uu.seUppsala universitets publikasjoner
Endre søk
Begrens søket
1234567 51 - 100 of 315
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Treff pr side
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
  • Disputationsdatum (tidligste først)
  • Disputationsdatum (siste først)
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
  • Disputationsdatum (tidligste først)
  • Disputationsdatum (siste først)
Merk
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 51.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    On the stability of stochastic jump kinetics2012Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 52.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    On well-separated sets and fast multipole methods2011Inngår i: Applied Numerical Mathematics, ISSN 0168-9274, E-ISSN 1873-5460, Vol. 61, s. 1096-1102Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 53.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Stability and strong convergence for spatial stochastic kinetics2017Inngår i: Stochastic Processes, Multiscale Modeling, and Numerical Methods for Computational Cellular Biology, Springer, 2017, s. 109-125Kapittel i bok, del av antologi (Fagfellevurdert)
  • 54.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Stochastic simulation of pattern formation in growing tissue: A multilevel approach2019Inngår i: Bulletin of Mathematical Biology, ISSN 0092-8240, E-ISSN 1522-9602, Vol. 81, s. 3010-3023Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 55.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Strong convergence for split-step methods in stochastic jump kinetics2015Inngår i: SIAM Journal on Numerical Analysis, ISSN 0036-1429, E-ISSN 1095-7170, Vol. 53, s. 2655-2676Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 56.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Do-Quang, Minh
    Amberg, Gustav
    Tornberg, Anna-Karin
    On diffuse interface modeling and simulation of surfactants in two-phase fluid flow2013Inngår i: Communications in Computational Physics, ISSN 1815-2406, E-ISSN 1991-7120, Vol. 14, s. 879-915Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 57.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Multiscale simulation of stochastic reaction–diffusion networks2017Inngår i: Stochastic Processes, Multiscale Modeling, and Numerical Methods for Computational Cellular Biology, Springer, 2017, s. 55-79Kapittel i bok, del av antologi (Fagfellevurdert)
  • 58.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Liu, Jing
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    X-ray laser imaging of biomolecules using multiple GPUs2014Inngår i: Parallel Processing and Applied Mathematics: Part I, Berlin: Springer-Verlag , 2014, s. 480-489Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 59.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lukarski, Dimitar
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Fast Matlab compatible sparse assembly on multicore computers2016Inngår i: Parallel Computing, ISSN 0167-8191, E-ISSN 1872-7336, Vol. 56, s. 1-17Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 60.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Meinecke, Lina
    Mesoscopic modeling of random walk and reactions in crowded media2018Inngår i: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, ISSN 1539-3755, E-ISSN 1550-2376, Vol. 98, s. 033304:1-16, artikkel-id 033304Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 61.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Pender, Jamol
    Approximations for the moments of nonstationary and state dependent birth–death queues2014Inngår i: Computing Research Repository, nr 1406.6164Artikkel i tidsskrift (Annet vitenskapelig)
  • 62.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Sunkara, Vikram
    Preconditioned Metropolis sampling as a strategy to improve efficiency in posterior exploration2016Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 63.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Widgren, Stefan
    Data-driven computational disease spread modeling: from measurement to parametrization and control2017Inngår i: Disease Modelling and Public Health: Part A, Elsevier, 2017, s. 305-328Kapittel i bok, del av antologi (Fagfellevurdert)
  • 64.
    Engblom, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Wilson, Daniel B.
    Baker, Ruth E.
    Scalable population-level modelling of biological cells incorporating mechanics and kinetics in continuous time2018Inngår i: Royal Society Open Science, E-ISSN 2054-5703, Vol. 5, s. 180379:1-17, artikkel-id 180379Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 65.
    Eriksson, Robin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Widgren, Stefan
    Towards Bayesian parametrization of national scale epidemics2018Inngår i: MATHMOD 2018 Extended Abstracts, Vienna, Austria: ARGESIM Publisher , 2018, s. 65-66Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 66. Golkaram, Mahdi
    et al.
    Jang, Jiwon
    Hellander, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Kosik, Kenneth S.
    Petzold, Linda R.
    The role of chromatin density in cell population heterogeneity during stem cell differentiation2017Inngår i: Scientific Reports, ISSN 2045-2322, E-ISSN 2045-2322, Vol. 7, s. 13307:1-11, artikkel-id 13307Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 67.
    Goude, Anders
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Elektricitetslära.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    A general high order two-dimensional panel method2018Inngår i: Applied Mathematical Modelling, ISSN 0307-904X, E-ISSN 1872-8480, Vol. 60, s. 1-17Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 68.
    Goude, Anders
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Elektricitetslära.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Adaptive fast multipole methods on the GPU2013Inngår i: Journal of Supercomputing, ISSN 0920-8542, E-ISSN 1573-0484, Vol. 63, s. 897-918Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 69.
    Goude, Anders
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Elektricitetslära.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Adaptive fast multipole methods on the GPU2012Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 70.
    Grandin, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Adaptive Solvers for High-Dimensional PDE Problems on Clusters of Multicore Processors2014Doktoravhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    Accurate numerical solution of time-dependent, high-dimensional partial differential equations (PDEs) usually requires efficient numerical techniques and massive-scale parallel computing. In this thesis, we implement and evaluate discretization schemes suited for PDEs of higher dimensionality, focusing on high order of accuracy and low computational cost.

    Spatial discretization is particularly challenging in higher dimensions. The memory requirements for uniform grids quickly grow out of reach even on large-scale parallel computers. We utilize high-order discretization schemes and implement adaptive mesh refinement on structured hyperrectangular domains in order to reduce the required number of grid points and computational work. We allow for anisotropic (non-uniform) refinement by recursive bisection and show how to construct, manage and load balance such grids efficiently. In our numerical examples, we use finite difference schemes to discretize the PDEs. In the adaptive case we show how a stable discretization can be constructed using SBP-SAT operators. However, our adaptive mesh framework is general and other methods of discretization are viable.

    For integration in time, we implement exponential integrators based on the Lanczos/Arnoldi iterative schemes for eigenvalue approximations. Using adaptive time stepping and a truncated Magnus expansion, we attain high levels of accuracy in the solution at low computational cost. We further investigate alternative implementations of the Lanczos algorithm with reduced communication costs.

    As an example application problem, we have considered the time-dependent Schrödinger equation (TDSE). We present solvers and results for the solution of the TDSE on equidistant as well as adaptively refined Cartesian grids.

    Delarbeid
    1. An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers
    2010 (engelsk)Inngår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: 2009, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 417-424Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2010
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-132927 (URN)10.1007/978-3-642-11795-4_44 (DOI)000395207900044 ()978-3-642-11794-7 (ISBN)
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2010-10-29 Laget: 2010-10-29 Sist oppdatert: 2018-06-16bibliografisk kontrollert
    2. Communication-efficient algorithms for numerical quantum dynamics
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Communication-efficient algorithms for numerical quantum dynamics
    2012 (engelsk)Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing: Part II, Berlin: Springer-Verlag , 2012, s. 368-378Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2012
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 7134
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-135980 (URN)10.1007/978-3-642-28145-7_36 (DOI)000309716000036 ()978-3-642-28144-0 (ISBN)
    Konferanse
    PARA 2010: State of the Art in Scientific and Parallel Computing
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2012-02-16 Laget: 2010-12-09 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    3. Numerical evaluation of the Communication-Avoiding Lanczos algorithm
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Numerical evaluation of the Communication-Avoiding Lanczos algorithm
    2012 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2012-001
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-169257 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2012-01-22 Laget: 2012-02-25 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    4. Stable difference methods for block-oriented adaptive grids
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Stable difference methods for block-oriented adaptive grids
    2015 (engelsk)Inngår i: Journal of Scientific Computing, ISSN 0885-7474, E-ISSN 1573-7691, Vol. 65, s. 486-511Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-234977 (URN)10.1007/s10915-014-9969-z (DOI)000362911900003 ()
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2014-12-18 Laget: 2014-10-27 Sist oppdatert: 2017-12-05bibliografisk kontrollert
    5. Data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement
    2014 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2014-019
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-234980 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2014-10-30 Laget: 2014-10-27 Sist oppdatert: 2018-01-11bibliografisk kontrollert
    6. Parallel data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Parallel data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement
    2014 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2014-020
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-234981 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2014-10-31 Laget: 2014-10-27 Sist oppdatert: 2018-01-11bibliografisk kontrollert
  • 71.
    Grandin, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement2015Inngår i: Advances in Engineering Software, ISSN 0965-9978, E-ISSN 1873-5339, Vol. 82, s. 75-86Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 72.
    Grandin, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement2014Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 73.
    Grandin, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Parallel data structures and algorithms for high-dimensional structured adaptive mesh refinement2014Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 74. Grebennikov, Dmitry
    et al.
    Bouchnita, Anass
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Volpert, Vitaly
    Bessonov, Nikolay
    Meyerhans, Andreas
    Bocharov, Gennady
    Spatial lymphocyte dynamics in lymph nodes predicts the cytotoxic T cell frequency needed for HIV infection control2019Inngår i: Frontiers in Immunology, ISSN 1664-3224, E-ISSN 1664-3224, Vol. 10, artikkel-id 1213Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 75. Grelck, Clemens
    et al.
    Niewiadomska-Szynkiewicz, Ewa
    Aldinucci, Marco
    Bracciali, Andrea
    Larsson, Elisabeth
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Why high-performance modelling and simulation for big data applications matters2019Inngår i: High-Performance Modelling and Simulation for Big Data Applications, Springer, 2019, s. 1-35Kapittel i bok, del av antologi (Fagfellevurdert)
  • 76.
    Guermond, Jean-Luc
    et al.
    Texas A&M Univ, Dept Math, College Stn, TX 77843 USA.
    Nazarov, Murtazo
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Popov, Bojan
    Texas A&M Univ, Dept Math, College Stn, TX 77843 USA.
    Tomas, Ignacio
    Texas A&M Univ, Dept Math, College Stn, TX 77843 USA.
    Second-Order Invariant Domain Preserving Approximation of the Euler Equations Using Convex Limiting2018Inngår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 40, nr 5, s. A3211-A3239Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    A new second-order method for approximating the compressible Euler equations is introduced. The method preserves all the known invariant domains of the Euler system: positivity of the density, positivity of the internal energy, and the local minimum principle on the specific entropy. The technique combines a first-order, invariant domain preserving, guaranteed maximum speed method using a graph viscosity (GMS-GV1) with an invariant domain violating, but entropy consistent, high-order method. Invariant domain preserving auxiliary states, naturally produced by the GMS-GV1 method, are used to define local bounds for the high-order method, which is then made invariant domain preserving via a convex limiting process. Numerical tests confirm the second-order accuracy of the new GMS-GV2 method in the maximum norm, where the 2 stands for second-order. The proposed convex limiting is generic and can be applied to other approximation techniques and other hyperbolic systems.

  • 77. Gupta, Rohit
    et al.
    Lukarski, Dimitar
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    van Gijzen, Martin B.
    Vuik, Cornelis
    Evaluation of the deflated preconditioned CG method to solve bubbly and porous media flow problems on GPU and CPU2016Inngår i: International Journal for Numerical Methods in Fluids, ISSN 0271-2091, E-ISSN 1097-0363, Vol. 80, s. 666-683Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 78.
    Gustafsson, Magnus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Towards an adaptive solver for high-dimensional PDE problems on clusters of multicore processors2012Licentiatavhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    Accurate numerical simulation of time-dependent phenomena in many spatial dimensions is a challenging computational task apparent in a vast range of application areas, for instance quantum dynamics, financial mathematics, systems biology and plasma physics. Particularly problematic is that the number of unknowns in the governing equations (the number of grid points) grows exponentially with the number of spatial dimensions introduced, often referred to as the curse of dimensionality. This limits the range of problems that we can solve, since the computational effort and requirements on memory storage directly depend on the number of unknowns for which to solve the equations.

    In order to push the limit of tractable problems, we are developing an implementation framework, HAParaNDA, for high-dimensional PDE-problems. By using high-order accurate schemes and adaptive mesh refinement (AMR) in space, we aim at reducing the number of grid points used in the discretization, thereby enabling the solution of larger and higher-dimensional problems. Within the framework, we use structured grids for spatial discretization and a block-decomposition of the spatial domain for parallelization and load balancing. For integration in time, we use exponential integration, although the framework allows the flexibility of other integrators to be implemented as well. Exponential integrators using the Lanzcos or the Arnoldi algorithm has proven a succesful and efficient approach for large problems. Using a truncation of the Magnus expansion, we can attain high levels of accuracy in the solution.

    As an example application, we have implemented a solver for the time-dependent Schrödinger equation using this framework. We provide scaling results for small and medium sized clusters of multicore nodes, and show that the solver fulfills the expected rate of convergence.

    Delarbeid
    1. An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers
    2010 (engelsk)Inngår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: 2009, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 417-424Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2010
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-132927 (URN)10.1007/978-3-642-11795-4_44 (DOI)000395207900044 ()978-3-642-11794-7 (ISBN)
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2010-10-29 Laget: 2010-10-29 Sist oppdatert: 2018-06-16bibliografisk kontrollert
    2. Communication-efficient algorithms for numerical quantum dynamics
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Communication-efficient algorithms for numerical quantum dynamics
    2012 (engelsk)Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing: Part II, Berlin: Springer-Verlag , 2012, s. 368-378Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2012
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 7134
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-135980 (URN)10.1007/978-3-642-28145-7_36 (DOI)000309716000036 ()978-3-642-28144-0 (ISBN)
    Konferanse
    PARA 2010: State of the Art in Scientific and Parallel Computing
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2012-02-16 Laget: 2010-12-09 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    3. Stable difference methods for block-structured adaptive grids
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Stable difference methods for block-structured adaptive grids
    2011 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2011-022
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-159854 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2011-10-11 Laget: 2011-10-11 Sist oppdatert: 2013-11-29bibliografisk kontrollert
    4. Numerical evaluation of the Communication-Avoiding Lanczos algorithm
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Numerical evaluation of the Communication-Avoiding Lanczos algorithm
    2012 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2012-001
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-169257 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2012-01-22 Laget: 2012-02-25 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
  • 79.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Demmel, James
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Numerical evaluation of the Communication-Avoiding Lanczos algorithm2012Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 80.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    An implementation framework for solving high-dimensional PDEs on massively parallel computers2010Inngår i: Numerical Mathematics and Advanced Applications: 2009, Berlin: Springer-Verlag , 2010, s. 417-424Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 81.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Efficient implementation of a high-dimensional PDE-solver on multicore processors2009Inngår i: Proc. 2nd Swedish Workshop on Multi-Core Computing, Uppsala, Sweden: Department of Information Technology, Uppsala University , 2009, s. 64-66Konferansepaper (Annet vitenskapelig)
  • 82.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Kormann, Katharina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Communication-efficient algorithms for numerical quantum dynamics2012Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing: Part II, Berlin: Springer-Verlag , 2012, s. 368-378Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 83.
    Gustafsson, Magnus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Nissen, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Kormann, Katharina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Stable difference methods for block-structured adaptive grids2011Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 84.
    Günther, Torsten
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för organismbiologi, Människans evolution.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    The presence and impact of reference bias on population genomic studies of prehistoric human populations2019Inngår i: PLoS Genetics, ISSN 1553-7390, E-ISSN 1553-7404, Vol. 15, nr 7, artikkel-id e1008302Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 85.
    He, Xin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Holm, Marcus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Efficiently parallel implementation of the inverse Sherman–Morrison algorithm2012Rapport (Annet vitenskapelig)
  • 86.
    He, Xin
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Holm, Marcus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Neytcheva, Maya
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Parallel implementation of the Sherman–Morrison matrix inverse algorithm2013Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing, Berlin: Springer-Verlag , 2013, s. 206-219Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 87.
    Hellander, Andreas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Klosa, Jan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lötstedt, Per
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    MacNamara, Shev
    Robustness analysis of spatiotemporal models in the presence of extrinsic fluctuations2017Inngår i: SIAM Journal on Applied Mathematics, ISSN 0036-1399, E-ISSN 1095-712X, Vol. 77, s. 1157-1183Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 88.
    Hellander, Andreas
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Lawson, Michael J.
    Drawert, Brian
    Petzold, Linda
    Local error estimates for adaptive simulation of the reaction–diffusion master equation via operator splitting2014Inngår i: Journal of Computational Physics, ISSN 0021-9991, E-ISSN 1090-2716, Vol. 266, s. 89-100Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 89.
    Hellander, Stefan
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Petzold, Linda
    University of California, Department of Computer Science.
    Mesoscopic-microscopic spatial stochastic simulation with automatic system partitioning2017Inngår i: Journal of Chemical Physics, ISSN 0021-9606, E-ISSN 1089-7690, Vol. 147, nr 23, artikkel-id 234101Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    The reaction-diffusion master equation (RDME) is a model that allows for efficient on-lattice simulation of spatially resolved stochastic chemical kinetics. Compared to off-lattice hard-sphere simulations with Brownian dynamics or Green's function reaction dynamics, the RDME can be orders of magnitude faster if the lattice spacing can be chosen coarse enough. However, strongly diffusion-controlled reactions mandate a very fine mesh resolution for acceptable accuracy. It is common that reactions in the same model differ in their degree of diffusion control and therefore require different degrees of mesh resolution. This renders mesoscopic simulation inefficient for systems with multiscale properties. Mesoscopic-microscopic hybrid methods address this problem by resolving the most challenging reactions with a microscale, off-lattice simulation. However, all methods to date require manual partitioning of a system, effectively limiting their usefulness as "black-box" simulation codes. In this paper, we propose a hybrid simulation algorithm with automatic system partitioning based on indirect a priori error estimates. We demonstrate the accuracy and efficiency of the method on models of diffusion-controlled networks in 3D.

  • 90. Hellander, Stefan
    et al.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Petzold, Linda
    Reaction rates for mesoscopic reaction-diffusion kinetics2015Inngår i: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, ISSN 1539-3755, E-ISSN 1550-2376, Vol. 91, s. 023312:1-12, artikkel-id 023312Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 91. Hickey, John M.
    et al.
    Gorjanc, Gregor
    Varshney, Rajeev K.
    Nettelblad, Carl
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Imputation of single nucleotide polymorphism genotypes in biparental, backcross, and topcross populations with a hidden Markov model2015Inngår i: Crop science, ISSN 0011-183X, E-ISSN 1435-0653, Vol. 55, s. 1934-1946Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 92.
    Holm, Marcus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Scientific computing on hybrid architectures2013Licentiatavhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    Modern computer architectures, with multicore CPUs and GPUs or other accelerators, make stronger demands than ever on writers of scientific code. As a rule of thumb, the fastest, most efficient program consists of labor-intensive code written by expert programmers for a certain application on a particular computer. This thesis deals with several algorithmic and technical approaches towards effectively satisfying the demand for high-performance parallel programming without incurring such a high cost in expert programmer time. Effective programming is accomplished by writing performance-portable code where performance-critical functionality is provided either by external software or at least a balance between maintainability/generality and efficiency.

    Delarbeid
    1. Efficiently implementing Monte Carlo electrostatics simulations on multicore accelerators
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Efficiently implementing Monte Carlo electrostatics simulations on multicore accelerators
    2012 (engelsk)Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing: Part II, Berlin: Springer-Verlag , 2012, s. 379-388Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2012
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 7134
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-135987 (URN)10.1007/978-3-642-28145-7_37 (DOI)000309716000037 ()978-3-642-28144-0 (ISBN)
    Konferanse
    PARA 2010: State of the Art in Scientific and Parallel Computing
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2012-02-16 Laget: 2010-12-09 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    2. A simple model for tuning tasks
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>A simple model for tuning tasks
    2011 (engelsk)Inngår i: Proc. 4th Swedish Workshop on Multi-Core Computing, Linköping, Sweden: Linköping University , 2011, s. 45-49Konferansepaper, Publicerat paper (Annet vitenskapelig)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Linköping, Sweden: Linköping University, 2011
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-162609 (URN)
    Konferanse
    MCC11
    Prosjekter
    UPMARCeSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2011-11-24 Laget: 2011-12-02 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    3. Parallel implementation of the Sherman–Morrison matrix inverse algorithm
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Parallel implementation of the Sherman–Morrison matrix inverse algorithm
    2013 (engelsk)Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing, Berlin: Springer-Verlag , 2013, s. 206-219Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2013
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 7782
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-198520 (URN)10.1007/978-3-642-36803-5_15 (DOI)000343867800015 ()978-3-642-36802-8 (ISBN)
    Konferanse
    PARA 2012: State of the Art in Scientific and Parallel Computing
    Prosjekter
    UPMARCeSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2013-02-18 Laget: 2013-04-17 Sist oppdatert: 2018-01-11bibliografisk kontrollert
    4. Dynamic autotuning of adaptive fast multipole methods on hybrid multicore CPU and GPU systems
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Dynamic autotuning of adaptive fast multipole methods on hybrid multicore CPU and GPU systems
    2014 (engelsk)Inngår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 36, s. C376-C399Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-200240 (URN)10.1137/130943595 (DOI)000344743800040 ()
    Prosjekter
    eSSENCEUPMARC
    Tilgjengelig fra: 2014-08-29 Laget: 2013-05-23 Sist oppdatert: 2018-11-12bibliografisk kontrollert
  • 93.
    Holm, Marcus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Engblom, Stefan
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Goude, Anders
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Tekniska sektionen, Institutionen för teknikvetenskaper, Elektricitetslära.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Dynamic autotuning of adaptive fast multipole methods on hybrid multicore CPU and GPU systems2014Inngår i: SIAM Journal on Scientific Computing, ISSN 1064-8275, E-ISSN 1095-7197, Vol. 36, s. C376-C399Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
  • 94.
    Holm, Marcus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Holmgren, Sverker
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Efficiently implementing Monte Carlo electrostatics simulations on multicore accelerators2012Inngår i: Applied Parallel and Scientific Computing: Part II, Berlin: Springer-Verlag , 2012, s. 379-388Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 95.
    Holm, Marcus
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Tillenius, Martin
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Black-Schaffer, David
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Datorteknik.
    A simple model for tuning tasks2011Inngår i: Proc. 4th Swedish Workshop on Multi-Core Computing, Linköping, Sweden: Linköping University , 2011, s. 45-49Konferansepaper (Annet vitenskapelig)
  • 96. Horuk, Christopher B.
    et al.
    Douglas, Geoffrey
    Gupta, Anand
    Krintz, Chandra
    Bales, Ben
    Bellesia, Giovanni
    Drawert, Brian
    Wolski, Rich
    Petzold, Linda
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Automatic and portable cloud deployment for scientific simulations2014Inngår i: Proc. 12th International Conference on High Performance Computing and Simulation, Piscataway, NJ: IEEE , 2014, s. 374-381Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 97.
    Höök, Lars Josef
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Numerisk analys.
    Eckerdal, Anna
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    On the bimodality in an introductory programming course: An analysis of student performance factors2015Inngår i: Proc. 3rd International Conference on Learning and Teaching in Computing and Engineering, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2015, s. 79-86Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 98. Jallow, Alieu
    et al.
    Hellander, Andreas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Toor, Salman
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för beräkningsvetenskap. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Cost-aware application development and management using CLOUD-METRIC2017Inngår i: Proc. 7th International Conference on Cloud Computing and Services Science, Setúbal, Portugal: SciTePress, 2017, s. 515-522Konferansepaper (Fagfellevurdert)
  • 99.
    Jayawardena, Mahen
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    An e-Science Approach to Genetic Analysis of Quantitative Traits2010Doktoravhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    Many important traits in plants, animals and humans are quantitative, and most such traits are generally believed to be affected by multiple genetic loci. Standard computational tools for mapping of quantitative traits (i.e. for finding Quantitative Trait Loci, QTL, in the genome) use linear regression models for relating the observed phenotypes to the genetic composition of individuals in an experimental population. Using these tools to simultaneously search for multiple QTL is computationally demanding. The main reason for this is the complex optimization landscape for the multidimensional global optimization problems that must be solved. This thesis describes parallel algorithms, implementations and tools for simultaneous mapping of several QTL. These new computational tools enable genetic analysis exploiting new classes of multidimensional statistical models, potentially resulting in interesting results in genetics.

    We first describe how the standard, brute-force algorithm for global optimization in QTL analysis is parallelized and implemented on a grid system. Then, we also present a parallelized version of the more elaborate global optimization algorithm DIRECT and show how this can be efficiently deployed and used on grid systems and other loosely-coupled architectures. The parallel DIRECT scheme is further developed to exploit both coarse-grained parallelism in grid systems or clusters as well as fine-grained, tightly-coupled parallelism in multi-core nodes. The results show that excellent speedup and performance can be archived on grid systems and clusters, even when using a tightly-coupled algorithm such as DIRECT. Finally, we provide two distinctly different front-ends for our code. One is a grid portal providing a graphical front-end suitable for novice users and standard forms of QTL analysis. The other is a prototype of an R-based grid-enabled problem solving environment. Both of these front-ends can, after some further refinement, be utilized by geneticists for performing multidimensional genetic analysis of quantitative traits on a regular basis.

    Delarbeid
    1. Using parallel computing and grid systems for genetic mapping of quantitative traits
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Using parallel computing and grid systems for genetic mapping of quantitative traits
    2007 (engelsk)Inngår i: Applied Parallel Computing: State of the Art in Scientific Computing, Berlin: Springer-Verlag , 2007, s. 627-636Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Berlin: Springer-Verlag, 2007
    Serie
    Lecture Notes in Computer Science ; 4699
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-11546 (URN)10.1007/978-3-540-75755-9_76 (DOI)000250904900076 ()978-3-540-75754-2 (ISBN)
    Tilgjengelig fra: 2007-09-26 Laget: 2007-09-26 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    2. Grid-enabling an efficient algorithm for demanding global optimization problems in genetic analysis
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Grid-enabling an efficient algorithm for demanding global optimization problems in genetic analysis
    2007 (engelsk)Inngår i: Proc. 3rd International Conference on e-Science and Grid Computing, Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2007, s. 205-212Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2007
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-12617 (URN)10.1109/E-SCIENCE.2007.40 (DOI)000253614600025 ()978-0-7695-3064-2 (ISBN)
    Tilgjengelig fra: 2008-01-08 Laget: 2008-01-08 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    3. Efficient optimization algorithms and implementations for genetic analysis of complex traits on a grid system with multicore nodes
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Efficient optimization algorithms and implementations for genetic analysis of complex traits on a grid system with multicore nodes
    2008 (engelsk)Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Trondheim, Norway: Norwegian University of Science and Technology, 2008
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-111590 (URN)
    Konferanse
    PARA 2008: State of the Art in Scientific and Parallel Computing
    Prosjekter
    UPMARC
    Tilgjengelig fra: 2010-01-12 Laget: 2009-12-17 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    4. Computational and visualization tools for genetic analysis of complex traits
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>Computational and visualization tools for genetic analysis of complex traits
    2010 (engelsk)Rapport (Annet vitenskapelig)
    Serie
    Technical report / Department of Information Technology, Uppsala University, ISSN 1404-3203 ; 2010-001
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-111593 (URN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2010-01-12 Laget: 2009-12-17 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
    5. A Grid-Enabled Problem Solving Environment for QTL Analysis in R
    Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>A Grid-Enabled Problem Solving Environment for QTL Analysis in R
    Vise andre…
    2010 (engelsk)Inngår i: Proc. 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Cary, NC: ISCA , 2010, s. 202-209Konferansepaper, Publicerat paper (Fagfellevurdert)
    sted, utgiver, år, opplag, sider
    Cary, NC: ISCA, 2010
    HSV kategori
    Identifikatorer
    urn:nbn:se:uu:diva-111594 (URN)978-1-880843-76-5 (ISBN)
    Prosjekter
    eSSENCE
    Tilgjengelig fra: 2010-01-12 Laget: 2009-12-17 Sist oppdatert: 2018-01-12bibliografisk kontrollert
  • 100.
    Jayawardena, Mahen
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för teknisk databehandling. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Tillämpad beräkningsvetenskap.
    Parallel algorithms and implementations for genetic analysis of quantitative traits2007Licentiatavhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    Many important traits in plants, animals and humans are quantitative, and most such traits are generally believed to be regulated by multiple genetic loci. Standard computational tools for analysis of quantitative traits use linear regression models for relating the observed phenotypes to the genetic composition of individuals in a population. However, using these tools to simultaneously search for multiple genetic loci is very computationally demanding. The main reason for this is the complex nature of the optimization landscape for the multidimensional global optimization problems that must be solved. This thesis describes parallel algorithms and implementation techniques for such optimization problems. The new computational tools will eventually enable genetic analysis exploiting new classes of multidimensional statistical models, potentially resulting in interesting results in genetics.

    We first describe how the algorithm used for global optimization in the standard, serial software is parallelized and implemented on a grid system. Then, we also describe a parallelized version of the more elaborate global optimization algorithm DIRECT and show how this can be deployed on grid systems and other loosely-coupled architectures. The parallel DIRECT scheme is further developed to exploit both coarse-grained parallelism in grid or clusters as well as fine-grained, tightly-coupled parallelism in multi-core nodes. The results show that excellent speedup and performance can be archived on grid systems and clusters, even when using a tightly-coupled algorithms such as DIRECT. Finally, a pilot implementation of a grid portal providing a graphical front-end for our code is implemented. After some further development, this portal can be utilized by geneticists for performing multidimensional genetic analysis of quantitative traits on a regular basis.

1234567 51 - 100 of 315
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf