformation. Combined with the presented prototype of a problem-solving environment, these developments can make multi-dimensional searches for QTL routine, allowing the pursuit of new biological insight.

  • 27.
    Nettelblad, Carl
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlborg, Örjan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Centrum för bioinformatik.
    Pino-Querido, Ania
    University of Santiago de Compostela, Department of Genetics.
    Álvarez-Castro, José M.
    University of Santiago de Compostela, Department of Genetics.
    Coherent estimates of genetic effects with missing information2012Ingår i: Open Journal of Genetics, ISSN 2162-4453, E-ISSN 2162-4461, Vol. 2, s. 31-38Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 28.
    Nettelblad, Carl
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlborg, Örjan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Centrum för bioinformatik.
    Álvarez-Castro, José M.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Centrum för bioinformatik.
    Assessing orthogonality and statistical properties of linear regression methods for interval mapping with partial information2010Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 29.
    Nettelblad, Carl
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Stochastically guaranteed global optima in multi-dimensional QTL searches2010Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 30.
    Nettelblad, Carl
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Crooks, Lucy
    Carlborg, Örjan
    cnF2freq: Efficient determination of genotype and haplotype probabilities in outbred populations using Markov models2009Ingår i: Bioinformatics and Computational Biology, Berlin: Springer-Verlag , 2009, s. 307-319Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 31.
    Nettelblad, Carl
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Mahjani, Behrang
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Fast and accurate detection of multiple quantitative trait loci2013Ingår i: Journal of Computational Biology, ISSN 1066-5277, E-ISSN 1557-8666, Vol. 20, s. 687-702Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 32.
    Pietrini, Alberto
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Timneanu, Nicusor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Molekyl- och kondenserade materiens fysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Andreasson, Jakob
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, N. Duane
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Boutet, Sébastien
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A statistical approach to detect protein complexes at X-ray free electron laser facilities2018Ingår i: Communications Physics, E-ISSN 2399-3650, Vol. 1, s. 92:1-11, artikel-id 92Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 33.
    Pietrini, Alberto
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Artifact reduction in the CSPAD detectors used for LCLS experiments2017Ingår i: Journal of Synchrotron Radiation, ISSN 0909-0495, E-ISSN 1600-5775, Vol. 24, s. 1092-1097Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 34.
    Pietrini, Alberto
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Using convex optimization of autocorrelation with constrained support and windowing for improved phase retrieval accuracy2018Ingår i: Optics Express, ISSN 1094-4087, E-ISSN 1094-4087, Vol. 26, s. 24422-24443Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 35.
    Reddy, Hemanth K. N.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Yoon, Chun Hong
    Aquila, Andrew
    Awel, Salah
    Ayyer, Kartik
    Barty, Anton
    Berntsen, Peter
    Bielecki, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Bobkov, Sergey
    Bucher, Maximilian
    Carini, Gabriella A.
    Carron, Sebastian
    Chapman, Henry
    Daurer, Benedikt
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    DeMirci, Hasan
    Ekeberg, Tomas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Fromme, Petra
    Hajdu, Janos
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hart, Philip
    Hogue, Brenda G.
    Hosseinizadeh, Ahmad
    Kim, Yoonhee
    Kirian, Richard A.
    Kurta, Ruslan P.
    Larsson, Daniel S. D.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Loh, N. Duane
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Mancuso, Adrian P.
    Mühlig, Kerstin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Munke, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nam, Daewoong
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Ourmazd, Abbas
    Rose, Max
    Schwander, Peter
    Seibert, Marvin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Sellberg, Jonas A.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Song, Changyong
    Spence, John C. H.
    Svenda, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    van der Schot, Gijs
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Vartanyants, Ivan A.
    Williams, Garth J.
    Xavier Paulraj, Lourdu
    Coherent soft X-ray diffraction imaging of Coliphage PR772 at the Linac coherent light source2017Ingår i: Scientific Data, E-ISSN 2052-4463, Vol. 4, artikel-id 170079Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 36.
    Wilkinson, Tomas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för visuell information och interaktion.
    Nettelblad, Carl
    Bootstrapping Weakly Supervised Segmentation-free Word Spotting through HMM-based AlignmentManuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Recent work in word spotting in handwritten documents has yielded impressive results. Yet this progress has largely been made by supervised learning systems which are dependant on manually annotated data, making deployment to new collections a significant effort. In this paper we propose an approach utilising transcriptions without bounding box annotations to train segmentation-free word spotting models, given a model partially trained with full annotations. This is done through an alignment procedure based on hidden Markov models. This model can create a tentative mapping between word region proposals and the transcriptions to automatically create additional weakly annotated training data. Using as little as 1% and 10% of the fully annotated training sets for partial convergence, we automatically annotate the remaining training data and successfully train using it. Across all datasets, our approach comes within a few mAP% of achieving the same performance as a model trained with only full ground truth. We believe that this will be a significant advance towards a more general use of word spotting, since digital transcription data will already exist for parts of many collections of interest.

1 - 36 av 36
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf