Logo: to the web site of Uppsala University

uu.sePublications from Uppsala University
EnglishSvenskaNorsk
Change search
ExportLink to record
Permanent link

Direct link
BETA

Project

Project type/Form of grant
Project grant
Title [sv]
Förbättringar i strukturell och kvantitativ lipidomik med applikationer inom levercancer
Title [en]
Improvements in Structural and Quantitative Lipidomics with Applications to Liver Cancer
Abstract [sv]
Analytisk kemi är vetenskapen om hur man bestämmer vilka ämnen som ett visst prov innehåller och hur mycket av dessa ämnen som finns närvarande. Denna vetenskap är helt central för många andra discipliner som är helt beroende av kemiska mätningar, t.ex. medicinska vetenskaper. Fetter, s.k. lipider, har många olika funktioner i kroppen. För att kunna förstå hur olika sjukdomar uppkommer och hur de kan behandlas, så är det viktigt att kunna mäta hur olika lipider påverkas i kroppen. Detta kan göras genom en gren inom den analytiska kemin som kallas för lipidomik, som innebär att man samtidigt försöker analysera alla lipider i ett biologiskt prov. Detta utförs vanligtvis med en teknik som kallas vätskekromatografi-masspektrometri (LC-MS). Det finns dock ett antal analytiska svårigheter som gör att det med dagens tekniker dock inte är möjligt att analysera alla lipider samtidigt. Detta projekt syftar till att utveckla den analytiska kemin genom att lösa ett antal av dessa problem för att få betydligt mer detaljerad information om hur de olika lipiderna påverkas vid sjukdom och behandling. Vi kommer här bl.a. förbättra och tillämpa kemiska separationsmetoder och statistiska metoder och modeller för att dra slutsatser ur mätdata. Vi kommer sedan att tillämpa våra nyvunna analytiska verktyg på olika modeller av levercancer av typen hepatocellulärt carcinom, t.ex. cellodlingar och möss. Denna sjukdom är en av de vanligaste och mest dödliga cancerformerna i världen. Oftast är det bara behandling med cellgifter som står till buds. Genom att vi med utvecklingen inom detta projekt kan erhålla förbättrad biokemisk information om sjukdomen och cellgifternas verkningsmekanismer, så är målsättningen på lång sikt att kunna förbättra behandlingen och prognosen för patienterna.
Abstract [en]
A thorough analysis of the lipidome is a prerequisite for understanding of biochemical mechanisms of disease and drug effects. The most common method for this is LC-MS. However, there are a number of analytical challenges to meet in order to obtain refined biochemical information beyond the capability of today’s methods. Lipids with accessible phosphates, such as cardiolipins, yield severely distorted peaks in reversed-phase LC (RPLC) hampering their analysis. Regioisomers and enantiomers of glycerolipids co-elute in RPLC. Separate determination of these isomers would provide important information on the regulation of certain biochemical pathways. Furthermore, only relative quantifications or semi-quantifications are available today. Absolute quantifications would provide a deeper understanding of the regulation of the lipidome. We will address all these analytical challenges in this project. We will use new buffers for improved peak shapes, 2D LC-SFC for chiral separation. The regioisomerism of glycerolipids will be determined by MS fragmentation in combination with ion-mobility and chemoinformatics. In order to enable quantitative analysis, we will model the response of a number of selected standards and then predict the response of other lipids.We will apply our novel analytical tools to cellular models, organoids and murine models of hepatocellular carcinoma, to draw refined conclusions on the mechanism of anthracyclin-induced cell death.
Balgoma, David
Principal InvestigatorHedeland, Mikael
Lennernäs, Hans
Heindryckx, Femke
Bergquist, Jonas
Engskog, Mikael
Coordinating organisation
Uppsala University
Funder
Period
2024-01-01 － 2027-12-31
National Category
Analytical ChemistryPharmacology and Toxicology
Identifiers
DiVA, id: project:8991Project, id: 2023-04500_VR

Search in DiVA

Analytical ChemistryPharmacology and Toxicology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
v. 2.47.0
|
WCAG
|
Uppsala University Library
|
Ask the Library
|
Log in to DiVA
|
Search and link in DiVA