uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1 - 20 av 20
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Regulation of Type I Interferon Production in Plasmacytoid Dendritic Cells: Effect of Genetic Factors and Interactions with NK Cells and B Cells2015Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    The type I interferon (IFN) system plays a central role in the etiopathogenesis of many autoimmune diseases, e.g. systemic lupus erythematosus (SLE). Activation of the type I IFN system in SLE is promoted by endogenous nucleic acid-containing immune complexes (ICs) which stimulate plasmacytoid dendritic cells (pDCs). This thesis focuses on the regulation of IFN-α production in pDCs, by interactions with B cells and natural killer (NK) cells, and by genetic factors.

    In Study I, RNA-IC-stimulated CD56dim NK cells were found to be activated via FcγRIIIa and enhanced the IFN-α production by pDCs. The enhancing effect of the NK cells was mediated via both soluble factors, such as the cytokine MIP-1β, and in a cell-cell contact mediated manner via the adhesion molecule LFA-1. In Study II, B cells enhanced the IFN-α production by pDCs via cell-cell contact or soluble factors, depending on the stimuli. The cell-cell contact-mediated enhancement, when the cells were stimulated with RNA-IC, was abolished by blocking the cell adhesion molecule CD31. B cells stimulated with the oligonucleotide ODN2216 enhanced the IFN-α production via soluble factors. In Study III, gene variants related to autoimmune or inflammatory diseases were analyzed for the association to the IFN-α production by pDCs, alone or in coculture with NK or B cells. Depending on cell combination, 18-86 SNPs (p < 0.001) were associated with the IFN-α production. Several of the SNPs showed novel associations to the type I IFN system, while some loci have been described earlier for their association with SLE, e.g. IL10 and PXK. In Study IV, several B cell populations were affected by cocultivation with pDCs and stimulation with RNA-IC. The frequency of CD24hiCD38hi B cells of regulatory character was increased in the pDC-B cell cocultures. However, RNA-IC-stimulation only induced modest levels of IL-10. A remarkably increased frequency of double negative CD27-IgD- B cells was found in the RNA-IC-stimulated cocultures of pDCs and B cells.

    In conclusion, the findings in the present thesis reveal novel mechanisms behind the regulation of the type I IFN system which could be important targets in autoimmune diseases with constantly activated pDCs.

    Delarbeten
    1. IFN-α Production by Plasmacytoid Dendritic Cells Stimulated with RNA-Containing Immune Complexes Is Promoted by NK Cells via MIP-1β and LFA-1
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>IFN-α Production by Plasmacytoid Dendritic Cells Stimulated with RNA-Containing Immune Complexes Is Promoted by NK Cells via MIP-1β and LFA-1
    Visa övriga...
    2011 (Engelska)Ingår i: Journal of Immunology, ISSN 0022-1767, E-ISSN 1550-6606, Vol. 186, nr 9, s. 5085-5094Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Abstract [en]

    Several systemic autoimmune diseases display a prominent IFN signature. This is caused by a continuous IFN-α production by plasmacytoid dendritic cells (pDCs), which are activated by immune complexes (ICs) containing nucleic acid. The IFN-α production by pDCs stimulated with RNA-containing IC (RNA-IC) consisting of anti-RNP autoantibodies and U1 small nuclear ribonucleoprotein particles was recently shown to be inhibited by monocytes, but enhanced by NK cells. The inhibitory effect of monocytes was mediated by TNF-α, PGE2, and reactive oxygen species, but the mechanisms for the NK cell-mediated increase in IFN-α production remained unclear. In this study, we investigated the mechanisms whereby NK cells increase the RNA-IC–induced IFN-α production by pDCs. Furthermore, NK cells from patients with systemic lupus erythematosus (SLE) were evaluated for their capacity to promote IFN-α production. We found that CD56dim NK cells could increase IFN-α production >1000-fold after RNA-IC activation, whereas CD56bright NK cells required costimulation by IL-12 and IL-18 to promote IFN-α production. NK cells produced MIP-1α, MIP-1β, RANTES, IFN-γ, and TNF-α via RNA-IC–mediated FcγRIIIA activation. The IFN-α production in pDCs was promoted by NK cells via MIP-1β secretion and LFA-mediated cell–cell contact. Moreover, NK cells from SLE patients displayed a reduced capacity to promote the RNA-IC–induced IFN-α production, which could be restored by exogenous IL-12 and IL-18. Thus, different molecular mechanisms can mediate the NK cell-dependent increase in IFN-α production by RNA-IC–stimulated pDCs, and our study suggests that the possibility to therapeutically target the NK–pDC axis in IFN-α–driven autoimmune diseases such as SLE should be investigated.

    Nyckelord
    interferon, plasmacytoid dendritic cells, MIP-1beta, NK cells
    Nationell ämneskategori
    Reumatologi och inflammation
    Forskningsämne
    Medicin
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-150274 (URN)10.4049/jimmunol.1003349 (DOI)000289679600011 ()21430220 (PubMedID)
    Tillgänglig från: 2011-03-29 Skapad: 2011-03-29 Senast uppdaterad: 2017-12-11Bibliografiskt granskad
    2. B lymphocytes enhance the interferon-α production by plasmacytoid dendritic cells
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>B lymphocytes enhance the interferon-α production by plasmacytoid dendritic cells
    Visa övriga...
    2012 (Engelska)Ingår i: Arthritis and Rheumatism, ISSN 0004-3591, E-ISSN 1529-0131, Vol. 64, nr 10, s. 3409-3419Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Abstract [en]

    OBJECTIVE:

    Type I interferon (IFN) system and B cells are activated in many autoimmune diseases, e.g. systemic lupus erythematosus (SLE). IFNα produced by plasmacytoid dendritic cells (pDC) stimulate several B cell functions, including autoantibody production. However, not much is known how B cells influence the pDC function. We therefore investigated the regulatory effect of B cells on IFNα production by pDC.

    METHODS:

    PDC and B cells from healthy blood donor PBMC were stimulated with RNA-containing immune complexes (RNA-IC) consisting of U1 snRNP and IgG from SLE patients, herpes simplex virus (HSV) or oligonucleotide ODN2216, alone or in co-cultures. IFNα, several other cytokines and pDC or B cell-associated surface molecules were analyzed by immunoassays or flow cytometry.

    RESULTS:

    B cells enhanced the IFNα production by pDC up to 47-fold, and the effect was most pronounced for pDC stimulated with RNA-IC. Anti-CD31 antibody reduced the RNA-IC-induced IFNα production by 80%, but not when ODN2216 was used as IFN-inducer. Supernatants from ODN2216-stimulated B cells promoted IFNα production by pDC, while supernatants from RNA-IC-stimulated B cells did not.

    CONCLUSION:

    Our results reveal a novel B cell function, enhancing the type I IFN production by pDC. Since B cells are activated by type I IFN, this pDC-B cell cross-talk might be of fundamental importance in the etiopathogenesis of SLE, and contribute to a chronic immune activation in SLE and other systemic rheumatic diseases.

    Nationell ämneskategori
    Medicin och hälsovetenskap
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-177989 (URN)10.1002/art.34599 (DOI)000309403000039 ()22736048 (PubMedID)
    Tillgänglig från: 2012-07-23 Skapad: 2012-07-23 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    3. IFN-α production by plasmacytoid dendritic cell associations with polymorphisms in gene loci related to autoimmune and inflammatory diseases
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>IFN-α production by plasmacytoid dendritic cell associations with polymorphisms in gene loci related to autoimmune and inflammatory diseases
    Visa övriga...
    2015 (Engelska)Ingår i: Human Molecular Genetics, ISSN 0964-6906, E-ISSN 1460-2083, Vol. 24, nr 12, s. 3571-3581Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Abstract [en]

    The type I interferon (IFN) system is persistently activated in systemic lupus erythematosus (SLE) and many other systemic autoimmune diseases. Studies have shown an association between SLE and several gene variants within the type I IFN system. We investigated whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with SLE and other autoimmune diseases affect the IFN-α production in healthy individuals. Plasmacytoid dendritic cells (pDCs), B and NK cells were isolated from peripheral blood of healthy individuals and stimulated with RNA-containing immune complexes (IC), herpes simplex virus (HSV) or the oligonucleotide ODN2216. IFN-α production by pDCs alone or in cocultures with B or NK cells was measured by an immunoassay. All donors were genotyped with the 200K ImmunoChip and a 5bp CGGGG length polymorphism in the IFN regulatory factor 5 gene (IRF5) was genotyped by PCR. We found associations between IFN-α production and 18-86 SNPs (p ≤ 0.001), depending on the combination of the stimulated cell types. However, only three of these associated SNPs were shared between the cell type combinations. Several SNPs showed novel associations to the type I IFN system among all the associated SNPs, while some loci have been described earlier for their association with SLE. Furthermore, we found that the SLE-risk variant of the IRF5 CGGGG-indel was associated with lower IFN-α production. We conclude that the genetic variants affecting the IFN-α production highlight the intricate regulation of the type I IFN system and the importance of understanding the mechanisms behind the dysregulated type I IFN system in SLE.

    Nationell ämneskategori
    Reumatologi och inflammation
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-246523 (URN)10.1093/hmg/ddv095 (DOI)000355674400023 ()
    Tillgänglig från: 2015-03-09 Skapad: 2015-03-09 Senast uppdaterad: 2017-12-04Bibliografiskt granskad
    4. Activated plasmacytoid dendritic cells alter the composition of peripheral blood B cell subsets
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Activated plasmacytoid dendritic cells alter the composition of peripheral blood B cell subsets
    (Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
    Nationell ämneskategori
    Reumatologi och inflammation
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-246525 (URN)
    Tillgänglig från: 2015-03-09 Skapad: 2015-03-09 Senast uppdaterad: 2015-04-17
  • 2.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alexsson, Andrei
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alm, Gunnar V.
    Syvanen, Ann-Christine
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Variation of Interferon-Alpha Production in Healthy Individuals and Association with Autoimmune Susceptibility Genes2012Ingår i: Arthritis and Rheumatism, ISSN 0004-3591, E-ISSN 1529-0131, Vol. 64, nr S10, s. S961-S961Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 3.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alexsson, Andrei
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Morris, David
    King’s College London School of Medicine, Guy’s Hospital, London.
    Tandre, Karolina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Weber, Gert
    Free University of Berlin.
    Vyse, Timothy
    King’s College London School of Medicine, Guy’s Hospital, London.
    Syvänen, Ann-Christine
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    IFN-α production by plasmacytoid dendritic cell associations with polymorphisms in gene loci related to autoimmune and inflammatory diseases2015Ingår i: Human Molecular Genetics, ISSN 0964-6906, E-ISSN 1460-2083, Vol. 24, nr 12, s. 3571-3581Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The type I interferon (IFN) system is persistently activated in systemic lupus erythematosus (SLE) and many other systemic autoimmune diseases. Studies have shown an association between SLE and several gene variants within the type I IFN system. We investigated whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with SLE and other autoimmune diseases affect the IFN-α production in healthy individuals. Plasmacytoid dendritic cells (pDCs), B and NK cells were isolated from peripheral blood of healthy individuals and stimulated with RNA-containing immune complexes (IC), herpes simplex virus (HSV) or the oligonucleotide ODN2216. IFN-α production by pDCs alone or in cocultures with B or NK cells was measured by an immunoassay. All donors were genotyped with the 200K ImmunoChip and a 5bp CGGGG length polymorphism in the IFN regulatory factor 5 gene (IRF5) was genotyped by PCR. We found associations between IFN-α production and 18-86 SNPs (p ≤ 0.001), depending on the combination of the stimulated cell types. However, only three of these associated SNPs were shared between the cell type combinations. Several SNPs showed novel associations to the type I IFN system among all the associated SNPs, while some loci have been described earlier for their association with SLE. Furthermore, we found that the SLE-risk variant of the IRF5 CGGGG-indel was associated with lower IFN-α production. We conclude that the genetic variants affecting the IFN-α production highlight the intricate regulation of the type I IFN system and the importance of understanding the mechanisms behind the dysregulated type I IFN system in SLE.

  • 4.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alexsson, Andrei
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Tandre, Karolina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Syvanen, A-C
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Effect of single-nucleotide polymorphisms on type I interferon production by plasmacytoid dendritic cells stimulated with SLE-associated immune complexes2014Ingår i: Scandinavian Journal of Rheumatology, ISSN 0300-9742, E-ISSN 1502-7732, Vol. 43, nr S127, s. 92-92Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 5.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Alexsson, Andrei
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Weber, Gert
    Ernst Moritz Arndt Univ Greifswald, Inst Biochem, Dept Mol Struct Biol, Greifswald, Germany..
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Plasmacytoid dendritic cells and RNA-containing immune complexes drive expansion of peripheral B cell subsets with an SLE-like phenotype2017Ingår i: PLoS ONE, ISSN 1932-6203, E-ISSN 1932-6203, Vol. 12, nr 8, artikel-id e0183946Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background Hyperactive B cells and a continuous interferon (IFN)-alpha production by plasmacytoid dendritic cells (pDCs) play a key role in systemic lupus erythematosus (SLE). We asked whether the interaction between B cells and pDCs stimulated with RNA-containing immune complexes affects peripheral B cell subsets. Methods B cells and pDCs were isolated from blood of healthy individuals and stimulated with immune complexes consisting of SLE-IgG and U1snRNP (RNA-IC). Expression of cell surface molecules as well as IL-6 and IL-10 production were determined by flow cytometry and immunoassays. Gene expression profiles were determined by a NanoString nCounter expression array. Results We found a remarkable increase of double negative CD27-IgD-B cells, from 7% within fresh CD19+B cells to 37% in the RNA-IC-stimulated co-cultures of B cells and pDCs, comparable to the frequency of double negative B cells in SLE patients. Gene expression analysis of the double negative CD27-IgD -and the CD27 + IgD-memory B cells revealed that twenty-one genes were differentially expressed between the two B cell subsets (>= 2-fold, p< 0.001). The, IL21R, IL4R, CCL4, CCL3, CD83 and the IKAROS Family Zinc Finger 2 (IKZ2) showed higher expression in the double negative CD27-IgD-B cells. Conclusion The interactions between B cells and pDCs together with RNA-containing IC led to an expansion of B cells with similar phenotype as seen in SLE, suggesting that the pDC-B cell crosstalk contributes to the autoimmune feed-forward loop in SLE.

  • 6.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Weber, Gert
    Alm, Gunnar V
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    B lymphocytes enhance the interferon-α production by plasmacytoid dendritic cells2012Ingår i: Arthritis and Rheumatism, ISSN 0004-3591, E-ISSN 1529-0131, Vol. 64, nr 10, s. 3409-3419Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    OBJECTIVE:

    Type I interferon (IFN) system and B cells are activated in many autoimmune diseases, e.g. systemic lupus erythematosus (SLE). IFNα produced by plasmacytoid dendritic cells (pDC) stimulate several B cell functions, including autoantibody production. However, not much is known how B cells influence the pDC function. We therefore investigated the regulatory effect of B cells on IFNα production by pDC.

    METHODS:

    PDC and B cells from healthy blood donor PBMC were stimulated with RNA-containing immune complexes (RNA-IC) consisting of U1 snRNP and IgG from SLE patients, herpes simplex virus (HSV) or oligonucleotide ODN2216, alone or in co-cultures. IFNα, several other cytokines and pDC or B cell-associated surface molecules were analyzed by immunoassays or flow cytometry.

    RESULTS:

    B cells enhanced the IFNα production by pDC up to 47-fold, and the effect was most pronounced for pDC stimulated with RNA-IC. Anti-CD31 antibody reduced the RNA-IC-induced IFNα production by 80%, but not when ODN2216 was used as IFN-inducer. Supernatants from ODN2216-stimulated B cells promoted IFNα production by pDC, while supernatants from RNA-IC-stimulated B cells did not.

    CONCLUSION:

    Our results reveal a novel B cell function, enhancing the type I IFN production by pDC. Since B cells are activated by type I IFN, this pDC-B cell cross-talk might be of fundamental importance in the etiopathogenesis of SLE, and contribute to a chronic immune activation in SLE and other systemic rheumatic diseases.

  • 7.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Activated plasmacytoid dendritic cells alter the composition of peripheral blood B cell subsetsManuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
  • 8.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Activated Plasmacytoid Dendritic Cells (PDCS) Alter The Composition of The Blood B Cell Subsets2016Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases, ISSN 0003-4967, E-ISSN 1468-2060, Vol. 75, s. 179-179Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 9.
    Berggren, Olof
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    The effect of PTPN22 Gene Variant R620W on the Type I Interferon Production Stimulated by Different TLR7 Agonists: Comment on Article by Wang et al (pages 2403-2414)2016Ingår i: Arthritis & Rheumatology, ISSN 2326-5191, E-ISSN 2326-5205, Vol. 68, nr 4, s. 1045-1045Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 10.
    Cavalli, Marco
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Pan, Gang
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Nord, Helena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Wallerman, Ola
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Arzt, Emelie Wallén
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Karolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Ctr Biosci, Huddinge, Sweden..
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Elvers, Ingegerd
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi. Broad Inst MIT & Harvard, Cambridge, MA USA..
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Toh, Kerstin Lindblad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi. Broad Inst MIT & Harvard, Cambridge, MA USA..
    Wadelius, Claes
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Allele-specific transcription factor binding to common and rare variants associated with disease and gene expression2016Ingår i: Human Genetics, ISSN 0340-6717, E-ISSN 1432-1203, Vol. 135, nr 5, s. 485-497Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Genome-wide association studies (GWAS) have identified a large number of disease-associated SNPs, but in few cases the functional variant and the gene it controls have been identified. To systematically identify candidate regulatory variants, we sequenced ENCODE cell lines and used public ChIP-seq data to look for transcription factors binding preferentially to one allele. We found 9962 candidate regulatory SNPs, of which 16 % were rare and showed evidence of larger functional effect than common ones. Functionally rare variants may explain divergent GWAS results between populations and are candidates for a partial explanation of the missing heritability. The majority of allele-specific variants (96 %) were specific to a cell type. Furthermore, by examining GWAS loci we found >400 allele-specific candidate SNPs, 141 of which were highly relevant in our cell types. Functionally validated SNPs support identification of an SNP in SYNGR1 which may expose to the risk of rheumatoid arthritis and primary biliary cirrhosis, as well as an SNP in the last intron of COG6 exposing to the risk of psoriasis. We propose that by repeating the ChIP-seq experiments of 20 selected transcription factors in three to ten people, the most common polymorphisms can be interrogated for allele-specific binding. Our strategy may help to remove the current bottleneck in functional annotation of the genome.

  • 11.
    Hagberg, Niklas
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Leonard, Dag
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Weber, Gert
    Bryceson, Yenan T.
    Alm, Gunnar V.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    IFN-α Production by Plasmacytoid Dendritic Cells Stimulated with RNA-Containing Immune Complexes Is Promoted by NK Cells via MIP-1β and LFA-12011Ingår i: Journal of Immunology, ISSN 0022-1767, E-ISSN 1550-6606, Vol. 186, nr 9, s. 5085-5094Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Several systemic autoimmune diseases display a prominent IFN signature. This is caused by a continuous IFN-α production by plasmacytoid dendritic cells (pDCs), which are activated by immune complexes (ICs) containing nucleic acid. The IFN-α production by pDCs stimulated with RNA-containing IC (RNA-IC) consisting of anti-RNP autoantibodies and U1 small nuclear ribonucleoprotein particles was recently shown to be inhibited by monocytes, but enhanced by NK cells. The inhibitory effect of monocytes was mediated by TNF-α, PGE2, and reactive oxygen species, but the mechanisms for the NK cell-mediated increase in IFN-α production remained unclear. In this study, we investigated the mechanisms whereby NK cells increase the RNA-IC–induced IFN-α production by pDCs. Furthermore, NK cells from patients with systemic lupus erythematosus (SLE) were evaluated for their capacity to promote IFN-α production. We found that CD56dim NK cells could increase IFN-α production >1000-fold after RNA-IC activation, whereas CD56bright NK cells required costimulation by IL-12 and IL-18 to promote IFN-α production. NK cells produced MIP-1α, MIP-1β, RANTES, IFN-γ, and TNF-α via RNA-IC–mediated FcγRIIIA activation. The IFN-α production in pDCs was promoted by NK cells via MIP-1β secretion and LFA-mediated cell–cell contact. Moreover, NK cells from SLE patients displayed a reduced capacity to promote the RNA-IC–induced IFN-α production, which could be restored by exogenous IL-12 and IL-18. Thus, different molecular mechanisms can mediate the NK cell-dependent increase in IFN-α production by RNA-IC–stimulated pDCs, and our study suggests that the possibility to therapeutically target the NK–pDC axis in IFN-α–driven autoimmune diseases such as SLE should be investigated.

  • 12.
    Hjorton, Karin
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Mo, J.
    AstraZeneca R&D, Mölndal, Sweden.
    Sandling, Johanna K.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    The Effect of Hydroxychloroquine and IRAK4 Inhibition on The IFN-A and TNF-A Production Induced by Sle Related Immune Complexes2016Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases, ISSN 0003-4967, E-ISSN 1468-2060, Vol. 75, s. 277-277Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 13.
    Hjorton, Karin
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Israelsson, E.
    AstraZeneca, Innovat Med & Early Dev Biotech Unit, Biosci Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Sandling, Johanna K.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Thorn, K.
    AstraZeneca, Innovat Med & Early Dev Biotech Unit, Biosci Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Mo, J.
    AstraZeneca, Innovat Med & Early Dev Biotech Unit, Biosci Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Eloranta, M. -L
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Cytokine production by activated plasmacytoid dendritic cells and NK cells is suppressed by an IRAK4 inhibitor2018Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases, ISSN 0003-4967, E-ISSN 1468-2060, Vol. 77, s. 1268-1269Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 14.
    Hjorton, Karin
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Israelsson, Elisabeth
    AstraZeneca, IMED Biotech Unit, Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Jinton, Lisa
    AstraZeneca, IMED Biotech Unit, Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Sandling, Johanna K.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Thörn, Kristofer
    AstraZeneca, IMED Biotech Unit, Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Mo, John
    AstraZeneca, IMED Biotech Unit, Resp Inflammat & Autoimmun, Gothenburg, Sweden.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. SciLifeLaboratory.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Cytokine production by activated plasmacytoid dendritic cells and natural killer cells is suppressed by an IRAK4 inhibitor2018Ingår i: Arthritis Research & Therapy, ISSN 1478-6354, E-ISSN 1478-6362, Vol. 20, artikel-id 238Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background: In systemic lupus erythematosus (SLE), immune complexes (ICs) containing self-derived nucleic acids trigger the synthesis of proinflammatory cytokines by immune cells. We asked how an interleukin (IL)-1 receptor-associated kinase 4 small molecule inhibitor (IRAK4i) affects RNA-IC-induced cytokine production compared with hydroxychloroquine (HCQ).

    Methods: Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) and natural killer (NK) cells were isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of healthy individuals. PBMCs from SLE patients and healthy individuals were depleted of monocytes. Cells were stimulated with RNA-containing IC (RNA-IC) in the presence or absence of IRAK4i I92 or HCQ, and cytokines were measured by immunoassay or flow cytometry. Transcriptome sequencing was performed on RNA-IC-stimulated pDCs from healthy individuals to assess the effect of IRAK4i and HCQ.

    Results: In healthy individuals, RNA-IC induced interferon (IFN)-α, tumor necrosis factor (TNF)-α, IL-6, IL-8, IFN-γ, macrophage inflammatory protein (MIP)1-α, and MIP1-β production in pDC and NK cell cocultures. IFN-α production was selective for pDCs, whereas both pDCs and NK cells produced TNF-α. IRAK4i reduced the pDC and NK cell-derived cytokine production by 74–95%. HCQ interfered with cytokine production in pDCs but not in NK cells. In monocyte-depleted PBMCs, IRAK4i blocked cytokine production more efficiently than HCQ. Following RNA-IC activation of pDCs, 975 differentially expressed genes were observed (false discovery rate (FDR) < 0.05), with many connected to cytokine pathways, cell regulation, and apoptosis. IRAK4i altered the expression of a larger number of RNA-IC-induced genes than did HCQ (492 versus 65 genes).

    Conclusions: The IRAK4i I92 exhibits a broader inhibitory effect than HCQ on proinflammatory pathways triggered by RNA-IC, suggesting IRAK4 inhibition as a therapeutic option in SLE.

  • 15. Leonard, Dag
    et al.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Tandre, Karolina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alm, G.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Activated T cells enhance interferon-alpha production by plasmacytoid dendritic cells stimulated by RNA-containing immune complexes2014Ingår i: Scandinavian Journal of Rheumatology, ISSN 0300-9742, E-ISSN 1502-7732, Vol. 43, nr S127, s. 88-89Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 16.
    Leonard, Dag
    et al.
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Tandre, Karolina
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alm, Gunnar
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Activated SLE-T Cells Enhance the Interferon-Alpha Production By Plasmacytoid Dendritic Cells Stimulated By RNA-IC2014Ingår i: Arthritis & Rheumatology, ISSN 2326-5191, Vol. 66, nr S10, s. S1173-S1173, artikel-id 2681Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 17.
    Leonard, Dag
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Tandre, Karolina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Alm, Gunnar
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Activated T cells enhance interferon-alpha production by plasmacytoid dendritic cells stimulated by RNA-containing immune complexesManuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
  • 18.
    Leonard, Dag
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Svenungsson, E.
    Sandling, J. K.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Jonsen, A.
    Bengtsson, C.
    Wang, C.
    Jensen-Urstad, K.
    Granstam, Sven-Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk fysiologi.
    Bengtsson, A. A.
    Gustafsson, J. T.
    Gunnarsson, I.
    Rantapaa-Dahlqvist, S.
    Nordmark, Gunnel
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Syvanen, A-C
    Ronnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Coronary Heart Disease in Systemic Lupus Erythematosus is Associated with Interferon Regulatory Factor 8 Gene Variants2013Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases, ISSN 0003-4967, E-ISSN 1468-2060, Vol. 72, nr S3, s. 270-270Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 19.
    Leonard, Dag
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Svenungsson, Elisabet
    Sandling, Johanna K
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Jönsen, Andreas
    Bengtsson, Christine
    Wang, Chuan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Jensen-Urstad, Kerstin
    Granstam, Sven-Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Klinisk fysiologi.
    Bengtsson, Anders A
    Gustafsson, Johanna T
    Gunnarsson, Iva
    Rantapää-Dahlqvist, Solbritt
    Nordmark, Gunnel
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Syvänen, Ann-Christine
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Coronary heart disease in systemic lupus erythematosus is associated with interferon regulatory factor-8 gene variants2013Ingår i: Circulation: Cardiovascular Genetics, ISSN 1942-325X, E-ISSN 1942-3268, Vol. 6, nr 3, s. 255-263Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background- Patients with systemic lupus erythematosus have increased morbidity and mortality in coronary heart disease (CHD). We asked whether there was a genetic influence on CHD in systemic lupus erythematosus. Methods and Results- The association between single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and CHD in 2 populations of patients with systemic lupus erythematosus was assessed. Patients were genotyped on a custom 12k Illumina Array. The allele frequencies were compared between patients with (n=66) and without (n=509) CHD. We found 61 SNPs with an association (P<0.01) to CHD, with the strongest association for 3 SNPs located in the interferon regulatory factor-8 (IRF8) gene. Comparison of the allele frequencies of these 61 SNPs in patients with (n=27) and without (n=212) CHD in the second study population revealed that 2 SNPs, rs925994 and rs10514610 in IRF8 (linkage disequilibrium, r(2)=0.84), were associated with CHD in both study populations. Meta-analysis of the SNP rs925994 gave an odds ratio of 3.6 (2.1-6.3), P value 1.9×10(-6). The identified IRF8 allele remained as a risk factor for CHD after adjustment for traditional CHD risk factors. The IRF8 risk allele was associated with the presence of carotid plaques (P<0.001) and increased intima-media thickness (P=0.01). By electrophoretic mobility shift assays, we show weaker binding of protein to the risk allele of the highly linked SNP rs11117415, and by flow cytometry, a reduced frequency of circulating B cells was detected in patients with the IRF8 risk allele. Conclusions- There is a considerable genetic component for CHD in systemic lupus erythematosus, with IRF8 as a strong susceptibility locus.

  • 20.
    Wang, Chuan
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Sandling, Johanna K
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Hagberg, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Berggren, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Sigurdsson, Snaevar
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Karlberg, Olof
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Rönnblom, Lars
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Eloranta, Maija-Leena
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Reumatologi.
    Syvänen, Ann-Christine
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin.
    Genome-wide profiling of target genes for the systemic lupus erythematosus-associated transcription factors IRF5 and STAT42013Ingår i: Annals of the Rheumatic Diseases, ISSN 0003-4967, E-ISSN 1468-2060, Vol. 72, nr 1, s. 96-103Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    BACKGROUND:

    The transcription factors interferon regulatory factor 5 (IRF5) and signal transducer and activator of transcription 4 (STAT4) are encoded by two of the strongest susceptibility genes for systemic lupus erythematosus (SLE).

    OBJECTIVE:

    To investigate the target genes and functional roles of IRF5 and STAT4 in human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs).

    METHODS:

    Chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) was performed in PBMCs stimulated to activate IRF5 and STAT4. The expression of the target genes of IRF5 and STAT4 was investigated in a publicly available dataset generated from PBMCs from patients with SLE and healthy controls. The genomic regions bound by the transcription complexes mediated by IRF5 and STAT4 were examined for transcription factor binding motifs and SLE-associated sequence variants.

    RESULTS:

    More than 7000 target genes for IRF5 and STAT4 were identified in stimulated PBMCs. These genes were enriched to functional pathways in the type I interferon system, and have key roles in the inflammatory response. The expression patterns of the target genes were characteristic for patients with SLE. The transcription factors high mobility group-I/Y, specificity protein 1, and paired box 4 may function cooperatively with IRF5 and STAT4 in transcriptional regulation. Eight of the target regions for IRF5 and STAT4 contain SLE-associated sequence variants.

    CONCLUSIONS:

    By participating in transcription complex with other co-factors, IRF5 and STAT4 harbour the potential of regulating a large number of target genes, which may contribute to their strong association with SLE.

1 - 20 av 20
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf