uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
3456789 251 - 300 av 762
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 251.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    A stable and efficient hybrid scheme for viscous problems in complex geometries2007Ingår i: Journal of Computational Physics, ISSN 0021-9991, E-ISSN 1090-2716, Vol. 226, s. 1291-1309Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 252.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    A Stable and Efficient Hybrid Scheme for Viscous Problems in Complex Geometries2007Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 253.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    A Stable Hybrid Method for Hyperbolic Problems2004Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 254.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Interface procedures for finite difference approximations of the advection-diffusion equation2011Ingår i: Journal of Computational and Applied Mathematics, ISSN 0377-0427, E-ISSN 1879-1778, Vol. 236, s. 602-620Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 255.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Stable, Accurate and Efficient Interface Procedures for Viscous Problems2006Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 256.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    van der Weide, Edwin
    A Hybrid Method for the Unsteady Compressible Navier-Stokes Equations2007Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 257.
    Gong, Jing
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Svärd, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Artificial Dissipation for Strictly Stable Finite Volume Methods on Unstructured Meshes2004Ingår i: Computational Mechanics Abstracts: Volume II, Beijing, China: Tsinghua University Press , 2004, s. 7-7Konferensbidrag (Övrigt vetenskapligt)
  • 258. Gottlieb, David
    et al.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Forssén, Patrik
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    On the Direct Fourier Method for Computer Tomography2000Ingår i: IEEE Transactions on Medical Imaging, ISSN 0278-0062, E-ISSN 1558-254X, Vol. 19, s. 223-232Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 259. Gravemeier, Volker
    et al.
    Gee, Michael W.
    Kronbichler, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Wall, Wolfgang A.
    An algebraic variational multiscale–multigrid method for large eddy simulation of turbulent flow2010Ingår i: Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, ISSN 0045-7825, E-ISSN 1879-2138, Vol. 199, s. 853-864Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 260. Gravemeier, Volker
    et al.
    Kronbichler, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Gee, Michael W.
    Wall, Wolfgang A.
    An algebraic variational multiscale–multigrid method for large-eddy simulation: Generalized-α time integration, Fourier analysis and application to turbulent flow past a square-section cylinder2011Ingår i: Computational Mechanics, ISSN 0178-7675, E-ISSN 1432-0924, Vol. 47, s. 217-233Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 261. Gravemeier, Volker
    et al.
    Kronbichler, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Wall, Wolfgang A.
    Variational multiscale methods for large eddy simulation of turbulent flows: Fourier analysis and application to diffuser flow2007Ingår i: Proc. 5th International Symposium on Turbulence and Shear Flow Phenomena, Garching, Germany: TU München , 2007, s. 461-466Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 262.
    Grönlund, Andreas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Matematiska institutionen, Analys och tillämpad matematik.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Elf, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi.
    Costs and constraints from time-delayed feedback in small gene regulatory motifs2010Ingår i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, ISSN 0027-8424, E-ISSN 1091-6490, Vol. 107, s. 8171-8176Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 263.
    Grönlund, Andreas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Matematiska institutionen, Analys och tillämpad matematik.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Elf, Johan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Beräknings- och systembiologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Delay-induced anomalous fluctuations in intracellular regulation2011Ingår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 2, s. 419:1-7Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 264.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Fundamentals of Scientific Computing2011Bok (Övrigt vetenskapligt)
  • 265.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    High Order Difference Methods for Time Dependent PDE2008Bok (Refereegranskat)
  • 266.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    The Godunov–Ryabenkii condition: The beginning of a new stability theory1999Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 267.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    The Godunov–Ryabenkii condition: The beginning of a new stability theory2001Ingår i: Godunov Methods: Theory and Applications, New York: Kluwer/Plenum , 2001, s. 425-443Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 268.
    Gustafsson, Bertil
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    The work of David Gottlieb: a success story2011Ingår i: Communications in Computational Physics, ISSN 1815-2406, E-ISSN 1991-7120, Vol. 9, s. 481-496Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat)
  • 269.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Hemmingsson-Frändén, Lina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    A fast domain decomposition high order Poisson solver1999Ingår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 14, s. 223-243Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 270.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Hemmingsson-Frändén, Lina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Deferred correction in space and time2002Ingår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 17, s. 541-550Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 271.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Hemmingsson-Frändén, Lina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    High order methods and domain decomposition2001Ingår i: Absorbing Boundaries and Layers, Domain Decomposition Methods: Applications to Large Scale Computers, Huntington, NY: Nova Science Publishers , 2001, s. 341-347Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
  • 272.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Hemmingsson-Frändén, Lina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Implicit high-order difference methods and domain decomposition for hyperbolic problems2000Ingår i: Applied Numerical Mathematics, ISSN 0168-9274, E-ISSN 1873-5460, Vol. 33, s. 493-500Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 273.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Khalighi, Yaser
    The shifted box scheme for scalar transport problems2006Ingår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 28, s. 319-335Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 274.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Kress, Wendy
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Deferred Correction Methods for Initial Value Problems2001Ingår i: BIT Numerical Mathematics, ISSN 0006-3835, E-ISSN 1572-9125, Vol. 41, s. 986-995Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 275.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Göran, Anders
    A fourth order difference method for the incompressible Navier-Stokes equations2003Ingår i: Numerical Simulations of Incompressible Flows, River Edge, NJ: World Scientific Publishing , 2003, s. 263-276Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 276.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Mossberg, Eva
    Karlstad University, Department of Mathematics.
    Time Compact High Order Difference Methods for Wave Propagation2004Ingår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 26, s. 259-271Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 277.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Mossberg, Eva
    Karlstad University, Department of Mathematics.
    Time Compact High Order Difference Methods for Wave Propagation2003Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 278.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nilsson, Jonas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Boundary conditions and estimates for the steady Stokes equations on staggered grids1999Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 279.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nilsson, Jonas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Boundary Conditions and Estimates for the Steady Stokes Equations on Staggered Grids2000Ingår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 15, s. 29-59Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 280.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Nilsson, Jonas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Fourth order methods for the Stokes and Navier-Stokes equations on staggered grids2002Ingår i: Frontiers of Computational Fluid Dynamics: 2002, River Edge, NJ: World Scientific Publishing , 2002, s. 165-179Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 281.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Wahlund, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Time Compact Difference Methods for Wave Propagation in Discontinuous Media2004Ingår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 26, s. 272-293Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 282.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Wahlund, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Time Compact Difference Methods for Wave Propagation in Discontinuous Media2003Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 283.
    Gustafsson, Bertil
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Wahlund, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Time compact high order difference methods for wave propagation, 2D2005Ingår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 25, s. 195-211Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 284.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers2010Ingår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: 2009, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 417-424Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 285.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Efficient implementation of a high-dimensional PDE-solver on multicore processors2009Ingår i: Proc. 2nd Swedish Workshop on Multi-Core Computing, Uppsala, Sweden: Department of Information Technology, Uppsala University , 2009, s. 64-66Konferensbidrag (Övrigt vetenskapligt)
  • 286.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nissen, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Kormann, Katharina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Stable difference methods for block-structured adaptive grids2011Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 287. Hagstrom, Thomas
    et al.
    Nordström, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Analysis of extrapolation boundary conditions for the linearized Euler equations2003Ingår i: Applied Numerical Mathematics, ISSN 0168-9274, E-ISSN 1873-5460, Vol. 44, s. 95-108Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 288. Ham, Frank
    et al.
    Mattsson, Ken
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Iaccarino, Gianluca
    Moin, Parviz
    Towards time-stable and accurate LES on unstructured grids2007Ingår i: Complex Effects in Large Eddy Simulations, Berlin: Springer-Verlag , 2007, s. 235-249Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
  • 289.
    He, Xin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Robust preconditioning methods for algebraic problems, arising in multi-phase flow models2011Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    The aim of the project is to construct, analyse and implement fast and reliable numerical solution methods to simulate multi-phase flow, modeled by a coupled system consisting of the time-dependent Cahn-Hilliard and incompressible Navier-Stokes equations with variable viscosity and variable density. This thesis mainly discusses the efficient solution methods for the latter equations aiming at constructing preconditioners, which are numerically and computationally efficient, and robust with respect to various problem, discretization and method parameters.

    In this work we start by considering the stationary Navier-Stokes problem with constant viscosity. The system matrix arising from the finite element discretization of the linearized Navier-Stokes problem is nonsymmetric of saddle point form, and solving systems with it is the inner kernel of the simulations of numerous physical processes, modeled by the Navier-Stokes equations. Aiming at reducing the simulation time, in this thesis we consider iterative solution methods with efficient preconditioners. When discretized with the finite element method, both the Cahn-Hilliard equations and the stationary Navier-Stokes equations with constant viscosity give raise to linear algebraic systems with nonsymmetric matrices of two-by-two block form. In Paper I we study both problems and apply a common general framework to construct a preconditioner, based on the matrix structure. As a part of the general framework, we use the so-called element-by-element Schur complement approximation. The implementation of this approximation is rather cheap. However, the numerical experiments, provided in the paper, show that the preconditioner is not fully robust with respect to the problem and discretization parameters, in this case the viscosity and the mesh size. On the other hand, for not very convection-dominated flows, i.e., when the viscosity is not very small, this approximation does not depend on the mesh size and works efficiently. Considering the stationary Navier-Stokes equations with constant viscosity, aiming at finding a preconditioner which is fully robust to the problem and discretization parameters, in Paper II we turn to the so-called augmented Lagrangian (AL) approach, where the linear system is transformed into an equivalent one and then the transformed system is iteratively solved with the AL type preconditioner. The analysis in Paper II focuses on two issues, (1) the influence of a scalar method parameter (a stabilization constant in the AL method) on the convergence rate of the preconditioned method and (2) the choice of a matrix parameter for the AL method, which involves an approximation of the inverse of the finite element mass matrix. In Paper III we consider the stationary Navier-Stokes problem with variable viscosity. We show that the known efficient preconditioning techniques in particular, those for the AL method, derived for constant viscosity, can be straightforwardly applicable also in this case.

    One often used technique to solve the incompressible Navier-Stokes problem with variable density is via operator splitting, i.e., decoupling of the solutions for density, velocity and pressure. The operator splitting technique introduces an additional error, namely the splitting error, which should be also considered, together with discretization errors in space and time. Insuring the accuracy of the splitting scheme usually induces additional constrains on the size of the time-step. Aiming at fast numerical simulations and using large time-steps may require to use higher order time-discretization methods. The latter issue and its impact on the preconditioned iterative solution methods for the arising linear systems are envisioned as possible directions for future research.

    When modeling multi-phase flows, the Navier-Stokes equations should be considered in their full complexity, namely, the time-dependence, variable viscosity and variable density formulation. Up to the knowledge of the author, there are not many studies considering all aspects simultaneously. Issues on this topic, in particular on the construction of efficient preconditioners of the arising matrices need to be further studied.

    Delarbeten
    1. Element-by-element Schur complement approximations for general nonsymmetric matrices of two-by-two block form
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Element-by-element Schur complement approximations for general nonsymmetric matrices of two-by-two block form
    2010 (Engelska)Ingår i: Large-Scale Scientific Computing, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 108-115Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
    Ort, förlag, år, upplaga, sidor
    Berlin: Springer-Verlag, 2010
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 5910
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-125577 (URN)10.1007/978-3-642-12535-5_11 (DOI)000278091900011 ()978-3-642-12534-8 (ISBN)
    Tillgänglig från: 2010-05-10 Skapad: 2010-05-24 Senast uppdaterad: 2018-01-12Bibliografiskt granskad
    2. On an augmented Lagrangian-based preconditioning of Oseen type problems
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>On an augmented Lagrangian-based preconditioning of Oseen type problems
    2011 (Engelska)Ingår i: BIT Numerical Mathematics, ISSN 0006-3835, E-ISSN 1572-9125, Vol. 51, s. 865-888Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-156201 (URN)10.1007/s10543-011-0334-4 (DOI)000297362000005 ()
    Tillgänglig från: 2011-06-07 Skapad: 2011-07-17 Senast uppdaterad: 2019-01-22Bibliografiskt granskad
    3. Preconditioning the incompressible Navier-Stokes equations with variable viscosity
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Preconditioning the incompressible Navier-Stokes equations with variable viscosity
    2011 (Engelska)Rapport (Övrigt vetenskapligt)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2011-006
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-151675 (URN)
    Tillgänglig från: 2011-04-05 Skapad: 2011-04-15 Senast uppdaterad: 2018-01-12Bibliografiskt granskad
  • 290.
    He, Xin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Preconditioning the incompressible Navier-Stokes equations with variable viscosity2011Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 291.
    He, Xin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Serra Capizzano, Stefano
    On an augmented Lagrangian-based preconditioning of Oseen type problems2011Ingår i: BIT Numerical Mathematics, ISSN 0006-3835, E-ISSN 1572-9125, Vol. 51, s. 865-888Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 292.
    He, Xin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Serra Capizzano, Stefano
    On an augmented Lagrangian-based preconditioning of Oseen type problems2010Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 293. Hegland, Markus
    et al.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Sparse grids and hybrid methods for the chemical master equation2008Ingår i: BIT Numerical Mathematics, ISSN 0006-3835, E-ISSN 1572-9125, Vol. 48, s. 265-283Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 294. Heister, Timo
    et al.
    Kronbichler, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Bangerth, Wolfgang
    Generic finite element programming for massively parallel flow simulations2010Ingår i: Proc. ECCOMAS CFD Conference 2010, Portugal: Tech. Univ. Lisbon , 2010, s. 10-Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 295. Heister, Timo
    et al.
    Kronbichler, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Bangerth, Wolfgang
    Massively parallel finite element programming2010Ingår i: Recent Advances in the Message Passing Interface, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 122-131Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 296.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and Quasi-Monte Carlo2007Rapport (Övrigt vetenskapligt)
  • 297.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and quasi-Monte Carlo2008Ingår i: Journal of Chemical Physics, ISSN 0021-9606, E-ISSN 1089-7690, Vol. 128, s. 154109:1-7Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 298.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Multiscale Stochastic Simulation of Reaction-Transport Processes: Applications in Molecular Systems Biology2011Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Quantitative descriptions of reaction kinetics formulated at the stochastic mesoscopic level are frequently used to study various aspects of regulation and control in models of cellular control systems. For this type of systems, numerical simulation offers a variety of challenges caused by the high dimensionality of the problem and the multiscale properties often displayed by the biochemical model.

    In this thesis I have studied several aspects of stochastic simulation of both well-stirred and spatially heterogenous systems. In the well-stirred case, a hybrid method is proposed that reduces the dimension and stiffness of a model. We also demonstrate how both a high performance implementation and a variance reduction technique based on quasi-Monte Carlo can reduce the computational cost to estimate the probability density of the system.

    In the spatially dependent case, the use of unstructured, tetrahedral meshes to sample realizations of the stochastic process is proposed. Using such meshes, we then extend the reaction-diffusion framework to incorporate active transport of cellular cargo in a seamless manner. Finally, two multilevel methods for spatial stochastic simulation are considered. One of them is a space-time adaptive method combining exact stochastic, approximate stochastic and macroscopic modeling levels to reduce the simualation cost. The other method blends together mesoscale and microscale simulation methods to locally increase modeling resolution.

    Delarbeten
    1. Hybrid method for the chemical master equation
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Hybrid method for the chemical master equation
    2007 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Physics, ISSN 0021-9991, E-ISSN 1090-2716, Vol. 227, s. 100-122Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-26755 (URN)10.1016/j.jcp.2007.07.020 (DOI)000251140100006 ()
    Tillgänglig från: 2007-10-26 Skapad: 2007-10-26 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    2. CellMC: a multiplatform model compiler for the Cell Broadband Engine and x86
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>CellMC: a multiplatform model compiler for the Cell Broadband Engine and x86
    2010 (Engelska)Ingår i: Bioinformatics, ISSN 1367-4803, E-ISSN 1367-4811, Vol. 26, s. 426-428Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Programvaruteknik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-111276 (URN)10.1093/bioinformatics/btp662 (DOI)000274342800026 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2009-12-08 Skapad: 2009-12-08 Senast uppdaterad: 2018-01-12Bibliografiskt granskad
    3. Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and quasi-Monte Carlo
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and quasi-Monte Carlo
    2008 (Engelska)Ingår i: Journal of Chemical Physics, ISSN 0021-9606, E-ISSN 1089-7690, Vol. 128, s. 154109:1-7Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-16105 (URN)10.1063/1.2897976 (DOI)000255228900011 ()
    Tillgänglig från: 2008-04-22 Skapad: 2008-04-22 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad
    4. Simulation of stochastic reaction-diffusion processes on unstructured meshes
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Simulation of stochastic reaction-diffusion processes on unstructured meshes
    2009 (Engelska)Ingår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 31, s. 1774-1797Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-97689 (URN)10.1137/080721388 (DOI)000267746200008 ()
    Tillgänglig från: 2008-11-07 Skapad: 2008-11-07 Senast uppdaterad: 2018-11-12Bibliografiskt granskad
    5. Incorporating active transport of cellular cargo in stochastic mesoscopic models of living cells
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Incorporating active transport of cellular cargo in stochastic mesoscopic models of living cells
    2010 (Engelska)Ingår i: Multiscale Modeling & simulation, ISSN 1540-3459, E-ISSN 1540-3467, Vol. 8, s. 1691-1714Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-131200 (URN)10.1137/100784709 (DOI)000285509300006 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2010-09-23 Skapad: 2010-09-27 Senast uppdaterad: 2017-12-12Bibliografiskt granskad
    6. An adaptive algorithm for simulation of stochastic reaction-diffusion processes
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>An adaptive algorithm for simulation of stochastic reaction-diffusion processes
    2010 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Physics, ISSN 0021-9991, E-ISSN 1090-2716, Vol. 229, s. 343-360Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Datavetenskap (datalogi)
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-108918 (URN)10.1016/j.jcp.2009.09.030 (DOI)000272760500008 ()
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2009-10-04 Skapad: 2009-10-04 Senast uppdaterad: 2018-01-13Bibliografiskt granskad
    7. Coupled mesoscopic and microscopic simulation of stochastic reaction-diffusion processes in mixed dimensions
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Coupled mesoscopic and microscopic simulation of stochastic reaction-diffusion processes in mixed dimensions
    2011 (Engelska)Rapport (Övrigt vetenskapligt)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2011-005
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-152228 (URN)
    Projekt
    eSSENCE
    Tillgänglig från: 2011-04-04 Skapad: 2011-04-27 Senast uppdaterad: 2011-11-18Bibliografiskt granskad
  • 299.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Numerical simulation of well stirred biochemical reaction networks governed by the master equation2008Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Numerical simulation of stochastic biochemical reaction networks has received much attention in the growing field of computational systems biology. Systems are frequently modeled as a continuous-time discrete space Markov chain, and the governing equation for the probability density of the system is the (chemical) master equation. The direct numerical solution of this equation suffers from an exponential growth in computational time and memory with the number of reacting species in the model. As a consequence, Monte Carlo simulation methods play an important role in the study of stochastic chemical networks. The stochastic simulation algorithm (SSA) due to Gillespie has been available for more than three decades, but due to the multi-scale property of the chemical systems and the slow convergence of Monte Carlo methods, much work is currently being done in order to devise more efficient approximate schemes.

    In this thesis we review recent work for the solution of the chemical master equation by direct methods, by exact Monte Carlo methods and by approximate and hybrid methods. We also describe two conceptually different numerical methods to reduce the computational time when studying models using the SSA. A hybrid method is proposed, which is based on the separation of species into two subsets based on the variance of the copy numbers. This method yields a significant speed-up when the system permits such a splitting of the state space. A different approach is taken in an algorithm that makes use of low-discrepancy sequences and the method of uniformization to reduce variance in the computed density function.

    Delarbeten
    1. Hybrid method for the chemical master equation
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Hybrid method for the chemical master equation
    2007 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Physics, ISSN 0021-9991, E-ISSN 1090-2716, Vol. 227, s. 100-122Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-26755 (URN)10.1016/j.jcp.2007.07.020 (DOI)000251140100006 ()
    Tillgänglig från: 2007-10-26 Skapad: 2007-10-26 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad
    2. Sparse grids and hybrid methods for the chemical master equation
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Sparse grids and hybrid methods for the chemical master equation
    2008 (Engelska)Ingår i: BIT Numerical Mathematics, ISSN 0006-3835, E-ISSN 1572-9125, Vol. 48, s. 265-283Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-17747 (URN)10.1007/s10543-008-0174-z (DOI)000258527500007 ()
    Tillgänglig från: 2008-08-21 Skapad: 2008-08-21 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad
    3. Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and quasi-Monte Carlo
    Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Efficient computation of transient solutions of the chemical master equation based on uniformization and quasi-Monte Carlo
    2008 (Engelska)Ingår i: Journal of Chemical Physics, ISSN 0021-9606, E-ISSN 1089-7690, Vol. 128, s. 154109:1-7Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
    Nationell ämneskategori
    Beräkningsmatematik Biokemi och molekylärbiologi
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-16105 (URN)10.1063/1.2897976 (DOI)000255228900011 ()
    Tillgänglig från: 2008-04-22 Skapad: 2008-04-22 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad
  • 300.
    Hellander, Andreas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Ferm, Lars
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Adaptive stochastic hybrid simulation of biochemical reaction-diffusion models2009Ingår i: Proc. 3rd International Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, The Systems Biology Institute , 2009, s. 4-Konferensbidrag (Refereegranskat)
3456789 251 - 300 av 762
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf