uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1234567 1 - 50 av 315
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1. Abel, John H.
    et al.
    Drawert, Brian
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Petzold, Linda R.
    GillesPy: A Python package for stochastic model building and simulation2016Ingår i: IEEE Life Sciences Letters, E-ISSN 2332-7685, Vol. 2, s. 35-38Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 2. Ahmed, Laeeq
    et al.
    Georgiev, Valentin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap.
    Capuccini, Marco
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Schaal, Wesley
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap.
    Laure, Erwin
    Spjuth, Ola
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap.
    Efficient iterative virtual screening with Apache Spark and conformal prediction2018Ingår i: Journal of Cheminformatics, ISSN 1758-2946, E-ISSN 1758-2946, Vol. 10, artikel-id 8Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 3.
    Andrejev, Andrej
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datalogi.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Risch, Tore
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datalogi.
    Scientific analysis by queries in extended SPARQL over a scalable e-Science data store2013Ingår i: Proc. 9th International Conference on e-Science, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2013, s. 98-106Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 4. Antolín, Roberto
    et al.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Gorjanc, Gregor
    Money, Daniel
    Hickey, John M.
    A hybrid method for the imputation of genomic data in livestock populations2017Ingår i: Genetics Selection Evolution, ISSN 0999-193X, E-ISSN 1297-9686, Vol. 49, artikel-id 30Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 5. Anzt, Hartwig
    et al.
    Lukarski, Dimitar
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Tomov, Stanimire
    Dongarra, Jack
    Self-adaptive multiprecision preconditioners on multicore and manycore architectures2015Ingår i: High Performance Computing for Computational Science – VECPAR 2014, Springer, 2015, s. 115-123Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 6. Appleton, Owen
    et al.
    Cameron, David
    Cernák, Jozef
    Dóbé, Péter
    Ellert, Mattias
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Högenergifysik.
    Frågåt, Thomas
    Grønager, Michael
    Johansson, Daniel
    Jönemo, Johan
    Kleist, Josva
    Kocan, Marek
    Konstantinov, Aleksandr
    Kónya, Balázs
    Márton, Iván
    Mohn, Bjarte
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Högenergifysik.
    Möller, Steffen
    Müller, Henning
    Nagy, Zsombor
    Nilsen, Jon K.
    Ould-Saada, Farid
    Pajchel, Katarina
    Qiang, Weizhong
    Read, Alexander
    Rosendahl, Peter
    Röczei, Gábor
    Savko, Martin
    Skou Andersen, Martin
    Smirnova, Oxana
    Stefán, Péter
    Szalai, Ferenc
    Taga, Adrian
    Toor, Salman Z.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Wäänänen, Anders
    Zhou, Xin
    The next-generation ARC middleware2010Ingår i: Annales des télécommunications, ISSN 0003-4347, E-ISSN 1958-9395, Vol. 65, s. 771-776Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 7. Arjmand, Doghonay
    et al.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Kreiss, Gunilla
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Temporal upscaling in micromagnetism via heterogeneous multiscale methods2019Ingår i: Journal of Computational and Applied Mathematics, ISSN 0377-0427, E-ISSN 1879-1778, Vol. 345, s. 99-113Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 8.
    Artemov, Anton G.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Inverse factorization in electronic structure theory: Analysis and parallelization2019Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    This licentiate thesis is a part of an effort to run large electronic structure calculations in modern computational environments with distributed memory. The ultimate goal is to model materials consisting of millions of atoms at the level of quantum mechanics. In particular, the thesis focuses on different aspects of a computational problem of inverse factorization of Hermitian positive definite matrices. The considered aspects are numerical properties of the algorithms and parallelization. Not only is an efficient and scalable computation of inverse factors necessary in order to be able to run large scale electronic computations based on the Hartree–Fock or Kohn–Sham approaches with the self-consistent field procedure, but it can be applied more generally for preconditioner construction.

    Parallelization of algorithms with unknown load and data distributions requires a paradigm shift in programming. In this thesis we also discuss a few parallel programming models with focus on task-based models, and, more specifically, the Chunks and Tasks model.

    Delarbeten
    1. Localized inverse factorization
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Localized inverse factorization
    2018 (Engelska)Ingår i: Computing Research Repository, nr 1812.04919Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt) Submitted
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-381327 (URN)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2018-12-12 Skapad: 2019-04-08 Senast uppdaterad: 2019-09-20Bibliografiskt granskad
    2. Parallelization and scalability analysis of inverse factorization using the Chunks and Tasks programming model
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Parallelization and scalability analysis of inverse factorization using the Chunks and Tasks programming model
    2019 (Engelska)Ingår i: Computing Research Repository, nr 1901.07993Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt) Submitted
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-381329 (URN)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2019-01-24 Skapad: 2019-04-08 Senast uppdaterad: 2019-04-09Bibliografiskt granskad
  • 9.
    Artemov, Anton G.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Rudberg, Elias
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Rubensson, Emanuel H.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Parallelization and scalability analysis of inverse factorization using the Chunks and Tasks programming model2019Ingår i: Computing Research Repository, nr 1901.07993Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 10.
    Ausmees, Kristiina
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    John, Aji
    Toor, Salman Z.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    BAMSI: a multi-cloud service for scalable distributed filtering of massive genome data2018Ingår i: BMC Bioinformatics, ISSN 1471-2105, E-ISSN 1471-2105, Vol. 19, s. 240:1-11, artikel-id 240Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 11.
    Bauer, Pavol
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Parallelism and efficiency in discrete-event simulation2015Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Discrete-event models depict systems where a discrete state is repeatedly altered by instantaneous changes in time, the events of the model. Such models have gained popularity in fields such as Computational Systems Biology or Computational Epidemiology due to the high modeling flexibility and the possibility to easily combine stochastic and deterministic dynamics. However, the system size of modern discrete-event models is growing and/or they need to be simulated at long time periods. Thus, efficient simulation algorithms are required, as well as the possibility to harness the compute potential of modern multicore computers. Due to the sequential design of simulators, parallelization of discrete event simulations is not trivial. This thesis discusses event-based modeling and sensitivity analysis and also examines ways to increase the efficiency of discrete-event simulations and to scale models involving deterministic and stochastic spatial dynamics on a large number of processor cores.

    Delarbeten
    1. Sensitivity estimation and inverse problems in spatial stochastic models of chemical kinetics
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Sensitivity estimation and inverse problems in spatial stochastic models of chemical kinetics
    2015 (Engelska)Ingår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: ENUMATH 2013, Springer, 2015, s. 519-527Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    Springer, 2015
    Serie
    Lecture Notes in Computational Science and Engineering ; 103
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-237184 (URN)10.1007/978-3-319-10705-9_51 (DOI)978-3-319-10704-2 (ISBN)
    Konferens
    ENUMATH 2013
    Projekt
    eSSENCEUPMARC
    Tillgänglig från: 2014-10-31 Skapad: 2014-11-28 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    2. Fast event-based epidemiological simulations on national scales
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Fast event-based epidemiological simulations on national scales
    2016 (Engelska)Ingår i: The international journal of high performance computing applications, ISSN 1094-3420, E-ISSN 1741-2846, Vol. 30, s. 438-453Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Datavetenskap (datalogi) Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-264751 (URN)10.1177/1094342016635723 (DOI)000387763100005 ()
    Projekt
    UPMARCeSSENCE
    Tillgänglig från: 2016-04-11 Skapad: 2015-10-16 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    3. Efficient inter-process synchronization for parallel discrete event simulation on multicores
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Efficient inter-process synchronization for parallel discrete event simulation on multicores
    2015 (Engelska)Ingår i: Proc. 3rd ACM SIGSIM Conference on Principles of Advanced Discrete Simulation, New York: ACM Press, 2015, s. 183-194Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    New York: ACM Press, 2015
    Nationell ämneskategori
    Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-260199 (URN)10.1145/2769458.2769476 (DOI)978-1-4503-3583-6 (ISBN)
    Konferens
    SIGSIM-PADS 2015
    Projekt
    UPMARC
    Tillgänglig från: 2015-06-10 Skapad: 2015-08-17 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
  • 12.
    Bauer, Pavol
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Parallelism in Event-Based Computations with Applications in Biology2017Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Event-based models find frequent usage in fields such as computational physics and biology as they may contain both continuous and discrete state variables and may incorporate both deterministic and stochastic state transitions. If the state transitions are stochastic, computer-generated random numbers are used to obtain the model solution. This type of event-based computations is also known as Monte-Carlo simulation.

    In this thesis, I study different approaches to execute event-based computations on parallel computers. This ultimately allows users to retrieve their simulation results in a fraction of the original computation time. As system sizes grow continuously or models have to be simulated at longer time scales, this is a necessary approach for current computational tasks.

    More specifically, I propose several ways to asynchronously simulate such models on parallel shared-memory computers, for example using parallel discrete-event simulation or task-based computing. The particular event-based models studied herein find applications in systems biology, computational epidemiology and computational neuroscience.

    In the presented studies, the proposed methods allow for high efficiency of the parallel simulation, typically scaling well with the number of used computer cores. As the scaling typically depends on individual model properties, the studies also investigate which quantities have the greatest impact on the simulation performance.

    Finally, the presented studies include other insights into event-based computations, such as methods how to estimate parameter sensitivity in stochastic models and how to simulate models that include both deterministic and stochastic state transitions.

    Delarbeten
    1. Sensitivity estimation and inverse problems in spatial stochastic models of chemical kinetics
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Sensitivity estimation and inverse problems in spatial stochastic models of chemical kinetics
    2015 (Engelska)Ingår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: ENUMATH 2013, Springer, 2015, s. 519-527Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    Springer, 2015
    Serie
    Lecture Notes in Computational Science and Engineering ; 103
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-237184 (URN)10.1007/978-3-319-10705-9_51 (DOI)978-3-319-10704-2 (ISBN)
    Konferens
    ENUMATH 2013
    Projekt
    eSSENCEUPMARC
    Tillgänglig från: 2014-10-31 Skapad: 2014-11-28 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    2. Multiscale modelling via split-step methods in neural firing
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Multiscale modelling via split-step methods in neural firing
    2018 (Engelska)Ingår i: Mathematical and Computer Modelling of Dynamical Systems, ISSN 1387-3954, E-ISSN 1744-5051, Vol. 24, s. 426-445Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Neurovetenskaper
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-332008 (URN)10.1080/13873954.2018.1488740 (DOI)000440605300005 ()
    Projekt
    UPMARCeSSENCE
    Tillgänglig från: 2018-08-01 Skapad: 2017-10-22 Senast uppdaterad: 2018-11-19Bibliografiskt granskad
    3. Fast event-based epidemiological simulations on national scales
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Fast event-based epidemiological simulations on national scales
    2016 (Engelska)Ingår i: The international journal of high performance computing applications, ISSN 1094-3420, E-ISSN 1741-2846, Vol. 30, s. 438-453Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Datavetenskap (datalogi) Beräkningsmatematik
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-264751 (URN)10.1177/1094342016635723 (DOI)000387763100005 ()
    Projekt
    UPMARCeSSENCE
    Tillgänglig från: 2016-04-11 Skapad: 2015-10-16 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    4. Efficient inter-process synchronization for parallel discrete event simulation on multicores
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Efficient inter-process synchronization for parallel discrete event simulation on multicores
    2015 (Engelska)Ingår i: Proc. 3rd ACM SIGSIM Conference on Principles of Advanced Discrete Simulation, New York: ACM Press, 2015, s. 183-194Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    New York: ACM Press, 2015
    Nationell ämneskategori
    Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-260199 (URN)10.1145/2769458.2769476 (DOI)978-1-4503-3583-6 (ISBN)
    Konferens
    SIGSIM-PADS 2015
    Projekt
    UPMARC
    Tillgänglig från: 2015-06-10 Skapad: 2015-08-17 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    5. Exposing inter-process information for efficient parallel discrete event simulation of spatial stochastic systems
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Exposing inter-process information for efficient parallel discrete event simulation of spatial stochastic systems
    2017 (Engelska)Ingår i: Proc. 5th ACM SIGSIM Conference on Principles of Advanced Discrete Simulation, New York: ACM Press, 2017, s. 53-64Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    New York: ACM Press, 2017
    Nationell ämneskategori
    Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-328367 (URN)10.1145/3064911.3064916 (DOI)978-1-4503-4489-0 (ISBN)
    Konferens
    SIGSIM-PADS 2017
    Projekt
    UPMARC
    Tillgänglig från: 2017-05-16 Skapad: 2017-08-22 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
  • 13.
    Bauer, Pavol
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Sensitivity estimation and inverse problems in spatial stochastic models of chemical kinetics2015Ingår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: ENUMATH 2013, Springer, 2015, s. 519-527Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 14.
    Bauer, Pavol
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Mikulovic, Sanja
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Genetisk utvecklingsbiologi.
    Senek, Aleksandar
    Multiscale modelling via split-step methods in neural firing2018Ingår i: Mathematical and Computer Modelling of Dynamical Systems, ISSN 1387-3954, E-ISSN 1744-5051, Vol. 24, s. 426-445Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 15.
    Bauer, Pavol
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Widgren, Stefan
    Fast event-based epidemiological simulations on national scales2016Ingår i: The international journal of high performance computing applications, ISSN 1094-3420, E-ISSN 1741-2846, Vol. 30, s. 438-453Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 16.
    Bauer, Pavol
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lindén, Jonatan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Jonsson, Bengt
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Efficient inter-process synchronization for parallel discrete event simulation on multicores2015Ingår i: Proc. 3rd ACM SIGSIM Conference on Principles of Advanced Discrete Simulation, New York: ACM Press, 2015, s. 183-194Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 17. Benchaib, Mohamed Amine
    et al.
    Bouchnita, Anass
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Volpert, Vitaly
    Makhoute, Abdelkader
    Mathematical modeling reveals that the administration of EGF can promote the elimination of lymph node metastases by PD-1/PD-L1 blockade2019Ingår i: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, E-ISSN 2296-4185, Vol. 7, artikel-id 104Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 18.
    Berglund, Anders
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Learning practice and theory in programming education: Students’ lived experience2015Ingår i: Proc. 3rd International Conference on Learning and Teaching in Computing and Engineering, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2015, s. 180-186Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 19.
    Berglund, Anders
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Learning to program: A discussion on the interplay of theory and practice2015Ingår i: Proc. 1st Al Baha University and Uppsala University Symposium on Quality in Computing Education, 2015, s. 16-18Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 20.
    Blanc, Emilie
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Mesoscopic modeling of stochastic reaction–diffusion kinetics in the subdiffusive regime2016Ingår i: Multiscale Modeling & simulation, ISSN 1540-3459, E-ISSN 1540-3467, Vol. 14, s. 668-707Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 21.
    Bouchnita, Anass
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A 3D multiscale model to explore the role of EGFR overexpression in tumourigenesis2019Ingår i: Bulletin of Mathematical Biology, ISSN 0092-8240, E-ISSN 1522-9602, Vol. 81, s. 2323-2344Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 22.
    Bouchnita, Anass
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Volpert, Vitaly
    A multiscale model of platelet-fibrin thrombus growth in the flow2019Ingår i: Computers & Fluids, ISSN 0045-7930, E-ISSN 1879-0747, Vol. 184, s. 10-20Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 23. Boustedt, Jonas
    et al.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    McCartney, Robert
    Sanders, Kate
    Thomas, Lynda
    Zander, Carol
    Students' perceptions of the differences between formal and informal learning2011Ingår i: Proc. 7th International Computing Education Research Workshop, New York: ACM Press , 2011, s. 61-68Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 24. Brumm, Bernd
    et al.
    Kieri, Emil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A matrix-free Legendre spectral method for initial–boundary value problems2016Ingår i: Electronic Transactions on Numerical Analysis, ISSN 1068-9613, E-ISSN 1068-9613, Vol. 45, s. 283-304Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 25.
    Bull, Jonathan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A direct solver for the advection–diffusion equation using Green's functions and low-rank approximation2016Ingår i: Proc. 7th ECCOMAS Congress, European Community on Computional Methods in Applied Sciences (ECCOMAS), 2016, s. 7302-7316Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 26.
    Capuccini, Marco
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Ahmed, Laeeq
    Schaal, Wesley
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap.
    Laure, Erwin
    Spjuth, Ola
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Large-scale virtual screening on public cloud resources with Apache Spark2017Ingår i: Journal of Cheminformatics, ISSN 1758-2946, E-ISSN 1758-2946, Vol. 9, artikel-id 15Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 27.
    Capuccini, Marco
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlsson, Lars
    Norinder, Ulf
    Spjuth, Ola
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Conformal prediction in Spark: Large-scale machine learning with confidence2015Ingår i: Proc. 2nd International Symposium on Big Data Computing, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2015, s. 61-67Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 28. Caulfield, Emmet
    et al.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    CellMC: a multiplatform model compiler for the Cell Broadband Engine and x862010Ingår i: Bioinformatics, ISSN 1367-4803, E-ISSN 1367-4811, Vol. 26, s. 426-428Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 29. Chevallier, Augustin
    et al.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Pathwise error bounds in multiscale variable splitting methods for spatial stochastic kinetics2018Ingår i: SIAM Journal on Numerical Analysis, ISSN 0036-1429, E-ISSN 1095-7170, Vol. 56, s. 469-498Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 30.
    Christoffer, Zakrisson
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Effektiva lösningsmetoder för Schrödingerekvationen: En jämförelse2013Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    In this paper the rate of convergence, speed of execution and symplectic properties of the time-integrators Leap-Frog (LF2), fourth order Runge-Kutta(RK4) and Crank-Nicholson (CN2) have been studied. This was done by solving the one-dimensional model for a particle in a box (Dirichlet-conditions). The results show that RK4 is the fastest in achieving higher tolerances, while CN2 is the fastest in achieving lower tolerances. Fourth order corrections of LF (LF4)and CN (CN4) were also studied, though these showed no improvements overLF2 and CN2. All methods were shown to exhibit symplectic behavior.

  • 31.
    Christoffersson, Gustaf
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    Lomei, Jalal
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    O'Callaghan, Paul
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    Kreuger, Johan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Phillipson, Mia
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    Vascular sprouts induce local attraction of proangiogenic neutrophils2017Ingår i: Journal of Leukocyte Biology, ISSN 0741-5400, E-ISSN 1938-3673, Vol. 102, s. 741-751Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 32. Clear, Tony
    et al.
    Whalley, Jacqueline
    Robbins, Phil
    Philpott, Anne
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Laakso, Mikko-Jussi
    Lister, Raymond
    Report on the final BRACElet workshop: Auckland University of Technology, September 20102011Ingår i: Journal of Applied Computing and Information Technology, ISSN 2230-4398, Vol. 15, nr 1:T1Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 33.
    Coulier, Adrien
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Orchestral: a lightweight framework for parallel simulations of cell–cell communication2018Ingår i: Proc. 14th International Conference on e-Science, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2018, s. 168-176Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 34.
    Crooks, Lucy
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Carlborg, Örjan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi.
    An improved method for estimating chromosomal line origin in QTL analysis of crosses between outbred lines2011Ingår i: G3: Genes, Genomes, Genetics, ISSN 2160-1836, E-ISSN 2160-1836, Vol. 1, s. 57-64Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 35.
    Daniels, Mats
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Cajander, Åsa
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Bildanalys och människa-datorinteraktion.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lind, Mats
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Bildanalys och människa-datorinteraktion.
    Nylén, Aletta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datalogi.
    Clear, Tony
    McDermott, Roger
    Competencies for paradigm shift "survival"2015Ingår i: Proc. 45th ASEE/IEEE Frontiers in Education Conference, Piscataway, NJ: IEEE Press, 2015, s. 1424-1429Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 36.
    Daurer, Benedikt J.
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hantke, Max F.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Maia, Filipe R. N. C.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Hummingbird: monitoring and analyzing flash X-ray imaging experiments in real time2016Ingår i: Journal of applied crystallography, ISSN 0021-8898, E-ISSN 1600-5767, Vol. 49, s. 1042-1047Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 37. Do-Quang, Minh
    et al.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Tornberg, Anna-Karin
    Amberg, Gustav
    The well-posedness of diffuse interface modeling of surfactants in two-phase fluid flow2013Ingår i: Wetting and Evaporation: Droplets of Pure and Complex Fluids, France: Aix-Marseille Université , 2013, s. 80-81Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 38.
    Dorostkar, Ali
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Lukarski, Dimitar
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lund, Björn
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Geovetenskapliga sektionen, Institutionen för geovetenskaper, Geofysik.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Notay, Yvan
    Schmidt, Peter
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Geovetenskapliga sektionen, Institutionen för geovetenskaper, Geofysik.
    CPU and GPU performance of large scale numerical simulations in Geophysics2014Ingår i: Euro-Par 2014: Parallel Processing Workshops, Part I, Springer, 2014, s. 12-23Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 39.
    Dorostkar, Ali
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Lukarski, Dimitar
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lund, Björn
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Geovetenskapliga sektionen, Institutionen för geovetenskaper, Geofysik.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Notay, Yvan
    Schmidt, Peter
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Geovetenskapliga sektionen, Institutionen för geovetenskaper, Geofysik.
    Parallel performance study of block-preconditioned iterative methods on multicore computer systems2014Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 40. Drawert, Brian
    et al.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    URDME: a modular framework for stochastic simulation of reaction-transport processes in complex geometries2012Ingår i: BMC Systems Biology, ISSN 1752-0509, E-ISSN 1752-0509, Vol. 6, s. 76:1-17Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 41. Drawert, Brian
    et al.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Bales, Ben
    Banerjee, Debjani
    Bellesia, Giovanni
    Daigle Jr., Bernie J.
    Douglas, Geoffrey
    Gu, Mengyuan
    Gupta, Anand
    Hellander, Stefan
    Horuk, Chris
    Nath, Dibyendu
    Takkar, Aviral
    Wu, Sheng
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Krintz, Chandra
    Petzold, Linda R.
    Stochastic Simulation Service: Bridging the gap between the computational expert and the biologist2016Ingår i: PloS Computational Biology, ISSN 1553-734X, E-ISSN 1553-7358, Vol. 12, nr 12, artikel-id e1005220Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 42. Drawert, Brian
    et al.
    Trogdon, Michael
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Petzold, Linda
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    MOLNs: A cloud platform for interactive, reproducible, and scalable spatial stochastic computational experiments in systems biology using PyURDME2016Ingår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 38, s. C179-C202Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 43.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Relating theory and practice in laboratory work: a variation theoretical study2015Ingår i: Studies in Higher Education, ISSN 0307-5079, E-ISSN 1470-174X, Vol. 40, s. 867-880Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 44.
    Eckerdal, Anna
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Kinnunen, Päivi
    Thota, Neena
    Nylén, Aletta
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datalogi.
    Sheard, Judy
    Malmi, Lauri
    Teaching and learning with MOOCs: Computing academics' perspectives and engagement2014Ingår i: Proc. 19th Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education, New York: ACM Press , 2014, s. 9-14Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 45.
    Eckerdal, Anna
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Laakso, Mikko-Jussi
    Lopez, Mike
    Sarkar, Amitrajit
    Relationship between text and action conceptions of programming: a phenomenographic and quantitative perspective2011Ingår i: Proc. 16th Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education, New York: ACM Press , 2011, s. 33-37Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 46.
    Eckerdal, Anna
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Thuné, Michael
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Analysing the enacted object of learning in lab assignments in programming education2013Ingår i: Proc. 1st International Conference on Learning and Teaching in Computing and Engineering, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2013, s. 208-211Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 47.
    Ekeberg, Tomas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär biofysik.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Liu, Jing
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Machine learning for ultrafast X-ray diffraction patterns on large-scale GPU clusters2015Ingår i: The international journal of high performance computing applications, ISSN 1094-3420, E-ISSN 1741-2846, Vol. 29, s. 233-243Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 48.
    Elmgren, Maja
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - Ångström, Fysikalisk kemi.
    Andersson, Staffan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Fysiska sektionen, Institutionen för fysik och astronomi, Fysikundervisningens didaktik.
    Pears, Arnold
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    Pålsson, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Scaffolding pedagogic excellence in higher education2013Ingår i: Improving Student Learning through Research and Scholarship, UK: Oxford Brookes University , 2013, s. 164-176Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 49. Elmroth, Erik
    et al.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lindemann, Jonas
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Östberg, Per-Olov
    Empowering a flexible application portal with a SOA-based grid job management framework2008Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 50.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    On the stability of stochastic jump kinetics2014Ingår i: Applied Mathematics, ISSN 2152-7385, E-ISSN 2152-7393, Vol. 5, s. 3217-3239Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
1234567 1 - 50 av 315
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf