uu.seUppsala universitets publikationer
Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1234567 51 - 100 av 2035
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 51.
    Alsmark, Cecilia
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
    Foster, Peter G.
    Sicheritz-Ponten, Thomas
    Nakjang, Sirintra
    Embley, T. Martin
    Hirt, Robert P.
    Patterns of prokaryotic lateral gene transfers affecting parasitic microbial eukaryotes2013Ingår i: Genome Biology, ISSN 1465-6906, E-ISSN 1474-760X, Vol. 14, nr 2, s. R19-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background: The influence of lateral gene transfer on gene origins and biology in eukaryotes is poorly understood compared with those of prokaryotes. A number of independent investigations focusing on specific genes, individual genomes, or specific functional categories from various eukaryotes have indicated that lateral gene transfer does indeed affect eukaryotic genomes. However, the lack of common methodology and criteria in these studies makes it difficult to assess the general importance and influence of lateral gene transfer on eukaryotic genome evolution. Results: We used a phylogenomic approach to systematically investigate lateral gene transfer affecting the proteomes of thirteen, mainly parasitic, microbial eukaryotes, representing four of the six eukaryotic super-groups. All of the genomes investigated have been significantly affected by prokaryote-to-eukaryote lateral gene transfers, dramatically affecting the enzymes of core pathways, particularly amino acid and sugar metabolism, but also providing new genes of potential adaptive significance in the life of parasites. A broad range of prokaryotic donors is involved in such transfers, but there is clear and significant enrichment for bacterial groups that share the same habitats, including the human microbiota, as the parasites investigated. Conclusions: Our data show that ecology and lifestyle strongly influence gene origins and opportunities for gene transfer and reveal that, although the outlines of the core eukaryotic metabolism are conserved among lineages, the genes making up those pathways can have very different origins in different eukaryotes. Thus, from the perspective of the effects of lateral gene transfer on individual gene ancestries in different lineages, eukaryotic metabolism appears to be chimeric.

  • 52.
    Alsmark, Cecilia
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
    Strese, Åke
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
    Wedén, Christina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
    Backlund, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för farmakognosi.
    Microbial diversity of Alcyonium digitatum2013Ingår i: Phytochemistry Reviews, ISSN 1568-7767, E-ISSN 1572-980X, Vol. 12, nr 3, s. 531-542Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Marine multi-cellular organisms are described as sources of many newly discovered bioactive compounds. Meanwhile, it has been demonstrated repeatedly for several natural products of reputed multicellular origin that they are, in fact, produced by endophytic unicellular organisms-such as microbial fungi or bacteria. Consequently, while studying compounds isolated from a living organism, it is essential to ensure that the sample integrity is not compromised. To test the diversity of the endobiome from Alcyonium digitatum, a cold water coral found along the Atlantic coasts of the northern hemisphere, we performed a culture dependent surveyed using a phylogenetic approach. A 1 cm(3) cube from the interior tissue of A. digitatum was excised under aseptic conditions, homogenized, spread onto agar-based growth medium plates and incubated in 22 A degrees C to promote microbial growth. Colonies were transferred to secondary medium plates, incubated, and after harvesting lysed using sterile water to release DNA. 16S and 23S rDNA regions were amplified using PCR, and sequenced for systematic evaluation using phylogenetic analysis. From this survey we identified a broad selection of bacteria, predominantly of the alpha-proteobacterial, bacteriodete, actinobacterial and firmicute lineages, demonstrating a significant biodiversity of the coral bacterial endobiome.

  • 53.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Wållberg, Helena
    Strand, Joanna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Varasteh, Zohreh
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Dunås, Finn
    Sandström, Mattias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap.
    Rosestedt, Maria
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Löfblom, John
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Ståhl, Stefan
    Selection of an optimal cysteine-containing peptide-based chelator for labeling of Affibody molecules with 188-Re2013Ingår i: European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, ISSN 1619-7070, E-ISSN 1619-7089, Vol. 40, nr Suppl. 2, s. S219-S220Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Affibody molecules constitute a class of small (7 kDa) scaffold proteins that can be engineered to have excellent tumor targeting properties. High reabsorption in kidneys complicates development of affibody molecules for radionuclide therapy. In this study, we evaluated the influence of the composition of cysteine-containing C-terminal peptide-based chelators on the biodistribution and renal retention of 188Re-labeled anti-HER2 affibody molecules. Biodistribution of affibody molecules containing GGXC or GXGC peptide chelators (where X is G, S, E or K) was compared with biodistribution of a parental affibody molecule ZHER2:2395 having a KVDC peptide chelator. All constructs retained low picomolar affinity to HER2-expressing cells after labeling. The biodistribution of all 188Re-labeled affibody molecules was in general comparable, with the main observed difference found in the uptake and retention of radioactivity in excretory organs. The 188Re-ZHER2:V2 affibody molecule with a GGGC chelator provided the lowest uptake in all organs and tissues. The renal retention of 188Re-ZHER2:V2 (3.1±0.5 %ID/g at 4 h after injection) was 55-fold lower than retention of the parental 188Re-ZHER2:2395 (172±32 %ID/g). We show that engineering of cysteine-containing peptide-based chelators can be used for significant improvement of biodistribution of 188Re-labeled scaffold proteins, particularly reduction of their uptake in excretory organs.

  • 54.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Wållberg, Helena
    Strand, Joanna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Varasteh, Zohreh
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Rosestedt, Maria
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Dunås, Finn
    Sandström, Mattias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för medicinsk strålfysik.
    Löfblom, John
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Ståhl, Stefan
    Selection of an optimal cysteine-containing peptide-based chelator for labeling of affibody molecules with 188Re2014Ingår i: European Journal of Medicinal Chemistry, ISSN 0223-5234, E-ISSN 1768-3254, Vol. 87, s. 519-528Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Affibody molecules constitute a class of small (7 kDa) scaffold proteins that can be engineered to have excellent tumor targeting properties. High reabsorption in kidneys complicates development of affibody molecules for radionuclide therapy. In this study, we evaluated the influence of the composition of cysteine-containing C-terminal peptide-based chelators on the biodistribution and renal retention of 188Re-labeled anti-HER2 affibody molecules. Biodistribution of affibody molecules containing GGXC or GXGC peptide chelators (where X is G, S, E or K) was compared with biodistribution of a parental affibody molecule ZHER2:2395 having a KVDC peptide chelator. All constructs retained low picomolar affinity to HER2-expressing cells after labeling. The biodistribution of all 188Re-labeled affibody molecules was in general comparable, with the main observed difference found in the uptake and retention of radioactivity in excretory organs. The 188Re-ZHER2:V2 affibody molecule with a GGGC chelator provided the lowest uptake in all organs and tissues. The renal retention of 188Re-ZHER2:V2 (3.1 ± 0.5 %ID/g at 4 h after injection) was 55-fold lower than retention of the parental 188Re-ZHER2:2395 (172 ± 32 %ID/g). We show that engineering of cysteine-containing peptide-based chelators can be used for significant improvement of biodistribution of 188Re-labeled scaffold proteins, particularly reduction of their uptake in excretory organs.

  • 55.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Leitao, Charles Dahlsson
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, S-10691 Stockholm, Sweden.
    Rinne, Sara S.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Theranostics.
    Vorobyeva, Anzhelika
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Atterby, Christina
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Ståhl, Stefan
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, S-10691 Stockholm, Sweden.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Löfblom, John
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, S-10691 Stockholm, Sweden.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Theranostics. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Influence of Molecular Design on the Targeting Properties of ABD-Fused Mono- and Bi-Valent Anti-HER3 Affibody Therapeutic Constructs2018Ingår i: CELLS, ISSN 2073-4409, Vol. 7, nr 10, artikel-id 164Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Overexpression of human epidermal growth factor receptor type 3 (HER3) is associated with tumour cell resistance to HER-targeted therapies. Monoclonal antibodies (mAbs) targeting HER3 are currently being investigated for treatment of various types of cancers. Cumulative evidence suggests that affibody molecules may be appropriate alternatives to mAbs. We previously reported a fusion construct (3A3) containing two HER3-targeting affibody molecules flanking an engineered albumin-binding domain (ABD 035) included for the extension of half-life in circulation. The 3A3 fusion protein (19.7 kDa) was shown to delay tumour growth in mice bearing HER3-expressing xenografts and was equipotent to the mAb seribantumab. Here, we have designed and explored a series of novel formats of anti-HER3 affibody molecules fused to the ABD in different orientations. All constructs inhibited heregulin-induced phosphorylation in HER3-expressing BxPC-3 and DU-145 cell lines. Biodistribution studies demonstrated extended the half-life of all ABD-fused constructs, although at different levels. The capacity of our ABD-fused proteins to accumulate in HER3-expressing tumours was demonstrated in nude mice bearing BxPC-3 xenografts. Formats where the ABD was located on the C-terminus of affibody binding domains (3A, 33A, and 3A3) provided the best tumour targeting properties in vivo. Further development of these promising candidates for treatment of HER3-overexpressing tumours is therefore justified.

  • 56.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Liu, H.
    KTH, Div Prot Technol, Stockholm, Sweden..
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för Molekylär Avbildning.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Gräslund, T.
    KTH, Div Prot Technol, Stockholm, Sweden..
    Improving of molecular design of a novel Affibody-fused HER2-recognising anticancer toxin using radionuclide-based techniques2016Ingår i: European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, ISSN 1619-7070, E-ISSN 1619-7089, Vol. 43, s. S178-S178Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 57.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Liu, Hao
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Roslagstullsbacken 21, S-11417 Stockholm, Sweden.
    Ding, Haozhong
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Roslagstullsbacken 21, S-11417 Stockholm, Sweden.
    Mitran, Bogdan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Theranostics.
    Edqvist, Per-Henrik D
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Experimentell och klinisk onkologi.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Gräslund, Torbjorn
    KTH Royal Inst Technol, Dept Prot Sci, Roslagstullsbacken 21, S-11417 Stockholm, Sweden.
    Affibody-derived drug conjugates: Potent cytotoxic molecules for treatment of HER2 over-expressing tumors2018Ingår i: Journal of Controlled Release, ISSN 0168-3659, E-ISSN 1873-4995, Vol. 288, s. 84-95Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Patients with HER2-positive tumors often suffer resistance to therapy, warranting development of novel treatment modalities. Affibody molecules are small affinity proteins which can be engineered to bind to desired targets. They have in recent years been found to allow precise targeting of cancer specific molecular signatures such as the HER2 receptor. In this study, we have investigated the potential of an affibody molecule targeting HER2, Z(HER2:2891), conjugated with the cytotoxic maytansine derivate MC-DM1, for targeted cancer therapy. Z(HER2:2891) was expressed as a monomer (Z(HER2:2891)), dimer ((Z(HER2:2891)) 2) and dimer with an albumin binding domain (ABD) for half-life extension ((Z(HER2:2891)) 2-ABD). All proteins had a unique C-terminal cysteine that could be used for efficient and site-specific conjugation with MC-DM1. The resulting affibody drug conjugates were potent cytotoxic molecules for human cells over-expressing HER2, with sub-nanomolar IC50-values similar to trastuzumab emtansine, and did not affect cells with low HER2 expression. A biodistribution study of a radiolabeled version of (Z(HER2:2891))(2)-ABD-MC-DM1, showed that it was taken up by the tumor. The major site of off-target uptake was the kidneys and to some extent the liver. (Z(HER2:2891)) 2-ABD-MC-DM1 was found to have a half-life in circulation of 14 h. The compound was tolerated well by mice at 8.5 mg/kg and was shown to extend survival of mice bearing HER2 over-expressing tumors. The findings in this study show that affibody molecules are a promising class of engineered affinity proteins to specifically deliver small molecular drugs to cancer cells and that such conjugates are potential candidates for clinical evaluation on HER2-overexpressing cancers.

  • 58.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Liu, Hao
    KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Prot Technol, SE-10691 Stockholm, Sweden.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för Molekylär Avbildning.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Gräslund, Torbjörn
    KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Prot Technol, SE-10691 Stockholm, Sweden.
    Influence of molecular design on biodistribution and targeting properties of an Affibody-fused HER2-recognising anticancer toxin2016Ingår i: International Journal of Oncology, ISSN 1019-6439, Vol. 49, nr 3, s. 1185-1194Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Targeted delivery of toxins is a promising way to treat disseminated cancer. The use of monoclonal antibodies as targeting moiety has provided proof-of-principle for this approach. However, extravasation and tissue penetration rates of antibody-based immunotoxins are limited due to antibody bulkiness. The use of a novel class of targeting probes, Affibody molecules, provides smaller toxin-conjugated constructs, which may improve targeting. Earlier, we have demonstrated that affitoxins containing a HER2-targeting Affibody moiety and a deimmunized and truncated exotoxin A from Pseudomonas aeruginosa, PE38X8, provide highly selective toxicity to HER2-expressing cancer cells. To evaluate the influence of molecular design on targeting and biodistribution properties, a series of novel affitoxins were labelled with the residualizing radionuclide 111In. In this study, we have shown that the novel conjugates are more rapidly internalized compared with the parental affitoxin. The use of a (HE)3 purification tag instead of a hexahistidine tag enabled significant (p<0.05) reduction of the hepatic uptake of the affitoxin in a murine model. Fusion of the affitoxin with an albumin-binding domain (ABD) caused appreciable extension of the residence time in circulation and several-fold reduction of the renal uptake. The best variant, 111In-(HE)3-ZHER2-ABD-PE38X8, demonstrated receptor-specific accumulation in HER2-expressing SKOV-3 xenografts. In conclusion, a careful molecular design of scaffold protein based anticancer targeted toxins can appreciably improve their biodistribution and targeting properties.

  • 59.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Radiolabeled Probes Targeting Tyrosine-Kinase Receptors For Personalized Medicine2014Ingår i: Current pharmaceutical design, ISSN 1381-6128, E-ISSN 1873-4286, Vol. 20, nr 14, s. 2275-2292Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Receptor tyrosine kinases (RTK) are transmembrane receptors regulating cellular proliferation, differentiation, apoptosis, motility and recruitment of the vasculature. Aberrant expression and/or function of RTK have been detected in many malignant tumors and are considered to be a part of the transformed phenotype. The action of several classes of anti-cancer drugs is based on specific recognition of RTK. Monoclonal antibodies target extracellular binding domains, while tyrosine kinase inhibitors (TKI) bind to intracellular kinase domains to suppress RTK signaling. The issues regarding the efficient use of RTK targeting are the inter- and intra-patient heterogeneity of RTK expression and the changes of expression levels during the course of disease and in response to therapy. Radionuclide molecular imaging of RTK expression may aid in selecting patients who would benefit from RTK-targeting therapy and in identifying non-responders. Therefore, the therapy would be more personalized. Currently, radiolabeled proteins (monoclonal antibodies and their fragments, natural peptides ligands to RTK and de novo selected affinity proteins) and TKI and their analogues are under development for the visualization of RTK. In this review, we discuss the advantages and disadvantages of these approaches.

  • 60.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Perols, Anna
    Eriksson Karlström, Amelie
    Sandström, Mattias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Avdelningen för sjukhusfysik.
    Boschetti, Frederic
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Preclinical evaluation of anti-HER2 Affibody molecules site-specifically labeled with 111In using a maleimido derivative of NODAGA2012Ingår i: Nuclear Medicine and Biology, ISSN 0969-8051, E-ISSN 1872-9614, Vol. 39, nr 4, s. 518-529Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Introduction

    Affibody molecules have demonstrated potential for radionuclide molecular imaging. The aim of this study was to synthesize and evaluate a maleimido derivative of the 1,4,7-triazacyclononane-1-glutaric acid-4,7-diacetic acid (NODAGA) for site-specific labeling of anti-HER2 Affibody molecule.

    Methods

    The maleimidoethylmonoamide NODAGA (MMA-NODAGA) was synthesized and conjugated to ZHER2:2395 Affibody molecule having a C-terminal cysteine. Labeling efficiency, binding specificity to and cell internalization by HER2-expressing cells of [111In-MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 were studied. Biodistribution of [111In-MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 and [111In-MMA-DOTA-Cys61]-ZHER2:2395 was compared in mice.

    Results

    The affinity of [MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 binding to HER2 was 67 pM. The 111In-labeling yield was 99.6%±0.5% after 30 min at 60°C. [111In-MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 bound specifically to HER2-expressing cells in vitro and in vivo. Tumor uptake of [111In-MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 in mice bearing DU-145 xenografts (4.7%±0.8% ID/g) was lower than uptake of [111In-MMA-DOTA-Cys61]-ZHER2:2395 (7.5%±1.6% ID/g). However, tumor-to-organ ratios were higher for [111In-MMA-NODAGA-Cys61]-ZHER2:2395 due to higher clearance rate from normal tissues.

    Conclusions

    MMA-NODAGA is a promising chelator for site-specific labeling of targeting proteins containing unpaired cysteine. Appreciable influence of chelators on targeting properties of Affibody molecules was demonstrated.

  • 61.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Perols, Anna
    Tsourma, Maria
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Mitran, Bogdan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Robillard, Marc
    Rossin, Raffaella
    Ten Hoeve, Wolter
    Lubberink, Mark
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Radiologi.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Eriksson Karlström, Amelie
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Feasibility of affibody-based bioorthogonal chemistry-mediated radionuclide pretargeting2016Ingår i: Journal of Nuclear Medicine, ISSN 0161-5505, E-ISSN 1535-5667, Vol. 57, nr 3, s. 431-436Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Affibody molecules constitute a new class of probes for radionuclide tumor targeting. The small size of affibody molecules is favorable for rapid localization in tumors and clearance from circulation. However, high renal re-absorption of affibody molecules prevents the use of residualizing radiometals, including a number of promising low energy beta- and alpha-emitters, for radionuclide therapy. We tested a hypothesis that affibody-based pretargeting mediated by a bioorthogonal interaction between trans-cyclooctene (TCO) and tetrazine would provide higher accumulation of radiometals in tumor xenografts than in the kidneys.

    Methods:

    TCO was conjugated to the anti-HER2 affibody molecule Z2395. DOTA-tetrazine was labeled with indium-111 and lutetium-177. In vitro pretargeting was studied in HER2-expressing SKOV-3 and BT474 cell lines. In vivo studies were performed on BALB/C nu/nu mice bearing SKOV-3 xenografts.

    Results:

    125I-Z2395-TCO bound specifically to HER2-expressing cells in vitro with an affinity of 45±16 pM. 111In-tetrazine bound specifically and selectively to Z2395-TCO pre-treated cells. In vivo studies demonstrated HER2-specific 125I-Z2395-TCO accumulation in xenografts. TCO-mediated 111In-tetrazine localization was shown in tumors, when the radiolabeled tracer was injected 4 h after an injection of Z2395-TCO. At 1 h post injection, the tumor uptake of 111In-tetrazine and 177Lu-tetrazine was ca. 2-fold higher than the renal uptake. Pretargeting provided more than a 56-fold reduction of renal uptake of 111In in comparison with direct targeting.

    Conclusion:

    The feasibility of affibody-based bioorthogonal chemistry-mediated pretargeting was demonstrated. The use of pretargeting provides a substantial reduction of radiometal accumulation in kidneys, creating preconditions for palliative radionuclide therapy.

  • 62.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Strand, Joanna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Rosik, D.
    Selvaraju, Ram Kumar
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Karlstrom, A. Eriksson
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Comparative evaluation of anti-HER2 affibody molecules labeled with 68Ga and 111In using maleimido derivatives of DOTA and NODAGA2012Ingår i: European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, ISSN 1619-7070, E-ISSN 1619-7089, Vol. 39, nr S2, s. S299-S299Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 63.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Strand, Joanna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Rosik, Daniel
    Selvaraju, Ram Kumar
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Eriksson Karlström, Amelie
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Influence of Nuclides and Chelators on Imaging Using Affibody Molecules: Comparative Evaluation of Recombinant Affibody Molecules Site-Specifically Labeled with 68Ga and 111In via Maleimido Derivatives of DOTA and NODAGA2013Ingår i: Bioconjugate chemistry, ISSN 1043-1802, E-ISSN 1520-4812, Vol. 24, nr 6, s. 1102-1109Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Accurate detection of cancer-associated molecular abnormalities in tumors could make cancer treatment more personalized. Affibody molecules enable high contrast imaging of tumor-associated protein expression shortly after injection. The use of the generator-produced positron-emitting radionuclide 68Ga should increase sensitivity of HER2 imaging. The chemical nature of radionuclides and chelators influences the biodistribution of Affibody molecules, providing an opportunity to further increase the imaging contrast. The aim of the study was to compare maleimido derivatives of DOTA and NODAGA for site-specific labeling of a recombinant ZHER2:2395 HER2-binding Affibody molecule with 68Ga. DOTA and NODAGA were site-specifically conjugated to the ZHER2:2395 Affibody molecule having a C-terminal cysteine and labeled with 68Ga and 111In. All labeled conjugates retained specificity to HER2 in vitro. Most of the cell-associated activity was membrane-bound with a minor difference in internalization rate. All variants demonstrated specific targeting of xenografts and a high tumor uptake. The xenografts were clearly visualized using all conjugates. The influence of chelator on the biodistribution and targeting properties was much less pronounced for 68Ga than for 111In. The tumor uptake of 68Ga-NODAGA-ZHER2:2395 and 68Ga-DOTA-ZHER2:2395 and tumor-to-blood ratios at 2 h p.i. did not differ significantly. However, the tumor-to-liver ratio was significantly higher for 68Ga-NODAGA- ZHER2:2395 (8 ± 2 vs 5.0 ± 0.3) offering the advantage of better liver metastases visualization. In conclusion, influence of chelators on biodistribution of Affibody molecules depends on the radionuclides and reoptimization of labeling chemistry is required when a radionuclide label is changed.

  • 64.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Tsourma, M.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi. Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden..
    Mitran, Bogdan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET. Preclin PET Platform, Uppsala, Sweden..
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap. Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden..
    Perols, A.
    KTH, Div Prot Technol, Stockholm, Sweden..
    Robillard, M.
    Tagworks Pharmaceut, Eindhoven, Netherlands..
    Rossin, R.
    Tagworks Pharmaceut, Eindhoven, Netherlands..
    ten Hoeve, W.
    Syncom BV, Groningen, Netherlands..
    Sandström, Mattias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper, Radiologi.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Karlstrom, A. Eriksson
    KTH, Div Prot Technol, Stockholm, Sweden..
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Affibody-based bioorthogonal chemistry-mediated radionuclide pretargeting: proof-of-principle2015Ingår i: European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, ISSN 1619-7070, E-ISSN 1619-7089, Vol. 42, nr S1, s. S246-S246Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 65.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Varasteh, Zohreh
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Andersson, Karl
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Eek, Annemarie
    Boerman, Otto
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för nuklearmedicin och PET.
    In Vivo and In Vitro Studies on Renal Uptake of Radiolabeled Affibody Molecules for Imaging of HER2 Expression in Tumors2013Ingår i: Cancer Biotherapy and Radiopharmaceuticals, ISSN 1084-9785, E-ISSN 1557-8852, Vol. 28, nr 3, s. 187-195Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Affibody molecules (6-7 kDa) are a new class of small robust three-helical scaffold proteins. Radiolabeled subnanomolar anti-HER2 affibody Z(HER2:342) was developed for imaging of HER2 expression in tumors, and a clinical study has demonstrated that the In-111- and Ga-68-labeled affibody molecules can efficiently detect HER2 expressing metastases in breast cancer patients. However, a significant renal accumulation of radioactivity after systemic injection of a radiolabeled anti-HER2 affibody conjugate is observed. The aim of this study was to investigate the mechanism of renal reabsorption of anti-HER2 affibody at the molecular level. Renal accumulation of radiolabeled anti-HER2 affibody molecules was studied in a murine model and in vitro using opossum-derived proximal tubule (OK) cells. It was found that kidney reabsorption of affibody molecule was not driven by megalin/cubilin. Amino acids in the target-binding side of affibody molecule were involved in binding to OK cells. On OK cells, two types of receptors for anti-HER2 affibody molecule were found: K-D1 = 0.8 nM, B-max1 = 71,500 and K-D2 = 9.2 nM, B-max2 = 367,000. The results of the present study indicate that affibody molecule and other scaffold-based targeting proteins with a relatively low kidney uptake can be selected using in vitro studies with tubular kidney cells.

  • 66.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Westerlund, Kristina
    KTH Royal Inst Technol, Div Prot Technol, Sch Biotechnol, Stockholm, Sweden..
    Velletta, Justin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi.
    Mitran, Bogdan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk strålningsvetenskap.
    Eriksson Karlström, Amelie
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi.
    Evaluation of affibody molecule-based PNA-mediated radionuclide pretargeting: Development of an optimized conjugation protocol and 177Lu labeling2017Ingår i: Nuclear Medicine and Biology, ISSN 0969-8051, E-ISSN 1872-9614, Vol. 54, s. 1-9Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Introduction: We have previously developed a pretargeting approach for affibody-mediated cancer therapy based on PNA-PNA hybridization. In this article we have further developed this approach by optimizing the production of the primary agent, Z(HER2.342)-SR-HP1, and labeling the secondary agent, HP2, with the therapeutic radionuclide Lu-177. We also studied the biodistribution profile of Lu-177-HP2 in mice, and evaluated pretargeting with Lu-177-HP2 in vitro and in vivo.

    Methods: The biodistribution profile of Lu-177-HP2 was evaluated in NMRI mice and compared to the previously studied In-111-HP2. Pretargeting using Lu-177-HP2 was studied in vitro using the HER2-expressing cell lines BT-474 and SKOV-3, and in vivo in mice bearing SKOV-3 xenografts.

    Results and conclusion: Using an optimized production protocol for Z(HER2:342)-SR-HP1 the ligation time was reduced from 15 h to 30 min, and the yield increased from 45% to 70%. Lu-177-labeled HP2 binds specifically in vitro to BT474 and SKOV-3 cells pre-treated with Z(HER2:342)-SR-HP1.Lu-177-HP2 was shown to have a more rapid blood clearance compared to In-111-HP2 in NMRI mice, and the measured radioactivity in blood was 0.22 +/- 0.1 and 0.68 +/- 0.07%ID/g for Lu-177- and In-111-HP2, respectively, at 1 h p.i. In contrast, no significant difference in kidney uptake was observed (4.47 +/- 1.17 and 3.94 +/- 0.58%ID/g for Lu-177- and In-111-HP2, respectively, at I h p.i.). Co-injection with either Gelofusine or lysine significantly reduced the kidney uptake for Lu-177-HP2 (1.0 +/- 0.1 and 1.6 +/- 0.2, respectively, vs. 2.97 +/- 0.87%ID/g in controls at 4 h p.i.). Lu-177-HP2 accumulated in SKOV-3 xenografts in BALB/C nu/nu mice when administered after injection of Z(HER2:342)-SR-HP1. Without pre-injection of Z(HER2:342)-SR-HP1, the uptake of Lu-177-HP2 was about 90-fold lower in tumor (0.23 +/- 0.08 vs. 20.7 +/- 3.5%ID/g). The tumor-to-kidney radioactivity accumulation ratio was almost 5-fold higher in the group of mice pre-injected with Z(HER2:342)-SR-HP1. In conclusion, (177)LuHP2 was shown to be a promising secondary agent for affibody-mediated tumor pretargeting in vivo.

  • 67.
    Altai, Mohamed
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Wållberg, Helena
    Honarvar, Hadis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Strand, Joanna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    Orlova, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Varasteh, Zohreh
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Plattformen för preklinisk PET.
    Sandström, Mattias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för medicinsk strålfysik. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för nuklearmedicin och PET.
    Löfblom, John
    Larsson, Erik
    Strand, Sven-Erik
    Lubberink, Mark
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för nuklearmedicin och PET. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Avdelningen för sjukhusfysik.
    Ståhl, Stefan
    Tolmachev, Vladimir
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för radiologi, onkologi och strålningsvetenskap, Enheten för biomedicinsk strålningsvetenskap.
    188Re-ZHER2:V2, a promising affibody-based targeting agent against HER2-expressing tumors: preclinical assessment2014Ingår i: Journal of Nuclear Medicine, ISSN 0161-5505, E-ISSN 1535-5667, Vol. 55, nr 11, s. 1842-1848Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Affibody molecules are small (7 kDa) nonimmunoglobulin scaffold proteins with favorable tumor-targeting properties. Studies concerning the influence of chelators on biodistribution of 99mTc-labeled Affibody molecules demonstrated that the variant with a C-terminal glycyl-glycyl-glycyl-cysteine peptide–based chelator (designated ZHER2:V2) has the best biodistribution profile in vivo and the lowest renal retention of radioactivity. The aim of this study was to evaluate 188Re-ZHER2:V2 as a potential candidate for radionuclide therapy of human epidermal growth factor receptor type 2 (HER2)–expressing tumors.

    Methods:

    ZHER2:V2 was labeled with 188Re using a gluconate-containing kit. Targeting of HER2-overexpressing SKOV-3 ovarian carcinoma xenografts in nude mice was studied for a dosimetry assessment.

    Results:

    Binding of 188Re-ZHER2:V2 to living SKOV-3 cells was demonstrated to be specific, with an affinity of 6.4 ± 0.4 pM. The biodistribution study showed a rapid blood clearance (1.4 ± 0.1 percentage injected activity per gram [%ID/g] at 1 h after injection). The tumor uptake was 14 ± 2, 12 ± 2, 5 ± 2, and 1.8 ± 0.5 %IA/g at 1, 4, 24, and 48 h after injection, respectively. The in vivo targeting of HER2-expressing xenografts was specific. Already at 4 h after injection, tumor uptake exceeded kidney uptake (2.1 ± 0.2 %IA/g). Scintillation-camera imaging showed that tumor xenografts were the only sites with prominent accumulation of radioactivity at 4 h after injection. Based on the biokinetics, a dosimetry evaluation for humans suggests that 188Re-ZHER2:V2 would provide an absorbed dose to tumor of 79 Gy without exceeding absorbed doses of 23 Gy to kidneys and 2 Gy to bone marrow. This indicates that future human radiotherapy studies may be feasible.

    Conclusion:

    188Re-ZHER2:V2 can deliver high absorbed doses to tumors without exceeding kidney and bone marrow toxicity limits.

  • 68.
    Alterman, M
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Hallberg, A
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Fast microwave-assisted preparation of aryl and vinyl nitriles and the corresponding tetrazoles from organo-halides2000Ingår i: J Org Chem, Vol. 65, s. 7984-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 69.
    Alterman, Mathias
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Development of selective non-peptide angiotensin II type 2 receptor agonsists2010Ingår i: jraas. Journal of the renin-angiotensin-aldosterone system, ISSN 1470-3203, E-ISSN 1752-8976, Vol. 11, nr 1, s. 57-66Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The development of the first drug-like selective angiotensin II type 2 (AT(2)) receptor agonist (22) derived from the non-selective angiotensin II type 1 (AT(1)) receptor/AT(2) receptor agonist L-162,313 is presented. Compound 22 with a K-i value of 0.4 nM for the AT(2) receptor and a K-i > 10 mu M for the AT(1) receptor induces outgrowth of neurite cells, stimulates p42/p44(mapk), enhancesin vivo duodenal alkaline secretion in Sprague-Dawley rats and lowers the mean arterial blood pressure in anaesthetised spontaneously hypertensive rats. Thus, the peptidomimetic 22 exerts a similar biological response as the endogenous peptide angiotensin II after selective activation of the AT(2) receptor. In addition, Compound 22 has a bioavailability of 20-30% after oral administration and a half-life estimated to four hours in the rat. Compound 22 will therefore serve as a valuable research tool enabling studies of the function of the AT(2) receptor in more detail.

  • 70.
    Alterman, Mathias
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Andersson, Hans O.
    Garg, Neeraj
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Ahlsén, Göran
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Lövgren, Seved
    Classon, Björn
    Danielson, U. Helena
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Kvarnström, Ingemar
    Vrang, Lotta
    Unge, Torsten
    Samuelsson, Bertil
    Hallberg, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Design and fast synthesis of C-terminal duplicated potent C2-symmetric P1/P1'-modified HIV-1 protease inhibitors1999Ingår i: Journal of Medicinal Chemistry, ISSN 0022-2623, E-ISSN 1520-4804, Vol. 42, nr 19, s. 3835-3844Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 71.
    Alterman, Mathias
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Björsne, Magnus
    Mühlman, Anna
    Classon, Björn
    Kvarnstrom, Ingemar
    Danielson, U. Helena
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Markgren, Per-Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Nillroth, Ulrika
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Unge, Torsten
    Hallberg, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Samuelsson, Bertil
    Design and synthesis of new potent C2-symmetric HIV-1 protease inhibitors: Use of L-mannaric acid as a peptidomimetic scaffold1998Ingår i: Journal of Medicinal Chemistry, ISSN 0022-2623, E-ISSN 1520-4804, Vol. 41, nr 20, s. 3782-3792Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 72.
    Alterman, Mathias
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Sjöbom, Hans
    Säfsten, Pär
    Markgren, Per-Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Danielson, U. Helena
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för naturvetenskaplig biokemi.
    Hämäläinen, Markku
    Löfås, Stefan
    Hultén, Johan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Classon, Björn
    Samuelsson, Bertil
    Hallberg, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    P1/P1' modified HIV protease inhibitors as tools in two new sensitive surface plasmon resonance biosensor screening assays2001Ingår i: European Journal of Pharmaceutical Sciences, ISSN 0928-0987, E-ISSN 1879-0720, Vol. 13, nr 2, s. 203-212Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The commonly used HIV-1 protease assays rely on measurements of the effect of inhibitions on the hydrolysis rate of synthetic peptides. Recently an assay based on surface plasmon resonance (SPR) was introduced. We have taken advantage of the fact that the SPR signal is proportional to the mass of the analyte interacting with the immobilised molecule and developed two new improved efficient competition assay methods. Thus, high molecular weight binders were used as amplifiers of the surface plasmon resonance signal. Linkers were attached by a Heck reaction to the para-positions of the P1/P1′ benzyloxy groups of a linear C2-symmetric C-terminal duplicated inhibitor to enable (a) biotin labelling or (b) direct immobilisation of the inhibitor to the biosensor surface matrix. The interaction properties of a series of 17 structurally diverse inhibitors was assessed and compared to previously reported data. The most sensitive assay was obtained by immobilising the enzyme and amplifying the signal with an antibody, giving a detection range between 0.1 nM and 10 μM. Immobilisation of the inhibitor resulted in a stable and durable surface but a narrower detection range (1–100 nM). The two competition assays are anticipated to be very suitable for fast screening of potential HIV inhibitors.

  • 73. Altria, KD
    et al.
    Wallberg, M
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Separation of a range of cations by nonaqueous capillary electrophoresis using indirect and direct detection1998Ingår i: J CHROMATOGRAPHY B, Vol. 714, s. 99-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 74.
    Amini, A.
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi. Analytisk Farmaceutisk kemi.
    Barclay, V.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi. Analytisk Farmaceutisk Kemi.
    Rundlöf, T.
    Jönsson, S.
    Karlsson, A.
    Arvidsson, T.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi. Analytisk Farmaceutisk Kemi.
    Determination of Ephedrine, Pseudo-Ephedrine and Caffeine in a Dietary Product by Capillary Electrophoresis2006Ingår i: Chromatographia, ISSN 0009-5893, Vol. 63, nr 3/4, s. 143-148Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    This paper reports the determination of caffeine, ephedrine and pseudo-ephedrine in a dietary product by two rapid and simple methods utilising capillary electrophoresis (CE). The solutes were extracted from the product using 0.2 M HCl and determined by CE with background electrolytes containing 7.5% highly sulfated-β-cyclodextrin (7–11 sulfate groups per β-CD molecule) at pH 2.5 and pH 7.6. Determination of ephedrine and pseudo-ephedrine was accomplished at pH 2.5 with the anode at the detection side of the capillary whereas caffeine was quantified at pH 7.6 with a normal electrophoresis polarity mode. Triethanolamine was added to the running buffer at pH 2.5 in order to reverse the electroosmotic flow (EOF) and thereby speed up the separation of ephedrine and pseudo-ephedrine.

  • 75.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Beijersten, I
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Pettersson, C
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Enantiomeric separation of local anaesthetic drugs by micellar electrokinetic capillary chromatography with taurodeoxycholate as chiral selector1996Ingår i: JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A, Vol. 737, s. 301-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 76.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Javerfalk, E
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Bastami, S
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Simultaneous separation and enantioresolution of racemic local anesthetic drugs by capillary zone electrophoresis with Tween 20 and methyl-beta-cyclodextrin as selectors, employing a double plug techn1999Ingår i: Electrophoresis, Vol. 20, s. 204-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 77.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Merclin, N
    Institutionen för farmaci.
    Bastami, S
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Determination of association constants between enantiomers of orciprenaline and methyl-beta-cyclodextrin as chiral selector by capillary zone electrophoresis using a partial filling technique1999Ingår i: ELECTROPHORESIS, Vol. 20, s. 180-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 78.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Paulsen-Sorman, U
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Dependence of chiral separations on the amount of cyclodextrins as selectors, employing the partial filling technique in capillary zone electrophoresis2000Ingår i: Chromatographia, Vol. 51, s. 226-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 79.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Paulsen-Sorman, U
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Principle and applications of the partial filling technique in capillary electrophoresis1999Ingår i: Chromatographia, Vol. 50, s. 497-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 80.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Pettersson, C
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Enantioresolution of disopyramide by capillary affinity electrokinetic chromatography with human alpha(1)-acid glycoprotein (AGP) as chiral selector applying a partial filling technique1997Ingår i: ELECTROPHORESIS, Vol. 18, s. 950-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 81.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Sorman, UP
    Lindgren, BH
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Enantioseparation of anaestethic drugs by capillary zone electrophoresis using cyclodextrin-containing background electrolytes1998Ingår i: Electrophoresis, Vol. 19, s. 731-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 82.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Evaluation of association constants between drug enantiomers and human alpha(1)-acid glycoprotein by applying a partial-filling technique in affinity capillary electrophoresis1998Ingår i: Anal. Chem., Vol. 70, s. 1425-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 83.
    Amini, A
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Wiersma, B
    Westerlund, D
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi.
    Paulsen-Sorman, U
    Determination of the enantiomeric purity of S-ropivacaine by capillary electrophoresis with methyl-beta-cyclodextrin as chiral selector using conventional and complete filling techniques1999Ingår i: Eur J Pharm Sci, Vol. 9, s. 17-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 84.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Analysis of Caffeine in Dietary Products by Multiple Injection Capillary Electrophoresis2012Ingår i: Caffeine: Chemistry, Analysis, Function and Effects / [ed] Victor R Preedy, London: Royal Society of Chemistry, 2012, s. 154-178Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
  • 85.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Analysis of somatropin by double-injection capillary-zone electrophoresis in polybrene/chondroitin sulfate a double-coated capillaries2016Ingår i: Capillary Electrophoresis of Proteins and Peptides: Methods and Protocols / [ed] Nguyet Thuy Tran, Myriam Taverna, New York: Springer-Verlag New York, 2016, s. 93-105Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Purity determination of somatropin as a recombinant protein is important to ensure its safety and quality. This is carried out by capillary zone electrophoresis in double-injection mode using polybrene/chondroitin sulfate A double-coated capillaries. Modification of the capillary wall eliminates protein-wall interactions which results in improved accuracy and precision of the determinations. In the double-injection mode two somatropin samples are analyzed within a single electrophoretic run. Prior to the second injection, the first injected plug is electrophoresed for a predetermined time period in order to adjust the inter- plug distance. Here, the principle for the separation of somatropin charge variants is described.

  • 86.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Double-injection capillary electrophoresis for the identification of analytes2014Ingår i: Electrophoresis, ISSN 0173-0835, E-ISSN 1522-2683, Vol. 35, nr 20, s. 2915-2921Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    This paper presents a new approach for identifying analytes by CE. The compound to be identified is analyzed together with the corresponding reference standard during a double injection capillary electrophoretic run. The inter-plug distance is regulated by applying an electrical field over the capillary for a predetermined time period (tPE). The migration time of an analyte being exposed to the partial electrophoresis was calculated from the partial migration time (tmig(p)) as described in this paper. The identification is based on the closeness of agreement between the calculated migration time (tmig(c)) and observed migration time (tmig) of the reference standard. The validity of the derived equations was checked by analyzing several substances such as caffeine, melamine, acetyl salicylic acid, paracetamol, ibuprofen, metoprolol, naproxen, somatropin, several insulin analogs, as well as different pharmaceutical and natural products. The migration time ratios for the identified solutes varied between 0.996 and 1.006 (i.e., 1.001 ± 0.005), indicating good agreement between the observed and calculated migration times.

  • 87.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Identification of Ɛ-Caprolactam and Melamine in Polyvinyl- Pyrrolidone Powder by Double Injection Micellar Elektrokinetic Chromatography2015Ingår i: Pharmaceutica analytica acta, ISSN 2153-2435, Vol. 6, nr 11, artikel-id 1000442Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    A double-injection micellar electrokinetic chromatography (DIMEKC) method for the identification of Ɛ- caprolactam andmelamine deliberately added to povidone (polyvinylpyrrolidone) products has been developed. The separations were performedin 89 mM phosphate buffer (pH 7.4) containing 52 mM sodium dodecyl sulfate (SDS) in fused silica capillaries with UV absorptiondetection at 200 nm. The identification relied on the agreement between the calculated migration time (t mig(c) ) of the analytes andthe migration time (t mig ) of their corresponding reference standards being analysed simultaneously within a double injection run.The migration time of the analytes was calculated from the partial migration times (t mig(p) ) as described in this paper. The migrationtime ratios (t mig(c) / t mig ) varied

  • 88.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Identification of ε-caprolactam, melamine and urea in polyvinylpyrrolidone powders by micellar electrokinetic chromatography2014Ingår i: Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, ISSN 0731-7085, E-ISSN 1873-264X, Vol. 91, s. 12-16Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    A sodium dodecyl sulfate micellar electrokinetic chromatography (SDS-MEKC) method for the simultaneous separation and identification of ɛ-caprolactam, melamine and urea deliberately added to polyvinylpyrrolidone (povidone) products has been developed. All samples to be analyzed contained paracetamol as an internal marker (IM). The optimized separations were performed in 50 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing 2% (w/v) sodium dodecyl sulfate (SDS) in fused silica capillaries with UV absorption detection at 200 nm. The method was validated with respect to repeatability and intermediate precision, selectivity and robustness with satisfactory results. The relative migration times (RMT) were found to be between 0.03% and 0.13% for intra-day precision and between 0.50% and 0.60% for inter-day precision in four days. The detection limits were determined to be 1.3 (11.5 μM), 0.4 (3.5 μM) and 41 μg/ml (0.4 mM) for ɛ-caprolactam, melamine and urea, respectively.

  • 89.
    Amini, Ahmad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Separation of somatropin charge variants by multiple-injection CZE with Polybrene/chondroitin sulfate A double-coated capillaries2013Ingår i: Journal of Separation Science, ISSN 1615-9306, E-ISSN 1615-9314, Vol. 36, nr 16, s. 2686-2690Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The performance of dynamic double-coated fused-silica capillaries with Polybrene and chondroitin sulfate A has been compared with uncoated fused-silica capillaries for the determination of recombinant human growth factor (somatropin) charge variants. The separations were carried out under the same electrophoretic conditions as described in the European Pharmacopoeia, i.e. at pH 6.0 and 30 degrees C. The coating significantly reduced the interactions between the proteins and the surface of the fused-silica capillary. The first five separations performed in a new bare fused-silica capillary were discarded because of very poor separation performance as a result of protein-surface interactions. There was an approximate twofold increase in the interday migration time precision (%RSD 6.5%) in the double-coated capillaries. The method was successfully transferred to a multiple CZE mode where two samples were analyzed in a single electrophoretic run. The average purity of somatropin certified reference standard was 98.0% (%RSD 0.3%) determined by using uncoated and coated capillaries.

  • 90.
    Amini, Ahmad
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Lodén, Henrik
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Pettersson, Curt
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Arvidsson, Torbjörn
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Principles for different modes of multiple-injection CZE2008Ingår i: Electrophoresis, ISSN 0173-0835, E-ISSN 1522-2683, Vol. 29, nr 19, s. 3952-3958Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    This paper introduces four different modes of multiple-injection CZE (MICZE). The validity of these MICZE models was evaluated by the experimental data. Prior to the application of MICZE, the electrophoretic conditions are developed in the single-injection mode by adjusting different experimental parameters such as pH, type and concentration of buffer additives and temperature. Based on the migration time difference (tmig) between the analyte and the internal standard or injection marker, one or more MICZE modes can be employed. The injection marker is added to the sample to compensate for injection-volume fluctuations. The inter-plug distance is regulated by applying an electrical field over the capillary for a short period of time between each injection. After the final injection, the separation is completed by electrophoresis for a time period corresponding to that in the single-injection mode

  • 91.
    Amini, Ahmad
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Nilsson, Elin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Quantitative analysis of polypeptide pharmaceuticals by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry2008Ingår i: Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, ISSN 0731-7085, E-ISSN 1873-264X, Vol. 46, nr 3, s. 411-417Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    An accurate method based on matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) has been developed for quantitative analysis of calcitonin and insulin in different commercially available pharmaceutical products. Tryptic peptides derived from these polypeptides were chemically modified at their C-terminal lysine-residues with 2-methoxy-4,5-dihydro-imidazole (light tagging) as standard and deuterated 2-methoxy-4,5-dihydro-imidazole (heavy tagging) as internal standard (IS). The heavy modified tryptic peptides (4D-Lys tag), differed by four atomic mass units from the corresponding light labelled counterparts (4H-Lys tag). The normalized peak areas (the ratio between the light and heavy tagged peptides) were used to construct a standard curve to determine the concentration of the analytes. The concentrations of calcitonin and insulin content of the analyzed pharmaceutical products were accurately determined, and less than 5% error was obtained between the present method and the manufacturer specified values. It was also found that the cysteine residues in CSNLSTCVLGK from tryptic calcitonin were converted to lanthionine by the loss of one sulfhydryl group during the labelling procedure.

  • 92. Amini, Ahmad
    et al.
    Rundlöf, Torgny
    Grön Rydberg, May-Britt
    Arvidsson, Torbjörn
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi. Analytisk Farmaceutisk kemi.
    Characterization of sulfated beta-cyclodextrins and determination of enantiomeric purity of (1 R,2S)-ephedrine by capillary zone electrophoresis.2004Ingår i: J Sep Sci, ISSN 1615-9306, Vol. 27, nr 13, s. 1102-8Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 93.
    Amini, Ahmad
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för analytisk farmaceutisk kemi.
    Rundlöf, Torgny
    Rönnquist, Kerstin
    Tydén, Monica
    Turunen, Taina
    Korhola, Paula
    Anette, Perolari
    A protocol for the quality assessment of illegally distributed human growth hormones with respect to identity, purity, endotoxin level and microorganism content2015Ingår i: Analytical Methods, ISSN 1759-9660, E-ISSN 1759-9679, Vol. 7, nr 20, s. 8857-8864Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Different methods based on MALDI-TOF-MS and double injection capillary zone electrophoresis (DICZE) were used for the identification and purity determination of somatropin in illegally distributed products. During the past few years, more than 200 products suspected to contain somatropin have been analysed. Some of the samples were also subjected to control microorganisms and endotoxins. The identification of somatropin was carried out by peptide mapping using trypsin as the proteolytic enzyme. A double chain peptide cross-linked via a disulfide bond was used as the signature peptide. Capillary electrophoresis in double injection mode was applied to both identification and purity determination of the samples. The identification was based on the comparison between the observed migration time of the reference standard and the calculated migration time of the analyte, being present in the second injection plug. The DICZE provides electrophoretic fingerprints of intact somatropin and the related proteins which facilitate the identification. In addition, some of these samples revealed the presence of microorganisms as well as a high level of endotoxins. Taken together, the doubtful quality of the analysed samples and the microbiological findings represent a serious threat for the consumers and public health.

  • 94.
    Amir, Mohd.
    et al.
    Jamia Millia Islamia, Ctr Interdisciplinary Res Basic Sci, New Delhi 110025, India.
    Kumar, Vijay
    Amity Univ Noida, Amity Inst Neuropsychol & Neurosci, Noida, UP, India.
    Dohare, Ravins
    Jamia Millia Islamia, Ctr Interdisciplinary Res Basic Sci, New Delhi 110025, India;King Saud Univ, Dept Pharmacogmosy, Coll Pharm, Riyadh 11451, Saudi Arabia.
    Rehman, Md. Tabish
    King Saud Univ, Dept Pharmacogmosy, Coll Pharm, Riyadh 11451, Saudi Arabia.
    Hussain, Afzal
    King Saud Univ, Dept Pharmacogmosy, Coll Pharm, Riyadh 11451, Saudi Arabia.
    Alajmi, Mohamed F.
    King Saud Univ, Dept Pharmacogmosy, Coll Pharm, Riyadh 11451, Saudi Arabia.
    El-Seedi, Hesham
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Farmakognosi.
    Hassan, Hani Mutlak A.
    King Abdulaziz Univ, King Fand Med Res Ctr, POB 80216, Jeddah 21589, Saudi Arabia;King Abdulaziz Univ, Fac Appl Med Sci, Dept Med Lab Technol, POB 80216, Jeddah 21589, Saudi Arabia.
    Islam, Asimul
    Jamia Millia Islamia, Ctr Interdisciplinary Res Basic Sci, New Delhi 110025, India.
    Ahmad, Faizan
    Jamia Millia Islamia, Ctr Interdisciplinary Res Basic Sci, New Delhi 110025, India.
    Hassan, Md. Imtaiyaz
    Jamia Millia Islamia, Ctr Interdisciplinary Res Basic Sci, New Delhi 110025, India.
    Investigating architecture and structure-function relationships in cold shock DNA-binding domain family using structural genomics-based approach2019Ingår i: International Journal of Biological Macromolecules, ISSN 0141-8130, E-ISSN 1879-0003, Vol. 133, s. 484-494Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold (OB-fold) plays a major role in the regulation of central dogma of life via binding though DNA and RNA. The OB-fold domains are diverse in nature and present in large number of proteins with verities of molecular functions. Here, we have investigated the distribution of sequence, structure and repeats of cold shock DNA-binding proteins (CSDB), a member of OB-fold, in all three kingdoms to establish functional relationships. The CSDB is consists of 30 domains with a major contribution of S1 (>110,601 sequences), S12 (>23,760 sequences), S17 (>14,833 sequences) and S28e (>1615 sequence) domains. These domains are largely found in bacteria (70-90%). The number of S1 domain repeats in eukaryota varies from 1 to 15 and are well-correlated with the protein size. The molecular function analysis suggests that a large number of repeats in the S1 domain are involved in diverse molecular functions in bacteria and eukaryotes. In-depth structure analysis of Si, S12, S17 and S28e domain-containing proteins of the OB-fold family provides a reasonable basis to understand the relationship of size and number of repeats with the corresponding molecular functions.

  • 95.
    Andaloussi, Mounir
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Henriksson, Lena M.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Wieckowska, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Lindh, Martin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Björkelid, Christofer
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Larsson, Anna M.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Suresh, Surisetti
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Iyer, Harini
    Srinivasa, Bachally R.
    Bergfors, Terese
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Unge, Torsten
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Mowbray, Sherry L.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Larhed, Mats
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Jones, T. Alwyn
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Karlén, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Design, Synthesis, and X-ray Crystallographic Studies of alpha-Aryl Substituted Fosmidomycin Analogues as Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis 1-Deoxy-D-xylulose 5-Phosphate Reductoisomerase2011Ingår i: Journal of Medicinal Chemistry, ISSN 0022-2623, E-ISSN 1520-4804, Vol. 54, nr 14, s. 4964-4976Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The natural antibiotic fosmidomycin acts via inhibition of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (DXR), an essential enzyme in the non-mevalonate pathway of isoprenoid biosynthesis. Fosmidomycin is active on Mycobacterium tuberculosis DXR (MtDXR), but it lacks antibacterial activity probably because of poor uptake. alpha-Aryl substituted fosmidomycin analogues have more favorable physicochemical properties and are also more active in inhibiting malaria parasite growth. We have solved crystal structures of MtDXR in complex with 3,4-dichlorophenyl substituted fosmidomycin analogues; these show important differences compared to our previously described forsmidomycin-DXR complex. Our best inhibitor has an IC(50) = 0.15 mu M on MtDXR but still lacked activity in a mycobacterial growth assay (MIC > 32 mu g/mL). The combined results, however, provide insights into how DXR accommodates the new inhibitors and serve as an excellent starting point for the design of other novel and more potent inhibitors, particularly against pathogens where uptake is less of a problem, such as the malaria parasite.

  • 96.
    Andaloussi, Mounir
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Lindh, Jonas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi. ORGFARM.
    Sävmarker, Jonas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Sjöberg, Per J.R.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för fysikalisk och analytisk kemi.
    Larhed, Mats
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Microwave-promoted palladium(II)-catalyzed C-P bond formation by using arylboronic acids or aryltrifluoroborates.2009Ingår i: Chemistry - A European Journal, ISSN 0947-6539, E-ISSN 1521-3765, Vol. 15, nr 47, s. 13069-13074Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The first Pd-II-catalyzed P arylation has been performed by using palladium acetate, the rigid bidentate ligand dmphen (dmphen=2,9-dimethyl-1,10-phenanthroline), and without the addition of base or acid. Couplings of arylboronic acids or aryl trifluoroborates with H-phosphonate dialkyl esters were conducted in 30 min with controlled microwave (MW) heating under non-inert conditions. Aryl phosphites were also synthesized at room temperature with atmospheric air as the sole reoxidant. The arylated phosphonates were isolated in 44-90% yields. The excellent chemoselectivity of the method was illustrated in the synthesis of a Mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase (MTB-GS) inhibitor. Online ESIMS was used to detect cationic palladium species in ongoing reactions directly, and a catalytic cycle has been proposed based on these results.

  • 97.
    Andaloussi, Mounir
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Lindh, Martin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Björkelid, Christofer
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Struktur- och molekylärbiologi.
    Suresh, Surisetti
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Wieckowska, Anna
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Iyer, Harini
    Karlén, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Larhed, Mats
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Farmaceutiska fakulteten, Institutionen för läkemedelskemi, Avdelningen för organisk farmaceutisk kemi.
    Substitution of the phosphonic acid and hydroxamic acid functionalities of the DXR inhibitor FR900098: An attempt to improve the activity against Mycobacterium tuberculosis2011Ingår i: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, ISSN 0960-894X, E-ISSN 1090-2120, Vol. 21, nr 18, s. 5403-5407Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]